Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08437
Subject:
NM_001173539.2
Aligned Length:
508
Identities:
466
Gaps:
42

Alignment

Query   1  MMSEHDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAK  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MMSEHDLADVVQIAVEDLSPDHPVVLENHVVTDEDEPALKRQRLEINCQDPSIKSFLYSINQTICLRLDSIEAK  74

Query  75  LQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRC---------------------------  121
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  75  LQALEATCKSLEEKLDLVTNKQHSPIQVPMVAGSPLGATQTCNKVRCVVPQTTVILNNDRQNAIVAKMEDPLSN  148

Query 122  ------------AVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHHEDGESGSEASDSVSSCGQAGSQSIGSNVTLITLNSEEDYP  183
                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  RAPDSLENVISNAVPGRRQNTIVVKVPGQEDSHHEDGESGSEASDSVSSCGQAGSQSIGSNVTLITLNSEEDYP  222

Query 184  NGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYG  257
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  NGTWLGDENNPEMRVRCAIIPSDMLHISTNCRTAEKMALTLLDYLFHREVQAVSNLSGQGKHGKKQLDPLTIYG  296

Query 258  IRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPNSSSYCPSEPMMSTPPPASELPQP  331
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  IRCHLFYKFGITESDWYRIKQSIDSKCRTAWRRKQRGQSLAVKSFSRRTPNSSSYCPSEPMMSTPPPASELPQP  370

Query 332  QPQPQALHYALANAQQVQIHQIGEDGQVQVIPQGHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQVLQGAQL  405
           ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  QPQPQALHYALANAQQVQIHQIGEDGQVQV---GHLHIAQVPQGEQVQITQDSEGNLQIHHVGQDGQVLQGAQL  441

Query 406  IAVASSDPAAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAPVSDHTAGAQTAEALQPTLQPEMQLEHGAIQIQ  469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  IAVASSDPAAAGVDGSPLQGSDIQVQYVQLAPVSDHTAGAQTAEALQPTLQPEMQLEHGAIQIQ  505