Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08447
• Subject: XM_006508763.1
• Aligned Length: 2042
• Identities: 1612
• Gaps: 112

Alignment

Query    1  ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCT--TCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTC-CCTG---GGCGGTGCAGGCTGT  68
            ||||||||..|||  |..||..|||  |||||.|||||.|||||.||.||| ||||   |.|.||    ||||.
Sbjct    1  ATGAAGGTACTGG--ACCAGAGTCTCCTCTGGATGCTGCTTCCCTTCTTTCACCTGATAGCCAGT----GCTGC  68

Query   69  GGAGCACGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTG--GCTGCCATGCAGAGCCG  140
            .|||||||||||||||||..|||.||..|||||.|||||||||||  ||.|||.|  .||||||..|||||...
Sbjct   69  CGAGCACGAGGAGGTGGCCAAGCATGCCATCAAGCTGCACCGCGG--GAAGGGCGCCACTGCCACTCAGAGGAA  140

Query  141  GCAGTGGGTCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGA  214
            .|||||||.||.||||||||||||||.||||.|.|||||.||..|.||||||||||..||.||.||||||||||
Sbjct  141  ACAGTGGGCCCTGGACAGCTGCAGGAGGCTCACCGGGCTCCTGAGGCAGAAGAATGTGGTCCTCAACAAACTGA  214

Query  215  AAACTGCAATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTT  288
            |.|.|||.||..||||.||||||||.|||....||||.||||..||.|||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  215  AGAATGCCATCAGAGCCGTGGAGAAGGACACCAGCCTTTCGGGCGAGGAGAAGCTCTTCCAGGTGCACACATTC  288

Query  289  GAAATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCT  362
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||..|||||||||||||.||||||||
Sbjct  289  GAGATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCGATCTTCCAGGCCATCTACGGACTGCAAAGAGCCCT  362

Query  363  GCAGGGGGATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTG  436
            ||||||.||.||||.|||.||.||.||||||||.|||||||||..||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  363  GCAGGGCGACTACAGAGACGTGGTCAACATGAAAGAGAGCAGCAAGCAGCGGCTGGAGGCTCTGAGGGAGGCTG  436

Query  437  CAATAAAGGAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATG  510
            |.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  437  CCATTAAGGAGGAGACAGAGTATGTGGAACTTCTTGCCGCAGAAAAACACCAAGTGGAAGCCCTGAAAAACATG  510

Query  511  CAACATCAAAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGA  584
            ||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct  511  CAACATCAAAACAAGAGTCTCTCCATGCTTGACGAGATCCTCGAAGATGTGAGGAAAGCCGCCGACCGTCTGGA  584

Query  585  GGAAGAGATAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGG  658
            |||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  585  GGAGGAGATCGAGGAGCACGCCTTCGACGACAATAAATCAGTCAAAGGCGTCAACTTTGAGGCAGTTCTGAGAG  658

Query  659  TGGAGGAAGAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATG  732
            |||||||.||.|||||||..||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|.|.|||||||.||||||
Sbjct  659  TGGAGGAGGAGGAGGCCAGCTCCAAGCAGAATATGACGAAGCGGGAGGTGGAGGACGGCCTGGGTCTCAGCATG  732

Query  733  CTGATTGACTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCA  806
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  733  CTCATCGACTCCCAGAACAACCAGTACATTCTGACCAAGCCCAGAGATTCTACTATCCCACGCGCAGACCACCA  806

Query  807  CTTTATAAAGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGC  880
            |||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct  807  CTTCATAAAGGACATCGTGACCATAGGGATGCTGTCCTTACCATGTGGCTGGCTGTGTACAGCAATAGGTCTGC  880

Query  881  CTACAATGTTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTG  954
            ||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||            
Sbjct  881  CTACGATGTTTGGGTATATAATTTGTGGCGTGCTTCTGGGGCCTTCAGGACTGAACAGTATT------------  942

Query  955  CAAGTGGAGACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAA  1028
                                                                                      
Sbjct  943  --------------------------------------------------------------------------  942

