Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08302
• Subject: NM_001283035.1
• Aligned Length: 1008
• Identities: 917
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGGTTGCGACGGGGGAACAATCCCCAAGAGGCATGAACTGGTGAAGGGGCCGAAGAAGGTTGAGAAG-----  69
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct    1  ATGGGTTGCGACGGGGGAACAATCCCCAAGAGGCATGAACTGGTGAAGGGGCCGAAGAAGGTTGAGAAGATTTG  74

Query   70  --------------------------------------------------------------------------  69
                                                                                      
Sbjct   75  GCATTTGAAGAATGGGAAAGAGTGGTGCAGTCTACACAGTGAAGGAAAAAACAAGAACGGGAAGGAGTGGGACA  148

Query   70  -----------GTCGACAAAGATGCTGAATTAGTGGCCCAATGGAACTATTGTACTCTAAGTCAGGAAATATTA  132
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAATATGATGTCGACAAAGATGCTGAATTAGTGGCCCAATGGAACTATTGTACTCTAAGTCAGGAAATATTA  222

Query  133  AGACGACCAATAGTTGCCTGTGAACTTGGCAGACTTTATAACAAAGATGCCGTCATTGAATTTCTCTTGGACAA  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGACGACCAATAGTTGCCTGTGAACTTGGCAGACTTTATAACAAAGATGCCGTCATTGAATTTCTCTTGGACAA  296

Query  207  ATCTGCAGAAAAGGCTCTTGGGAAGGCAGCATCTCACATTAAAAGCATTAAGAATGTGACAGAGCTGAAGCTTT  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCTGCAGAAAAGGCTCTTGGGAAGGCAGCATCTCACATTAAAAGCATTAAGAATGTGACAGAGCTGAAGCTTT  370

Query  281  CTGATAATCCTGCCTGGGAAGGGGATAAAGGAAACACTAAAGGTGACAAGCACGATGACCTCCAGCGGGCGCGT  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGATAATCCTGCCTGGGAAGGGGATAAAGGAAACACTAAAGGTGACAAGCACGATGACCTCCAGCGGGCGCGT  444

Query  355  TTCATCTGCCCCGTTGTGGGCCTGGAGATGAACGGCCGACACAGGTTCTGCTTCCTTCGGTGCTGCGGCTGTGT  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCATCTGCCCCGTTGTGGGCCTGGAGATGAACGGCCGACACAGGTTCTGCTTCCTTCGGTGCTGCGGCTGTGT  518

Query  429  GTTTTCTGAGCGAGCCTTGAAAGAGATAAAAGCGGAAGTTTGCCACACGTGTGGGGCTGCCTTCCAGGAGGATG  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTTCTGAGCGAGCCTTGAAAGAGATAAAAGCGGAAGTTTGCCACACGTGTGGGGCTGCCTTCCAGGAGGATG  592

Query  503  ATGTCATCGTGCTCAATGGCACCAAGGAGGATGTGGACGTGCTGAAGACAAGGATGGAGGAGAGAAGGCTGAGA  576
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTCATCATGCTCAATGGCACCAAGGAGGATGTGGACGTGCTGAAGACAAGGATGGAGGAGAGAAGGCTGAGA  666

Query  577  GCGAAGCTGGAAAAGAAAACAAAGAAACCCAAGGCAGCAGAGTCTGTTTCAAAACCAGATGTCAGTGAAGAAGC  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCGAAGCTGGAAAAGAAAACAAAGAAACCCAAGGCAGCAGAGTCTGTTTCAAAACCAGATGTCAGTGAAGAAGC  740

Query  651  CCCAGGGCCATCAAAAGTTAAGACAGGGAAGCCTGAAGAAGCCAGCCTTGATTCTAGAGAGAAGAAAACCAACT  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAGGGCCATCAAAAGTTAAGACAGGGAAGCCTGAAGAAGCCAGCCTTGATTCTAGAGAGAAGAAAACCAACT  814

Query  725  TGGCTCCCAAAAGCACAGCAATGAATGAGAGCTCTTCTGGAAAAGCTGGGAAGCCTCCGTGTGGAGCCACAAAG  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCTCCCAAAAGCACAGCAATGAATGAGAGCTCTTCTGGAAAAGCTGGGAAGCCTCCGTGTGGAGCCACAAAG  888

Query  799  AGGTCCATCGCTGACAGTGAAGAATCGGAGGCCTACAAGTCCCTCTTTACCACTCACAGCTCCGCCAAGCGCTC  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGTCCATCGCTGACAGTGAAGAATCGGAGGCCTACAAGTCCCTCTTTACCACTCACAGCTCCGCCAAGCGCTC  962

Query  873  CAAGGAGGAGTCTGCCCACTGGGTCACCCACACGTCCTACTGCTTC  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGAGGAGTCTGCCCACTGGGTCACCCACACGTCCTACTGCTTC  1008