Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08302
• Subject: XM_017027872.1
• Aligned Length: 918
• Identities: 857
• Gaps: 57

Alignment

Query   1  ATGGGTTGCGACGGGGGAACAATCCCCAAGAGGCATGAACTGGTGAAGGGGCCGAAGAAGGTTGAGAAGGTCGA  74
                                             |||                |||.|.|       |.|||||
Sbjct   1  ----------------------------------ATG----------------GAATATG-------ATGTCGA  17

Query  75  CAAAGATGCTGAATTAGTGGCCCAATGGAACTATTGTACTCTAAGTCAGGAAATATTAAGACGACCAATAGTTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  18  CAAAGATGCTGAATTAGTGGCCCAATGGAACTATTGTACTCTAAGTCAGGAAATATTAAGACGACCAATAGTTG  91

Query 149  CCTGTGAACTTGGCAGACTTTATAACAAAGATGCCGTCATTGAATTTCTCTTGGACAAATCTGCAGAAAAGGCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  92  CCTGTGAACTTGGCAGACTTTATAACAAAGATGCCGTCATTGAATTTCTCTTGGACAAATCTGCAGAAAAGGCT  165

Query 223  CTTGGGAAGGCAGCATCTCACATTAAAAGCATTAAGAATGTGACAGAGCTGAAGCTTTCTGATAATCCTGCCTG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166  CTTGGGAAGGCAGCATCTCACATTAAAAGCATTAAGAATGTGACAGAGCTGAAGCTTTCTGATAATCCTGCCTG  239

Query 297  GGAAGGGGATAAAGGAAACACTAAAGGTGACAAGCACGATGACCTCCAGCGGGCGCGTTTCATCTGCCCCGTTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240  GGAAGGGGATAAAGGAAACACTAAAGGTGACAAGCACGATGACCTCCAGCGGGCGCGTTTCATCTGCCCCGTTG  313

Query 371  TGGGCCTGGAGATGAACGGCCGACACAGGTTCTGCTTCCTTCGGTGCTGCGGCTGTGTGTTTTCTGAGCGAGCC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314  TGGGCCTGGAGATGAACGGCCGACACAGGTTCTGCTTCCTTCGGTGCTGCGGCTGTGTGTTTTCTGAGCGAGCC  387

Query 445  TTGAAAGAGATAAAAGCGGAAGTTTGCCACACGTGTGGGGCTGCCTTCCAGGAGGATGATGTCATCGTGCTCAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 388  TTGAAAGAGATAAAAGCGGAAGTTTGCCACACGTGTGGGGCTGCCTTCCAGGAGGATGATGTCATCATGCTCAA  461

Query 519  TGGCACCAAGGAGGATGTGGACGTGCTGAAGACAAGGATGGAGGAGAGAAGGCTGAGAGCGAAGCTGGAAAAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462  TGGCACCAAGGAGGATGTGGACGTGCTGAAGACAAGGATGGAGGAGAGAAGGCTGAGAGCGAAGCTGGAAAAGA  535

Query 593  AAACAAAGAAACCCAAGGCAGCAGAGTCTGTTTCAAAACCAGATGTCAGTGAAGAAGCCCCAGGGCCATCAAAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536  AAACAAAGAAACCCAAGGCAGCAGAGTCTGTTTCAAAACCAGATGTCAGTGAAGAAGCCCCAGGGCCATCAAAA  609

Query 667  GTTAAGACAGGGAAGCCTGAAGAAGCCAGCCTTGATTCTAGAGAGAAGAAAACCAACTTGGCTCCCAAAAGCAC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610  GTTAAGACAGGGAAGCCTGAAGAAGCCAGCCTTGATTCTAGAGAGAAGAAAACCAACTTGGCTCCCAAAAGCAC  683

Query 741  AGCAATGAATGAGAGCTCTTCTGGAAAAGCTGGGAAGCCTCCGTGTGGAGCCACAAAGAGGTCCATCGCTGACA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684  AGCAATGAATGAGAGCTCTTCTGGAAAAGCTGGGAAGCCTCCGTGTGGAGCCACAAAGAGGTCCATCGCTGACA  757

Query 815  GTGAAGAATCGGAGGCCTACAAGTCCCTCTTTACCACTCACAGCTCCGCCAAGCGCTCCAAGGAGGAGTCTGCC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758  GTGAAGAATCGGAGGCCTACAAGTCCCTCTTTACCACTCACAGCTCCGCCAAGCGCTCCAAGGAGGAGTCTGCC  831

Query 889  CACTGGGTCACCCACACGTCCTACTGCTTC  918
           ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832  CACTGGGTCACCCACACGTCCTACTGCTTC  861