Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08447
• Subject: NM_001349744.2
• Aligned Length: 2045
• Identities: 1950
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA  74

Query   75  CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG  148

Query  149  TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA  222

Query  223  ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT  296

Query  297  CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG  370

Query  371  ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG  444

Query  445  GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA  518

Query  519  AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA  592

Query  593  TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA  666

Query  667  GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA  740

Query  741  CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA  814

Query  815  AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG  888

Query  889  TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA  962

Query  963  GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA  1036

Query 1037  AGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGCTGTGGGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGCTGTGGGGG  1110

Query 1111  CATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACACCCCTCGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACACCCCTCGT  1184

Query 1185  GTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGAAGGCGACATTGACTACAGCACCGTGCTCCTCGGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGAAGGCGACATTGACTACAGCACCGTGCTCCTCGGCA  1258

Query 1259  TGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCGGACTCTCATACAGGCGGGCGCCAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCCGACTCTCATACAGGCGGGCGCCAGT  1332

Query 1333  GCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTTTCACTAGCGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTTTCACTAGCGGC  1406

Query 1407  GGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACATGGAAAGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACATGGAAAGCA  1480

Query 1481  AGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTCACGGAGCTGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTCACGGAGCTGCTG  1554

Query 1555  GACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTTCCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTGGTCACCGAGGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTTCCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTGGTCACCGAGGA  1628

Query 1629  GATCGCCACCTCCATCGAACCCATCCGCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGGGCTCCACGTGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 1629  GATCGCCACCTCCATCGAACCCATCCGCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCAT--------------  1688

Query 1703  TCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTCACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGATGAAGTTTCTC  1776
                                                                              ||||||||
Sbjct 1689  ------------------------------------------------------------------AGTTTCTC  1696

Query 1777  CTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCATTCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTCTCTGCGGGGCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  CTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCATTCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTCTCTGCGGGGCT  1770

Query 1851  TGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTGTCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTCTCGGGAGGTGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771  TGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTGTCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTCTCGGGAGGTGT  1844

Query 1925  ACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACGCTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTGCAATCACGAGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845  ACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACGCTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTGCAATCACGAGG  1918

Query 1999  TGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTCCAGCCTC--------------  2031
            |||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 1919  TGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTCCAGCCTCTGATGGCTCGGAGA  1965