Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08479
- Subject:
- NM_001328124.1
- Aligned Length:
- 1240
- Identities:
- 1012
- Gaps:
- 183
Alignment
Query 1 MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 DPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 NLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKT 222
.|..... |.......|||..|...... .|..|....|..|.|...|..........
Sbjct 1 -MLPSSSW--GKRKLRGRLGWVRSDARGVM-----WARQEGLHHPHPHAVIRCPSSSSSSVSCS---------- 56
Query 223 RMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL 296
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Sbjct 57 -----------------GDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL 113
Query 297 KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV 370
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Sbjct 114 KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV 187
Query 371 YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR 444
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Sbjct 188 YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR 261
Query 445 LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS 518
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Sbjct 262 LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS 335
Query 519 KERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG 592
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Sbjct 336 KERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG 409
Query 593 AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE 666
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Sbjct 410 AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE 483
Query 667 IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW 740
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Sbjct 484 IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW 557
Query 741 CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK 814
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Sbjct 558 CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK 631
Query 815 SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV 888
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Sbjct 632 SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV 705
Query 889 LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ 962
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Sbjct 706 LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ 779
Query 963 PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ 1036
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Sbjct 780 PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ 853
Query 1037 GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD 1110
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Sbjct 854 GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD 927
Query 1111 GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRS 1184
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Sbjct 928 GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRS 1001
Query 1185 RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML 1240
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Sbjct 1002 RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML 1057