Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08306
• Subject: NM_001284202.1
• Aligned Length: 958
• Identities: 926
• Gaps: 26

Alignment

Query   1  ATGGGTGTCGATATTCAACCAG-------------------------CATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGA  49
           |||...|..||.|||||| |||                         |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAAGGAGAAATTCAA-CAGTCGCTTGGAGCCTGGGTTTTGCTTACATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGA  73

Query  50  CCCTATTATTTAAAAATGGCTCAACTGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAAT  123
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  74  CCCTATTATTTAAAAATGGCTCAACTGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAAT  147

Query 124  GCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCACAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAAT  197
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  GCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCACAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAAT  221

Query 198  GCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAAC  271
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  GCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAAC  295

Query 272  ACATCACTGCATTATTTGAATGCAGCATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTT  345
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296  ACATCACTGCATTATTTGAATGCAGCATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTT  369

Query 346  TATATTCGTTCATGTCGAGTATTGATGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGT  419
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  TATATTCGTTCATGTCGAGTATTGATGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGT  443

Query 420  TACCACAGTACACTGTACTCATGAAGCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCT  493
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  TACCACAGTACACTGTACTCATGAAGCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCT  517

Query 494  TGGTATTAATGATGCTGCTCCGACCTCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTT  567
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  TGGTATTAATGATGCTGCTCCGACCTCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTT  591

Query 568  AAAAGTATTTATGCTGCACTTTACTTCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATA  641
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  AAAAGTATTTATGCTGCACTTTACTTCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATA  665

Query 642  TTACGCCTTCCCATACATTATATTAGTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAG  715
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666  TTACGCCTTCCCATACATTATATTAGTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAG  739

Query 716  AGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAGAAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTAT  789
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  AGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAGAAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTAT  813

Query 790  GGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGGATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGC  863
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814  GGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGGATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGC  887

Query 864  CCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAATTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  933
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888  CCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAATTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  957