Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08251
• Subject: NM_001323625.2
• Aligned Length: 1292
• Identities: 1189
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATCACTGGTGTGTTCAGCATGCGCTTGTGGACCCCAGTGGGCGTCCTGACCTCGCTGGCGTACTGCCTGCA  74

Query   75  CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCGGCGGGTGGCCCTGGCCGAGCTGCAGGAGGCCGATGGCCAGTGTCCGGTCGACCGCAGCCTGCTGAAGT  148

Query  149  TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAAATGGTGCAGGTCGTGTTTCGACACGGGGCTCGGAGTCCTCTCAAGCCGCTCCCGCTGGAGGAGCAGGTA  222

Query  223  GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTGGAACCCCCAGCTATTAGAGGTCCCACCCCAAACTCAGTTTGATTACACAGTCACCAATCTAGCTGGTGG  296

Query  297  TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCGAAACCATATTCTCCTTACGACTCTCAATACCATGAGACCACCCTGAAGGGGGGCATGTTTGCTGGGCAGC  370

Query  371  TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGACCAAGGTGGGCATGCAGCAAATGTTTGCCTTGGGAGAGAGACTGAGGAAGAACTATGTGGAAGACATTCCC  444

Query  445  TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCTTTCACCAACCTTCAACCCACAGGAGGTCTTTATTCGTTCCACTAACATTTTTCGGAATCTGGAGTCCAC  518

Query  519  CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGTTGTTTGCTGGCTGGGCTTTTCCAGTGTCAGAAAGAAGGACCCATCATCATCCACACTGATGAAGCAGATT  592

Query  593  CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAAGTCTTGTATCCCAACTACCAAAGCTGCTGGAGCCTGAGGCAGAGAACCAGAGGCCGGAGGCAGACTGCC  666

Query  667  TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTTTACAGCCAGGAATCTCAGAGGATTTGAAAAAGGTGAAGGACAGGATGGGCATTGACAGTAGTGATAAAGT  740

Query  741  GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAACGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGACTTCTTCATCCTCCTGGACAACGTGGCTGCCGAGCAGGCACACAACCTCCCAAGCTGCCCCATGCTGAAGA  814

Query  815  GATTTGCACGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT  888
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTGCAAGGATGATCGAACAGAGAGCTGTGGACACATCCTTGTACATACTGCCCAAGGAAGACAGGGAAAGT  888

Query  889  CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCAGATGGCAGTAGGCCCATTCCTCCACATCCTAGAGAGCAACCTGCTGAAAGCCATGGACTCTGCCACTGC  962

Query  963  CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCGACAAGATCAGAAAGCTGTATCTCTATGCGGCTCATGATGTGACCTTCATACCGCTCTTAATGACCCTGG  1036

Query 1037  GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGATTTTTGACCACAAATGGCCACCGTTTGCTGTTGACCTGACCATGGAACTTTACCAGCACCTGGAATCTAAG  1110

Query 1111  GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGAAAGG----AGC----AGGTGCCGAGAGGTTGCCCTGATGGGCTC  1176
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||    |.|    ||||     |.|||||    |.|||    
Sbjct 1111  GAGTGGTTTGTGCAGCTCTATTACCACGGGAAGGTAATACCCCTGAGGT-----GGGGTTG----GGTGG----  1171

Query 1177  TGCCCGCTGGACATGTTCTTGAATGCCATGTCAGTTTATACCTTAAGCCCAGAAAAATACCACGCACTCTGCTC  1250
                   |||         |||  |.||           .|||     ||.|.|||| .||||..|| |||   
Sbjct 1172  -------TGG---------TGA--GGCA-----------CCCT-----CCTGCAAAA-CCCACCTAC-CTG---  1206

Query 1251  TCAAACTCAGGTGATGGAAGTTGGAAATGAAGAG  1284
                              |||             
Sbjct 1207  ------------------AGT-------------  1209