Query 1029  GCTAAGAAAGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGC  1102
                   ||||||||||.|||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||..
Sbjct  943  -------AAGGTGTGGAGGATATCCTTACAAGGACCCTGCTATATGACGCTGCTGATGATTGCCTTTGGCTTAT  1009

Query 1103  TGTGGGGGCATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACA  1176
            .||||||.||.|||.|||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1010  GGTGGGGACACCTCCTGCGGATCAGACCCACTCAGAGTGTCTTCATTTCCACCTGTCTGTCCTTGTCGAGCACA  1083

Query 1177  CCCCTCGTGTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGA---AGGCGACATTGACTACAGCACCGT  1247
            |||||.||.|||||||||||..||||.|||||.||.|||||.|||||   |||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1084  CCCCTGGTATCCAGGTTCCTAGTGGGAAGTGCCCGAGGTGATAAAGAAGCAGGTGACATCGACTACAGCACAGT  1157

Query 1248  GCTCCTCGGCATGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCGGACTCTCATACAGG  1321
            |||.||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1158  GCTGCTTGGCATGCTGGTGATGCAAGACGTGCAGCTGGGGCTGTTCATTGCCGTCATGCCAACTCTCATACAGG  1231

Query 1322  CGGGCGCCAGTGCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTT  1395
            |.||.||..|.||.|||||.|||.|||||.|||||||..|.||.||.|||.||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1232  CCGGAGCGGGCGCCTCTTCCAGCGTTGTCATGGAAGTATTGCGCATACTGTTTCTGATTGGACAAATTCTCTTT  1305

Query 1396  TCACTAGCGGCGGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCA  1469
            ||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1306  TCGCTAGCTGCTGTCTTTCTTTTGTGTCTTGTCATGAAGACGTATCTCATAGGACCGTATTATCGAAAGCTGCA  1379

Query 1470  CATGGAAAGCAAGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTCA  1543
            |.||||.|||||||||||||||||.|||||..||.|||||.|.||.|||||.|.||||.|.|||.|.|||||||
Sbjct 1380  CCTGGAGAGCAAGGGGAACAAAGAGATCCTCGTCCTGGGAGTGTCAGCCTTCACCTTCCTGATGCTGACGGTCA  1453

Query 1544  CGGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTTCCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTG  1617
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|.||
Sbjct 1454  CAGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTTGGATGCTTCCTGGCTGGAGCGCTGGTCTCTTCCCAAGGGCACATG  1527

Query 1618  GTCACCGAGGAGATCGCCACCTCCATCGAACCCATCCGCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGG  1691
            |||||||||||||||...||.|.||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct 1528  GTCACCGAGGAGATCATGACTTACATCGAGCCTATCCGTGACTTCCTGGCCATCATCTTCTTCGCATCCATAGG  1601

Query 1692  GCTCCACGTGTTCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTCACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGA  1765
            ||||||.|||||||||||.||||||...||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||..|.|
Sbjct 1602  GCTCCATGTGTTCCCCACCTTTGTGATCTATGAGTTGACGGTGCTGGTGTTCCTCACCCTGTCCGTGGTCATCA  1675

Query 1766  TGAAGTTTCTCCTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCATTCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTC  1839
            ||||||||.|..||||.|.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1676  TGAAGTTTGTGTTGGCAGTGCTGGTCTTGTCTCTCATCCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTA  1749

Query 1840  TCTGCGGGGCTTGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTGTCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTC  1913
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||.||.||||
Sbjct 1750  TCCGCTGGGCTGGCACAGGTCAGCGAGTTCTCCTTTGTCCTGGGGAGTCGAGCACGGAGAGCAGGCATCCTCTC  1823

Query 1914  TCGGGAGGTGTACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACGCTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTG  1987
            ..|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct 1824  CAGAGAGGTGTACCTCCTTATCCTAAGTGTGACCACACTCAGCCTCTTACTCGCCCCAGTGCTGTGGAAAGCAG  1897

Query 1988  CAATCACGAGGTGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTCCAGCCTC  2031
            |.||.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1898  CCATTACCAAGTGTGTGCCGAGACCAGAGAGGCGCTCAAGTCTC  1941