Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08453
• Subject: NM_021529.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1226
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||.||||||||||...||||||.|..||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACTGGAAAGACGTGCTTCGCCGGCGGTTAGCGTCGCCCAACACGGATCCAAAGAGGAAAAAAAGCGAACA  74

Query   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACCAAATACTACTCAGAGTGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148

Query  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222
            |.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGAGTTCTATAAGACCATACCCCGGTTTTATTACAGGTTGCCAGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222

Query  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296
            .||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  223  CGAGAGGAATCTAGAGCTGTCTTTCTACAGAGGAAAAGCAGAGAACTCTTAGATAACGAAGAGTTGCAGAACTT  296

Query  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370
            |||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  297  ATGGTTTTTGCTGGATAAACACCAGATACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCAATGATCAATTATGAAAATTTTT  370

Query  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGACCAAAGTGCAAGCAATTTTTTACTGCAAAAGTCTTTGCCAAACTCCTTCAT  444

Query  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  ACAGATTCATATGGACGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAACTACGTCATGCGAAAAGTTTGGCTGCATCAGAC  518

Query  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||..
Sbjct  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTTGCTGGCCAAGGATACCTTCGGGAATCAGACCTGGAGAACTACATCC  592

Query  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666
            ||||.||.|||||.|||.|||||||..|.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  593  TGGAGCTGATCCCGACGCTGCCACAGCTGGACGGGCTGGAGAAGTCCTTCTACTCCTTCTATGTCTGCACTGCA  666

Query  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740
            ||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GTCAGGAAGTTCTTCTTCTTCTTGGACCCTCTAAGAACAGGGAAGATCAAAATTCAAGATATTTTGGCATGCAG  740

Query  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814
            .||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTCTAGATGATTTACTGGAGCTAAGAGATGAGGAATTGTCCAAAGAAAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814

Query  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888
            |||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  CTCCTTCTGCCCTGAGGGTCTATGGTCAGTATTTGAATCTTGATAAAGATCATAATGGCATGCTAAGTAAAGAG  888

Query  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962
            ||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCTCTCCCGTTACGGAACAGCAACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGAGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962

Query  963  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  CGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACCTGGACTTTGTTCTTGCCTTAGAAAACAGAAAGGAGCCTGCAGCTC  1036

Query 1037  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1110
            |.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCAGTACATTTTCAAACTGCTGGACATTGAGAACAAGGGATACCTGAATGTCTTTTCCCTTAATTATTTCTTT  1110

Query 1111  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGGCCATACAAGAACTAATGAAAATCCATGGACAGGATCCTGTGTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184

Query 1185  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACATGGTCAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCACTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258

Query 1259  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1332
            |.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||..
Sbjct 1259  TCACTACCATTCTAATTGATCTCAATGGCTTCTGGACCTACGAGAACAGAGAAGCCCTTGTTGCAAATGACAAC  1332

Query 1333  GAAAACTCTGCAGACCTNGATGATACA  1359
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1333  GAGAACTCTGCAGATCTTGATGACACA  1359