Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08372
- Subject:
- NM_001199922.1
- Aligned Length:
- 1569
- Identities:
- 1462
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 ATGGTCGCGCCGGGGCTTGTACTCGGGCTGGTGCTGCCATTAATCCTGTGGGCCGACAGAAGTGCAGGTATTGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTTTCGCTTTGCTTCATACATCAATAATGATATGGTGCTGCAGAAGGAGCCTGCTGGGGCAGTGATATGGGGCT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------ATGGTGCTGCAGAAGGAGCCTGCTGGGGCAGTGATATGGGGCT 43
Query 149 TCGGTACACCTGGAGCCACAGTGACCGTGACCCTGCGCCAAGGTCAGGAAACCATCATGAAGAAAGTGACCAGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 TCGGTACACCTGGAGCCACAGTGACCGTGACCCTGCGCCAAGGTCAGGAAACCATCATGAAGAAAGTGACCAGT 117
Query 223 GTAAAAGCTCACTCTGATACGTGGATGGTGGTACTGGATCCTATGAAGCCTGGAGGACCTTTCGAAGTGATGGC 296
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 GTGAAAGCTCACTCTGATACGTGGATGGTGGTACTGGATCCTATGAAGCCTGGAGGACCTTTCGAAGTGATGGC 191
Query 297 ACAACAGACTTTGGAGAAAATAAACTTCACCCTGAGAGTTCATGACGTCCTGTTTGGAGATGTCTGGCTCTGTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 ACAACAGACTTTGGAGAAAATAAACTTCACCCTGAGAGTTCATGACGTCCTGTTTGGAGATGTCTGGCTCTGTA 265
Query 371 GTGGGCAGAGTAACATGCAGATGACTGTGTTACAGATATTTAATGCTACAAGGGAGTTGTCTAACACTGCGGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 GTGGGCAGAGTAACATGCAGATGACTGTGTTACAGATATTTAATGCTACAAGGGAGTTGTCTAACACTGCGGCA 339
Query 445 TATCAGTCTGTCCGCATCCTCTCTGTCTCTCCCATTCAAGCAGAGCAGGAGCTGGAGGACCTTGTTGCGGTTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 TATCAGTCTGTCCGCATCCTCTCTGTCTCTCCCATTCAAGCAGAGCAGGAGCTGGAGGACCTTGTTGCGGTTGA 413
Query 519 CTTGCAGTGGTCTAAGCCCACCTCAGAAAACTTAGGCCATGGATATTTCAAGTACATGTCAGCAGTGTGCTGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CTTGCAGTGGTCTAAGCCCACCTCAGAAAACTTAGGCCATGGATATTTCAAGTACATGTCAGCAGTGTGCTGGC 487
Query 593 TCTTTGGACGTCACCTTTATGACACTCTGCAGTATCCCATCGGGCTGATCGCCTCCAGCTGGGGCGGGACACCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 TCTTTGGACGTCACCTTTATGACACTCTGCAGTATCCCATCGGGCTGATCGCCTCCAGCTGGGGCGGGACACCC 561
Query 667 ATTGAAGCCTGGTCATCTGGACGGTCACTGAAAGCCTGTGGGGTCCCTAAACAAGGGTCCATTCCATACGATTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 ATTGAAGCCTGGTCATCTGGACGGTCACTGAAAGCCTGTGGGGTCCCTAAACAAGGGTCCATTCCATACGATTC 635
Query 741 TGTAACTGGTCCCAGTAAGCACTCTGTTCTCTGGAATGCCATGATCCATCCACTGTGCAATATGACTCTGAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TGTAACTGGTCCCAGTAAGCACTCTGTTCTCTGGAATGCCATGATCCATCCACTGTGCAATATGACTCTGAAAG 709
Query 815 GGGTAGTATGGTACCAGGGGGAGTCCAATATAAATTATAACACGGATCTGTACAATTGCACATTCCCTGCACTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 GGGTAGTATGGTACCAGGGGGAGTCCAATATAAATTATAACACGGATCTGTACAATTGCACATTCCCTGCACTC 783
Query 889 ATCGAAGACTGGCGTGAAACCTTCCACCGTGGTTCCCAGGGGCAGACGGAGCGTTTCTTCCCATTTGGACTTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 ATCGAAGACTGGCGTGAAACCTTCCACCGTGGTTCCCAGGGGCAGACGGAGCGTTTCTTCCCATTTGGACTTGT 857
Query 963 CCAGTTATCTTCAGATTTGTCTAAGAAGAGCTCAGACGATGGATTTCCCCAGATCCGTTGGCATCAAACAGCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 CCAGTTATCTTCAGATTTGTCTAAGAAGAGCTCAGACGATGGATTTCCCCAGATCCGTTGGCATCAAACAGCAG 931
Query 1037 ACTTCGGCTATGTCCCCAACCCAAAGATGCCCAATACTTTCATGGCTGTAGCTATGGATCTCTGTGATAGAGAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 ACTTCGGCTATGTCCCCAACCCAAAGATGCCCAATACTTTCATGGCTGTAGCTATGGATCTCTGTGATAGAGAC 1005
Query 1111 TCGCCTTTTGGCAGCATCCACCCTCGAGATAAACAGACTGTGGCTTATCGGCTGCATTTGGGGGCCCGTGCTCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 TCGCCTTTTGGCAGCATCCACCCTCGAGATAAACAGACTGTGGCTTATCGGCTGCATTTGGGGGCCCGTGCTCT 1079
Query 1185 GGCTTATGGTGAGAAGAATTTGACCTTTGAAGGACCACTGCCTGAGAAGATAGAACTCTTGGCTCACAAGGGGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GGCTTATGGTGAGAAGAATTTGACCTTTGAAGGACCACTGCCTGAGAAGATAGAACTCTTGGCTCACAAGGGGC 1153
Query 1259 TGCTCAATCTCACATATTACCAGCAAATCCAGGTGCAGAAAAAGGACAACAAGATATTTGAGATCTCCTGTTGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 TGCTCAATCTCACATATTACCAGCAAATCCAGGTGCAGAAAAAGGACAACAAGATATTTGAGATCTCCTGTTGC 1227
Query 1333 AGTGACCATCGATGCAAGTGGCTTCCAGCTTCTATGAACACCGTCTCCACCCAGTCCCTGACCCTGGCGATCGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 AGTGACCATCGATGCAAGTGGCTTCCAGCTTCTATGAACACCGTCTCCACCCAGTCCCTGACCCTGGCGATCGA 1301
Query 1407 TTCTTGTCATGGCACTGTGGTTGCTCTCCGCTATGCTTGGACCACGTGGCCTTGTGAATATAAGCAGTGTCCCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 TTCTTGTCATGGCACTGTGGTTGCTCTCCGCTATGCTTGGACCACGTGGCCTTGTGAATATAAGCAGTGTCCCC 1375
Query 1481 TATACCACCCCAGTAGTGCCCTGCCAGCCCCTCCATTCATTGCTTTCATTACAGACCAGGGTCCTGGACATCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 TATACCACCCCAGTAGTGCCCTGCCAGCCCCTCCCTTCATTGCTTTCATTACAGACCAGGGTCCTGGACATCAG 1449
Query 1555 AGCAATGTTGCTAAA 1569
|||||||||||||||
Sbjct 1450 AGCAATGTTGCTAAA 1464