Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08447
• Subject: XM_006508762.2
• Aligned Length: 2039
• Identities: 1697
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCT--TCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTC-CCTG---GGCGGTGCAGGCTGT  68
            ||||||||..|||  |..||..|||  |||||.|||||.|||||.||.||| ||||   |.|.||    ||||.
Sbjct    1  ATGAAGGTACTGG--ACCAGAGTCTCCTCTGGATGCTGCTTCCCTTCTTTCACCTGATAGCCAGT----GCTGC  68

Query   69  GGAGCACGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTG--GCTGCCATGCAGAGCCG  140
            .|||||||||||||||||..|||.||..|||||.|||||||||||  ||.|||.|  .||||||..|||||...
Sbjct   69  CGAGCACGAGGAGGTGGCCAAGCATGCCATCAAGCTGCACCGCGG--GAAGGGCGCCACTGCCACTCAGAGGAA  140

Query  141  GCAGTGGGTCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGA  214
            .|||||||.||.||||||||||||||.||||.|.|||||.||..|.||||||||||..||.||.||||||||||
Sbjct  141  ACAGTGGGCCCTGGACAGCTGCAGGAGGCTCACCGGGCTCCTGAGGCAGAAGAATGTGGTCCTCAACAAACTGA  214

Query  215  AAACTGCAATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTT  288
            |.|.|||.||..||||.||||||||.|||....||||.||||..||.|||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  215  AGAATGCCATCAGAGCCGTGGAGAAGGACACCAGCCTTTCGGGCGAGGAGAAGCTCTTCCAGGTGCACACATTC  288

Query  289  GAAATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCT  362
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||..|||||||||||||.||||||||
Sbjct  289  GAGATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCGATCTTCCAGGCCATCTACGGACTGCAAAGAGCCCT  362

Query  363  GCAGGGGGATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTG  436
            ||||||.||.||||.|||.||.||.||||||||.|||||||||..||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  363  GCAGGGCGACTACAGAGACGTGGTCAACATGAAAGAGAGCAGCAAGCAGCGGCTGGAGGCTCTGAGGGAGGCTG  436

Query  437  CAATAAAGGAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATG  510
            |.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  437  CCATTAAGGAGGAGACAGAGTATGTGGAACTTCTTGCCGCAGAAAAACACCAAGTGGAAGCCCTGAAAAACATG  510

Query  511  CAACATCAAAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGA  584
            ||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct  511  CAACATCAAAACAAGAGTCTCTCCATGCTTGACGAGATCCTCGAAGATGTGAGGAAAGCCGCCGACCGTCTGGA  584

Query  585  GGAAGAGATAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGG  658
            |||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  585  GGAGGAGATCGAGGAGCACGCCTTCGACGACAATAAATCAGTCAAAGGCGTCAACTTTGAGGCAGTTCTGAGAG  658

Query  659  TGGAGGAAGAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATG  732
            |||||||.||.|||||||..||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|.|.|||||||.||||||
Sbjct  659  TGGAGGAGGAGGAGGCCAGCTCCAAGCAGAATATGACGAAGCGGGAGGTGGAGGACGGCCTGGGTCTCAGCATG  732

Query  733  CTGATTGACTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCA  806
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  733  CTCATCGACTCCCAGAACAACCAGTACATTCTGACCAAGCCCAGAGATTCTACTATCCCACGCGCAGACCACCA  806

Query  807  CTTTATAAAGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGC  880
            |||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct  807  CTTCATAAAGGACATCGTGACCATAGGGATGCTGTCCTTACCATGTGGCTGGCTGTGTACAGCAATAGGTCTGC  880

Query  881  CTACAATGTTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTG  954
            ||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  881  CTACGATGTTTGGGTATATAATTTGTGGCGTGCTTCTGGGGCCTTCAGGACTGAACAGTATTAAGTCTATTGTA  954

Query  955  CAAGTGGAGACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAA  1028
            ||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  955  CAGGTGGAAACATTAGGAGAATTTGGGGTCTTCTTTACTCTGTTTCTGGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAGAA  1028

