Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08408
• Subject: NM_020267.2
• Aligned Length: 1043
• Identities: 919
• Gaps: 19

Alignment

Query    1  ATGGCCTCTGGAGTGGGCGCGGCCTTCGAGGAACTGCCTCACGACGGCACGTGTGACGAGTGCGAGCCCGACGA  74
            ||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCCGGAGTGGGCGCGGCCTGCGAGGAGCTGCCTCCCGACGGCACGTGTGACGAGTGCGAACCCGACGA  74

Query   75  GGCTCCGGGGGCCGAGGAAGTGTGCCGAGAATGCGGCTTCTGCTACTGCCGCCGCCATGCCGAGGCGCACAGGC  148
            |||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|.|
Sbjct   75  GGCGCCCGGGGCGGAGGAGGTGTGCCGCGACTGCGGCTTCTGCTACTGCCGCCGCCACGCCGACGCGCATCGCC  148

Query  149  AGAAGTTCCTCAGTCACCATCTGGCCGAATACGTCCACGGCTCCCAGGCCTGGACCCCGCCAGCTGACGGAGAG  222
            |||||||||||||.||||..|||||.|..||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.||     .||.|
Sbjct  149  AGAAGTTCCTCAGCCACCGCCTGGCTGCCTACGTCCATGGCGCCCAGGCCTGGACTCCGCCGGC-----CAGCG  217

Query  223  GGGGCGGGGAAG--------GAAGAAGCGGAGGTCAAGGTGGAGCAGGAGAGGGAGATAGAAAGCGAGGCAGGG  288
            ||||.|..||.|        |||||.|..||||.|||.|.||||...|||.|||||.||||.|||||||..|||
Sbjct  218  GGGGAGACGACGCGCTCCCCGAAGACGGCGAGGCCAAAGGGGAGGCCGAGGGGGAGGTAGAGAGCGAGGTCGGG  291

Query  289  ---GAAGAGAGTGAGTCGGAGGAAGAGAGCGAGTCAGAGGAAGAGAGCGAGACAGAGGAAGAGAGTGAGGATGA  359
               ||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  292  GAAGAAGAGAGCGAGACGGAGGTAGACAGTGAGTCGGAAGAAGAGAGCGAGACCGAGGAAGACAGTGAGGATGA  365

Query  360  GAGCGATGAGGAGAGTGAAGAAGACAGCGAGGAAGAAATGGAGGATGAGCAAGAAAGCGAGGCCGAAGAAGACA  433
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  366  GAGTGACGAGGAGAGTGAAGAAGACAGCGAGGAAGAGATGGAGGATGAGCAGGAGAGCGAGGCGGAGGAAGACA  439

Query  434  ACCAAGAAGAAGGGGAATCCGAGGCGGAGGGAGAAACTGAGGCAGAAAGTGAATTTGACCCAGAAATAGAAATG  507
            |||   |||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  440  ACC---AAGAAGGGGAATCAGAGGCAGAAGGAGAAACTGAGGCAGAAAGCGAATTTGACCCCGAAATAGAGATG  510

Query  508  GAAGCAGAGAGAGTGGCCAAGAGGAAGTGTCCGGACCATGGGCTTGATTTGAGTACCTATTGCCAGGAAGATAG  581
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  511  GAAGCGGAGAGAGTGGCCAAGAGGAAGTGTCCAGACCATGGGCTGGATTTGAGCACCTATTGTCAGGAAGATAG  584

Query  582  GCAGCTCATCTGTGTCCTGTGTCCAGTCATTGGGGCTCACCAGGGCCACCAACTCTCCACCCTAGACGAAGCCT  655
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  585  GCAGCTCATCTGTGTCCTGTGTCCAGTCATTGGGGCTCACCGGGGCCACCAGCTGTCCACGCTGGACGAAGCCT  658

Query  656  TTGAAGAATTAAGAAGCAAAGACTCAGGTGGACTGAAGGCCGCTATGATCGAATTGGTGGAAAGGTTGAAGTTC  729
            |.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  659  TCGAAGAACTGAGAAGCAAAGATTCCGGTGGACTGAAGGCAGCAATGATAGAGTTGGTGGAAAGGTTAAAGTTC  732

Query  730  AAGAGCTCAGACCCTAAAGTAACTCGGGACCAAATGAAGATGTTTATACAGCAGGAATTTAAGAAAGTTCAGAA  803
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  733  AAGAGCTCAGACCCTAAAGTAACTCGAGACCAGATGAAGATATTTATACAGCAAGAATTTAAGAAAGTTCAGAA  806

Query  804  AGTGATTGCTGATGAGGAGCAGAAGGCCCTTCATCTAGTGGACATCCAAGAGGCAATGGCCACAGCTCATGTGA  877
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  807  AGTTATTGCTGATGAGGAGCAGAAGGCCCTTCATTTAGTGGATATCCAAGAAGCAATGGCCACGGCTCATGTGA  880

Query  878  CGGAGATACTGGCAGACATCCAATCCCACATGGATAGGTTGATGACTCAGATGGCCCAAGCCAAGGAACAACTT  951
            |.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  881  CTGAGATATTGGCGGACATCCAATCTCACATGGATAGGTTGATGACTCAGATGGCCCAGGCCAAGGAACAACTT  954

Query  952  GATACCTCTAATGAATCAGCTGAGCCAAAGGCAGAGGGCGATGAGGAAGGACCCAGTGGTGCCAGTGAAGAAGA  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  955  GATACCTCTAATGAATCAGCTGAGCCAAAGGCAGAGGGTGACGAGGAAGGACCCAGCGGTGCCAGTGAAGAAGA  1028

Query 1026  GGACACA  1032
            |||||||
Sbjct 1029  GGACACA  1035