Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08386
- Subject:
- NM_001177834.1
- Aligned Length:
- 1697
- Identities:
- 1283
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ATGCAAAGTTGTGAATCCAGTGGTGACAGTGCGGATGACCCTCTCAGTCGCGGCCTACGGAGAAGGGGACAGCC 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAAAGTTGTGAATCCAGTGGCGACAGTGCGGATGACCCTCTCAGTCGTGGCCTACGGAGAAGGGGACAGCC 74
Query 75 TCGTGTGGTGGTGATCGGCGCCGGCTTGGCTGGCCTGGCTGCAGCCAAAGCACTTCTTGAGCAGGGTTTCACGG 148
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 75 TCGTGTGGTGGTGATCGGTGCTGGCTTGGCTGGCCTGGCTGCAGCTAGAGCCCTTCTGGAGCAGGGCTTCACGG 148
Query 149 ATGTCACTGTGCTTGAGGCTTCCAGCCACATCGGAGGCCGTGTGCAGAGTGTGAAACTTGGACACGCCACCTTT 222
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||.||.||||||||
Sbjct 149 ATGTCACTGTGCTTGAGGCTTCCAGCCACATTGGGGGCCGTGTGCAGAGTGTGAGGCTTGGAGACACCACCTTT 222
Query 223 GAGCTGGGAGCCACCTGGATCCATGGCTCCCATGGGAACCCTATCTATCATCTAGCAGAAGCCAACGGCCTCCT 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct 223 GAGCTGGGAGCCACCTGGATCCATGGATCCCACGGGAATCCTATCTATCAACTAGCAGAAGCCAATGGCCTTTT 296
Query 297 GGAAGAGACAACCGATGGGGAACGCAGCGTGGGCCGCATCAGCCTCTATTCCAAGAATGGCGTGGCCTGCTACC 370
||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGAGACAACAGATGGGGAGCGCAGTGTGGGCCGCATCAGCCTTTACTCCAAGAATGGCGTGGCCTGCTACC 370
Query 371 TTACCAACCACGGCCGCAGGATCCCCAAGGACGTGGTTGAGGAATTCAGCGATTTATACAACGAGGTCTATAAC 444
|||||||||..|||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTACCAACCGTGGCTGCCGCATCCCCAAGGACGTGGTTGAGGAATTCAGCGATTTATACAACGAGGTCTATAAC 444
Query 445 TTGACCCAGGAGTTCTTCCGGCACGATAAACCAGTCAATGCTGAAAGTCAAAATAGCGTGGGGGTGTTCACCCG 518
.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 ATGACCCAGGAGTTCTTCCGGCATGGTAAACCAGTCAATGCCGAGAGTCAGAACAGCGTCGGGGTGTTCACCCG 518
Query 519 AGAGGAGGTGCGTAACCGCATCAGGAATGACCCTGACGACCCAGAGGCTACCAAGCGCCTGAAGCTCGCCATGA 592
.|||.|||||||.||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGAAGGTGCGGAATCGCATCAGGGATGACCCTGACGACACAGAGGCCACCAAGCGCCTGAAGCTCGCCATGA 592
Query 593 TCCAGCAGTACCTGAAGGTGGAGAGCTGTGAGAGCAGCTCACACAGCATGGACGAGGTGTCCCTGAGCGCCTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 TCCAGCAGTACCTGAAGGTGGAGAGCTGTGAGAGCAGCTCCCACAGCATAGATGAGGTGTCCCTGAGCGCCTTT 666
Query 667 GGGGAGTGGACCGAGATCCCCGGCGCTCACCACATCATCCCCTCGGGCTTCATGCGGGTTGTGGAGCTGCTGGC 740
||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGAATGGACGGAGATCCCAGGCGCCCATCACATCATCCCCTCGGGCTTCATGCGAGTTGTGGAGCTGCTGGC 740
Query 741 GGAGGGCATCCCTGCCCACGTCATCCAGCTAGGGAAACCTGTCCGCTGCATTCACTGGGACCAGGCCTCAGCCC 814
.||||||||.|||.|.||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 741 TGAGGGCATTCCTCCACATGTCATCCAGTTGGGGAAGCCGGTCCGTTGCATCCACTGGGACCAGGCCTCGGCTC 814
Query 815 GCCCCAGAGGCCCTGAGATTGAGCCCCG---------------------------------------------- 842
.||||.|.||.||||||||.||||||||
Sbjct 815 ACCCCCGGGGTCCTGAGATCGAGCCCCGTGGTGAGGGTGATCACAATCACGACACTGGGGAGGGTGGCCAGAGT 888
Query 843 -------------------------------------------------------------------------- 842
Sbjct 889 GGAGAGAATCCGCAGCAGGGGAGGTGGGACGAGGATGAGCCGTGGCCTGTAGTCGTGGAGTGCGAGGATTGCGA 962
Query 843 ---------------------------------------GGGTGTGCTAAAGAGGCAGTACACCAGTTTCTTCC 877
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||..
