Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08433
- Subject:
- XM_017006708.1
- Aligned Length:
- 1543
- Identities:
- 1317
- Gaps:
- 212
Alignment
Query 1 ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC 74
Query 75 CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC 148
Query 149 CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCGCCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCACCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG 222
Query 223 TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAG----------------------- 273
Query 297 GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC 370
Sbjct 274 -------------------------------------------------------------------------- 273
Query 371 TCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 -----------GCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCC 336
Query 445 CTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 CTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCG 410
Query 519 AGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 AGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTG 484
Query 593 CCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 CCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACG 558
Query 667 CCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACA 632
Query 741 CAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 CAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTG 706
Query 815 CCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 CCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGC 780
Query 889 AGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGT 854
Query 963 CATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 CATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTG 928
Query 1037 CACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 CACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATC 1002
Query 1111 AATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 AATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCT 1076
Query 1185 GGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 GGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGA 1150
Query 1259 CAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGC 1332
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 CAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGC 1224
Query 1333 ATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAG-CTCCGTGGGCCACACTGCT-----GCTG--TG 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..| |||| ||| |||.||||| .||| ||
Sbjct 1225 ATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTACTGGCCTCC-TGG--CACTCTGCTTTTTCACTGACTG 1295
Query 1399 CC-----AAG---AAGGTGTACAGCCTCCCCAG-GATGG--GGCCTCATACAACCCTT--CATCTGCA-CTCAA 1458
.| ||| |||| ||| |.||| |||.||..|.||| | ||||||.| |||
Sbjct 1296 GCTACTGAAGAGCAAGG-------------CAGAGCTGGGTGGCATCTCAGAAC---TGGCATCTGGACCTC-- 1351
Query 1459 CATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT 1521
||
Sbjct 1352 -------------CC------------------------------------------------ 1353