Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08437
• Subject: NM_001173540.2
• Aligned Length: 1491
• Identities: 1405
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAG----  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGGTAC  74

Query   71  --------------TTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  130
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCTGTGGGACATTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC  148

Query  131  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG  222

Query  205  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC  296

Query  279  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA  370

Query  353  AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC  444

Query  427  CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT  518

Query  501  CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA  592

Query  575  ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG  666

Query  649  GCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG  722
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG  740

Query  723  GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT  814

Query  797  TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC  888

Query  871  AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC  962

Query  945  AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT  1036

Query 1019  ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAG  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAG  1110

Query 1093  GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA  1184

Query 1167  GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGT-------------------------------------------------  1191
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 1185  GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGCTTCTAGAGGCCACCCGCATCCCCTGCCTCCTGGCCCCATCCGTCT  1258

Query 1192  -----------------CAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCG  1248
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAAAGCCAGCAGTGGCCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCG  1332

Query 1249  GGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCA  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCA  1406

Query 1323  CACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCA  1396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCA  1480

Query 1397  TCCAGATTCAG  1407
            |||||||||||
Sbjct 1481  TCCAGATTCAG  1491