Sbjct 963 GGTGATCCCAGCGGACCACGTGATTGTGACCGTTTCGCTGGGCGTGCTCAAGAGGCAGTACACCAGTTTCTTTA 1036
Query 878 GGCCAGGCCTGCCCACAGAGAAGGTGGCTGCCATCCACCGCCTGGGCATTGGCACCACCGACAAGATCTTTCTG 951
|||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1037 GGCCATGCCTGCCCACGGAGAAGGTGGCCGCCATCCACCGCCTGGGCATTGGTACCACTGACAAGATCTTCCTT 1110
Query 952 GAATTCGAGGAGCCCTTCTGGGGCCCTGAGTGCAACAGCCTACAGTTTGTGTGGGAGGACGAAGCGGAGAGCCA 1025
|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||..
Sbjct 1111 GAATTTGAGGAGCCCTTTTGGGGCCCCGAGTGCAACAGCCTGCAGTTCGTGTGGGAGGATGAGGCAGAGAGCTG 1184
Query 1026 CACCCTCACCTACCCACCTGAGCTCTGGTACCGCAAGATCTGCGGCTTTGATGTCCTCTACCCGCCTGAGCGCT 1099
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 TACCCTCACCTACCCACCTGAGCTCTGGTACCGCAAGATCTGTGGCTTCGATGTCCTTTATCCGCCAGAGCGCT 1258
Query 1100 ACGGCCATGTGCTGAGCGGCTGGATCTGCGGGGAGGAGGCCCTCGTCATGGAGAAGTGTGATGACGAGGCAGTG 1173
|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||.|||||||||||.||.
Sbjct 1259 ATGGCCATGTGCTGAGTGGCTGGATCTGTGGGGAGGAGGCTCTTGTCATGGAGAGGTGCGATGACGAGGCTGTA 1332
Query 1174 GCCGAGATCTGCACGGAGATGCTGCGTCAGTTCACAGGGAACCCCAACATTCCAAAACCTCGGCGAATCTTGCG 1247
||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1333 GCTGAGATCTGCACAGAGATGCTTCGACAGTTCA---------------------------------------- 1366
Query 1248 CTCGGCCTGGGGCAGCAACCCTTACTTCCGCGGCTCCTATTCATACACGCAGGTGGGCTCCAGCGGGGCGGATG 1321
|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1367 -------------------------------------------------CAGGTGGGCTCAAGTGGGGCGGATG 1391
Query 1322 TGGAGAAGCTGGCCAAGCCCCTGCCGTACACGGAGAGCTCAAAGACAGCGCCCATGCAGGTGCTGTTTTCCGGT 1395
||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1392 TGGAGAAGCTAGCCAAGCCCCTGCCCTACACAGAGAGCTCCAAGACAGCGCCCATGCAGGTGCTCTTCTCCGGG 1465
Query 1396 GAGGCCACCCACCGCAAGTACTATTCCACCACCCACGGTGCTCTGCTGTCCGGCCAGCGTGAGGCTGCCCGCCT 1469
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1466 GAGGCCACACACCGCAAGTACTACTCCACCACCCACGGTGCTCTGCTCTCTGGCCAGCGCGAGGCCGCCCGGCT 1539
Query 1470 CATTGAGATGTACCGAGACCTCTTCCAGCAGGGGACC-------------------------------- 1506
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1540 CATCGAGATGTACCGAGACCTCTTCCAGCAGGGGCCCTGAAAGGTGTCCTCACTGCCAAATGTGTTCCT 1608