Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08433
- Subject:
- XM_005247565.2
- Aligned Length:
- 1552
- Identities:
- 1380
- Gaps:
- 140
Alignment
Query 1 ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC 74
|||| || |..||| ||||.||..|||| ||.|.| ||||
Sbjct 1 ATGG-TG-----GTCACC---CAGCTGAATCTGG--AGTTTT--------------------GCTT-------- 35
Query 75 CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATG-GA-GCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGAC 146
||||..|| |||||.|| || ||| |||| |||.|||| |.||
Sbjct 36 --TCAGGGCA--------------------AGAAGCTGCGAGGCT-TCAG-----CTGTGAGC-------TTAC 74
Query 147 CC---CCAAGCCAC-TGGAGACTGAGCCTAGCAGGGA---------GACC-------GCCTGGTCCATAGGCCT 200
|| || |||| |||.|.|| .|||| || .||| |||.||||
Sbjct 75 CCGGTCC---CCACATGGGGTCT-TGCCT------GAATCTTTCTTCACCATCATGTGCCAGGTC--------- 129
Query 201 TCAGGTGACCGTGCCC-TTCATGTTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGG------GCCGGCATGCTTCTG--GACT 265
||| |||||| ||| |||.|.|| ||..|||.|..| ||||||.||.|..|| .||.
Sbjct 130 ----GTG---GTGCCCATTC-----TGCTGTCC--GGCTTGTGCATGATGACAGCCGGCCTGGTGATGAACACC 189
Query 266 ATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAG 339
||| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 ATT--CAACACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAG 261
Query 340 GGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGA 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGA 335
Query 414 GCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTG 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 GCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTG 409
Query 488 TGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGC 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 TGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGC 483
Query 562 AGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAA 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 AGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAA 557
Query 636 GCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTC 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 GCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTC 631
Query 710 TGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTT 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 TGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTT 705
Query 784 GCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTG 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 GCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTG 779
Query 858 GTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGC 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGC 853
Query 932 AGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGC 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 AGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGC 927
Query 1006 CGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 CGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAA 1001
Query 1080 CCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAG 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 CCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAG 1075
Query 1154 GCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 GCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTG 1149
Query 1228 CTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTG 1301
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 CTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTG 1223
Query 1302 GCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAGCT 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 GCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAGCT 1297
Query 1376 CCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCATACAACCCTTCATC 1449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCATACAACCCTTCATC 1371
Query 1450 TGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT 1521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 TGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT 1443