Query 1029  GCTAAGAAAGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGC  1102
            |||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||..
Sbjct 1029  GCTAAGAAAGGTGTGGAGGATATCCTTACAAGGACCCTGCTATATGACGCTGCTGATGATTGCCTTTGGCTTAT  1102

Query 1103  TGTGGGGGCATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACA  1176
            .||||||.||.|||.|||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1103  GGTGGGGACACCTCCTGCGGATCAGACCCACTCAGAGTGTCTTCATTTCCACCTGTCTGTCCTTGTCGAGCACA  1176

Query 1177  CCCCTCGTGTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGAAGGCGACATTGACTACAGCACCGTGCT  1250
            |||||.||.|||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1177  CCCCTGGTATCCAGGTTCCTAGTGGGAAGTGCCCGAGGTGATAAAGAAGGTGACATCGACTACAGCACAGTGCT  1250

Query 1251  CCTCGGCATGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCGGACTCTCATACAGGCGG  1324
            .||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||.|
Sbjct 1251  GCTTGGCATGCTGGTGATGCAAGACGTGCAGCTGGGGCTGTTCATTGCCGTCATGCCAACTCTCATACAGGCCG  1324

Query 1325  GCGCCAGTGCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTTTCA  1398
            |.||..|.||.|||||.|||.|||||.|||||||..|.||.||.|||.||.|||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1325  GAGCGGGCGCCTCTTCCAGCGTTGTCATGGAAGTATTGCGCATACTGTTTCTGATTGGACAAATTCTCTTTTCG  1398

Query 1399  CTAGCGGCGGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACAT  1472
            |||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1399  CTAGCTGCTGTCTTTCTTTTGTGTCTTGTCATGAAGACGTATCTCATAGGACCGTATTATCGAAAGCTGCACCT  1472

Query 1473  GGAAAGCAAGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTCACGG  1546
            |||.|||||||||||||||||.|||||..||.|||||.|.||.|||||.|.||||.|.|||.|.||||||||.|
Sbjct 1473  GGAGAGCAAGGGGAACAAAGAGATCCTCGTCCTGGGAGTGTCAGCCTTCACCTTCCTGATGCTGACGGTCACAG  1546

Query 1547  AGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTTCCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTGGTC  1620
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|.|||||
Sbjct 1547  AGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTTGGATGCTTCCTGGCTGGAGCGCTGGTCTCTTCCCAAGGGCACATGGTC  1620

Query 1621  ACCGAGGAGATCGCCACCTCCATCGAACCCATCCGCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGGGCT  1694
            ||||||||||||...||.|.||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1621  ACCGAGGAGATCATGACTTACATCGAGCCTATCCGTGACTTCCTGGCCATCATCTTCTTCGCATCCATAGGGCT  1694

Query 1695  CCACGTGTTCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTCACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGATGA  1768
            |||.|||||||||||.||||||...||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||..|.||||
Sbjct 1695  CCATGTGTTCCCCACCTTTGTGATCTATGAGTTGACGGTGCTGGTGTTCCTCACCCTGTCCGTGGTCATCATGA  1768

Query 1769  AGTTTCTCCTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCATTCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTCTCT  1842
            |||||.|..||||.|.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1769  AGTTTGTGTTGGCAGTGCTGGTCTTGTCTCTCATCCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTATCC  1842

Query 1843  GCGGGGCTTGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTGTCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTCTCG  1916
            ||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||.||.||||..|
Sbjct 1843  GCTGGGCTGGCACAGGTCAGCGAGTTCTCCTTTGTCCTGGGGAGTCGAGCACGGAGAGCAGGCATCCTCTCCAG  1916

Query 1917  GGAGGTGTACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACGCTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTGCAA  1990
            .|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||.|
Sbjct 1917  AGAGGTGTACCTCCTTATCCTAAGTGTGACCACACTCAGCCTCTTACTCGCCCCAGTGCTGTGGAAAGCAGCCA  1990

Query 1991  TCACGAGGTGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTCCAGCCTC  2031
            |.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1991  TTACCAAGTGTGTGCCGAGACCAGAGAGGCGCTCAAGTCTC  2031