Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08467
- Subject:
- NM_027052.3
- Aligned Length:
- 1646
- Identities:
- 1360
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGGATCCCATGGAACTGAGAAATGTCAACATCGAACCAGATGATGAGAGCAGCAGTGGAGAAAGTGCTCCAGA 74
|||||.|||||||||||||..||.||||.|||||||||.||.|..||.|||.||||.||.||.|||..||..||
Sbjct 1 ATGGACCCCATGGAACTGAACAACGTCAGCATCGAACCCGACGGAGACAGCTGCAGCGGGGACAGTATTCAGGA 74
Query 75 TAGCTACATCGGGATAGGAAATTCAGAAAAGGCAGCAATGAGCAGTCAATTTGCTAATGAAGACACTGAAAGTC 148
.|||||||.|||.||.|.|||.||.||.||||..||.||||.|||.|||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct 75 CAGCTACACCGGCATGGAAAACTCCGACAAGGACGCCATGAACAGCCAATTTGCTAATGAAGATGCCGAAAGTC 148
Query 149 AGAAATTCCTGACAAATGGATTTTTGGGGAAAAAGAAGCTGGCAGATTATGCCGATGAACACCATCCCGGAACC 222
||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||..
Sbjct 149 AGAAGTTCCTGACAAATGGGTTTTTAGGGAAGAAGAAGCTAGCCGATTACGCGGATGAGCATCACCCTGGAATG 222
Query 223 ACTTCCTTTGGAATGTCTTCATTTAACCTGAGTAATGCCATCATGGGCAGTGGGATCCTGGGCTTGTCCTATGC 296
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 223 ACTTCCTTTGGAATGTCCTCATTTAACCTGAGCAACGCCATCATGGGCAGTGGGATCTTAGGCTTGTCCTATGC 296
Query 297 CATGGCCAACACAGGGATCATACTTTTTATAATCATGCTGCTTGCTGTGGCAATATTATCACTGTATTCAGTTC 370
||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||.||.||.||.||||
Sbjct 297 CATGGCCAACACCGGGATCATCCTTTTTATAATCATGCTGCTTACTGTGGCAATACTCTCGCTCTACTCGGTTC 370
Query 371 ACCTTTTATTAAAAACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTTTGATTTATGAAAAATTAGGAGAAAAGGCATTTGGATGG 444
|||||||..|.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 371 ACCTTTTGCTGAAGACAGCCAAGGAAGGAGGGTCTCTAATCTATGAAAAATTGGGCGAGAAAGCATTTGGATGG 444
Query 445 CCGGGAAAAATTGGAGCTTTTGTTTCCATTACAATGCAGAACATTGGAGCAATGTCAAGCTACCTCTTTATCAT 518
||.||.|||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 CCTGGGAAAATTGGAGCCTTCATCTCTATTACAATGCAGAACATTGGAGCCATGTCAAGCTACCTCTTCATCAT 518
Query 519 TAAATATGAACTACCTGAAGTAATCAGAGCATTCATGGGACTTGAAGAAAATACTGGAGAATGGTACCTCAATG 592
|||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 TAAGTACGAACTGCCTGAAGTAATCAGAGCATTCATGGGACTTGAAGAAAACACTGGGGAATGGTACCTCAACG 592
Query 593 GCAACTACCTCATCATATTTGTGTCTGTTGGAATTATTCTTCCACTTTCGCTCCTTAAAAATTTAGGTTATCTT 666
|||||||||||.||.||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 GCAACTACCTCGTCTTATTTGTGTCCGTGGGGATCATCCTCCCGCTCTCTCTCCTTAAAAATTTAGGCTACCTT 666
Query 667 GGCTATACCAGTGGATTTTCTCTTACCTGCATGGTGTTTTTTGTTAGTGTGGTGATTTACAAGAAATTCCAAAT 740
|||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 GGCTACACCAGTGGATTTTCTCTCTCCTGCATGGTGTTTTTCGTCAGTGTGGTGATTTACAAAAAATTCCAAAT 740
Query 741 ACCCTGCCCTCTACCTGTTTTGGATCACAGTGTTGGAAATCTGTCATTCAACAACACGCTTCCAATGCATGTGG 814
.|||||||||||.||||.|.|||||||||.....|||||||||.|.|||||||||||.|||||.||.||..||.
