Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08453
• Subject: XM_024449638.1
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1265
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTGTCCAAACAAAAAAAAAAGTGAACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAATTAAAAGATGAAGAAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  148
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAA  55

Query  149  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  ATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTA  129

Query  223  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130  AGAGAGGAATCAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTT  203

Query  297  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  ATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTT  277

Query  371  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  TGAAGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCAT  351

Query  445  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  ACAGATTCATATGGAAGAATTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAAC  425

Query  519  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  AAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATAT  499

Query  593  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  TGGAACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCA  573

Query  667  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAG  647

Query  741  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  CTTCCTAGATGATTTATTGGAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTG  721

Query  815  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  CTCCTTCTGCCCTAAGAGTTTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAA  795

Query  889  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTA  869

Query  963  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  TGATGGAGAAATGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTC  943

Query 1037  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  TACAATATATTTTCAAACTGCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT  1017

Query 1111  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  AGGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTT  1091

Query 1185  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  TGACATGGTAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAG  1165

Query 1259  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  TAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGT  1239

Query 1333  GAAAACTCTGCAGACCTNGATGATACA  1359
            |||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1240  GAAAACTCTGCAGACCTTGATGATACA  1266