Sbjct 741 TCCCTGCCCTCTGCCTGCTCTGGATCACAACAACGGAAATCTGACGTTCAACAACACACTTCCGATTCACATGA 814
Query 815 TAATGTTACCCAACAACTCTGAGAGTTCTGATGTGAACTTCATGATGGATTACACCCACCGCAATCCTGCAGGG 888
|...|.|.||.||..||||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||||.|.||||.|||.||.||.|||
Sbjct 815 TCTCGCTGCCTAATGACTCGGAGAGCTCGGGTGTGAACTTCATGATGGATTACGCTCACCACAACCCAGCTGGG 888
Query 889 CTGGATGAGAACCAGGCCAAGGGCTCTCTTCATGACAGTGGAGTAGAATATGAAGCTCATAGTGATGACAAGTG 962
|||||||||||.||||.|...|||.|||||||...||.|||.||.||.||.|||||.||..|||.|||.||.||
Sbjct 889 CTGGATGAGAAGCAGGTCGCAGGCCCTCTTCACAGCAATGGCGTGGAGTACGAAGCCCAGGGTGCTGAGAAATG 962
Query 963 TGAACCCAAATACTTTGTATTCAACTCCCGGACGGCCTATGCAATTCCTATCCTAGTATTTGCTTTTGTATGCC 1036
..||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||||||||.||||
Sbjct 963 CCAACCAAAATACTTTGTGTTCAATTCCCGGACGGCCTATGCAATCCCAATCCTGGCTTTTGCTTTTGTCTGCC 1036
Query 1037 ACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGTGAACTTAAAGATCGGTCCCGGAGAAAAATGCAAACGGTGTCAAATATT 1110
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1037 ACCCTGAGGTCCTTCCCATCTACAGCGAGCTTAAAGATCGATCCCGCAGAAAGATGCAGACGGTGTCCAACATT 1110
Query 1111 TCCATCACGGGGATGCTTGTCATGTACCTGCTTGCCGCCCTCTTTGGTTACCTAACCTTCTATGGAGAAGTTGA 1184
||||||.|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|.||||||.||.||.|||||
Sbjct 1111 TCCATCTCAGGCATGCTCGTCATGTACCTTCTTGCGGCCCTCTTTGGTTATCTGAGCTTCTACGGGGACGTTGA 1184
Query 1185 AGATGAATTACTTCATGCCTACAGCAAAGTGTATACATTAGACATCCCTCTTCTCATGGTTCGCCTGGCAGTCC 1258
|||.||..|.||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.|...|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185 AGACGAGCTGCTGCATGCTTACAGCAAGGTCTACACATTTGATACGGCTCTTCTCATGGTGCGCCTGGCAGTCC 1258
Query 1259 TTGTGGCAGTAACACTAACTGTGCCCATTGTCCTCTTCCCAATTCGTACATCAGTGATCACACTGTTATTTCCC 1332
|.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||
Sbjct 1259 TGGTGGCAGTGACACTGACCGTGCCCATCGTGCTGTTCCCGATCCGTACTTCGGTGATCACACTGCTGTTTCC- 1331
Query 1333 AAACG--ACCCTTCAGCTGGATACGA--CATTTCCTGATTGCAGCTGTGCTTATTGCACTTAATAATGTTCTGG 1402
||.| |||||||||||||.| || ||||||..|||.||.||..|..|.||.|||||.||.||..|.||||
Sbjct 1332 -AAGGAAACCCTTCAGCTGGCT--GAAGCATTTCGGGATCGCTGCAATCATCATCGCACTCAACAACATCCTGG 1402
Query 1403 TCATCCTTGTGCCAACTATAAAATACATCTTCGGATTCATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATTTTTATT 1476
|||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1403 TCATCCTCGTGCCTACCATCAAATACATCTTTGGATTCATAGGGGCTTCTTCTGCCACTATGCTGATTTTCATT 1476
Query 1477 CTTCCAGCAGTTTTTTATCTTAAACTTGTCAAGAAAGAAACTTTTAGGTCACCCCAAAAGGTCGGGGCTTTAAT 1550
|||||.||.|..||||||||.||.||.||||||||||||.||.|.||.||||||||.|||.|.||||||||..|
Sbjct 1477 CTTCCGGCTGCGTTTTATCTCAAGCTCGTCAAGAAAGAACCTCTAAGATCACCCCAGAAGATTGGGGCTTTGGT 1550
Query 1551 TTTCCTTGTGGTTGGAA-TATTCTTCATGATTGGAAGCATGGCACTCATTATAATTGACTGGATTTATGATCCT 1623
.|||||||||..||||| |||| ||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||..|.||.
Sbjct 1551 CTTCCTTGTGACTGGAATTATT-TTCATGATGGGAAGCATGGCGCTCATTATACTCGACTGGATCTACAACCCG 1623
Query 1624 CCAAATTCCAAGCATCAC 1641
||.|||.||||.||.|||
Sbjct 1624 CCGAATCCCAATCACCAC 1641