Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08479
• Subject: NM_172415.3
• Aligned Length: 1282
• Identities: 1132
• Gaps: 49

Alignment

Query    1  MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVT  74
            |||||||||||||..|.|..||||.|.|.|.||||||||||.|||||..|.||.|||||||.|.||..|..|..
Sbjct    1  MASSNPPPQPAIGAPLAPSAPGPSPEVEEDSGEAFEFDDSDEEEDTSSGLVVPGLAPERDTEPSLICFDTVPGS  74

Query   75  DPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER  148
            |.|||||||.|..|..||||||..||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DLDPAAAPPQTEAPTVVSNGDAVGAAISGVRRSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER  148

Query  149  NLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQP--------------------  202
            .|.|||.|||||||..||||||||||||||||||||.||  |.||.|||.||||                    
Sbjct  149  GLVYEDVHRAGAPRETEDLGWSSSEFESYSEDSGEETKP--EAEPTKHRGSFQPKLSPDLTRLKERYVRTKRDI  220

Query  203  -------------------KMTQLMKAAKSGTKDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDI  257
                               |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct  221  LALRVGGRDMQELKLKCDCKMTQLMKAAKSGTRDGLEKTRMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVGVTDI  294

Query  258  KPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEIL  331
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  KPPAPELGPMPDGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESLKRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEIL  368

Query  332  HCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVC  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  HCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDVYSDYVNNFTNAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVC  442

Query  406  SPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTK  479
            |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  STDRVTLYGLMVKPVQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDRLSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTK  516

Query  480  SVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVP  553
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||
Sbjct  517  SVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKSKERRVFLLNDMLVCANINFK-----GQLEISSLVP  585

Query  554  LGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSGAKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVV  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  LGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNLLIQHAGAKKATAAGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVV  659

Query  628  EQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNP  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  EQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEEIHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNP  733

Query  702  LSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGF  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.|||||||.|||||
Sbjct  734  LSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFWCPILACCVPAFSSRTLSLQLGGLVHSPVNSPLLGF  807

Query  776  SAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSA  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||..|||||...||....|||.
Sbjct  808  SAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVKSFPVAAPVLCIEYIPDPEEEAEGAEESRAATDPSV  881

Query  850  TVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPVLCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLES  923
            |||||.||||||||||||.|||||||||..|.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||...|||||
Sbjct  882  TVHPTVCLGLQDGSILLYGSVDTGTQCLATCKSPGPQPVLCLRHSPFYLLAGLQDGTLAAYPRTSGDIPWDLES  955

Query  924  PPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQPQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSI  997
            ||.|.||||||.|||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  956  PPMCITVGPGPIRTLLSLEDAAWASCGPRVTVLDAATLQTQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGSSI  1029

Query  998  RLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLN  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  RLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQGLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLN  1103

Query 1072  GHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPDGQAHE--PMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAH  1143
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||  |.||||..||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  GHCGPVAFLAVAMSILAPDILRSDQEEAEGPQAEEDKPDGQAHETVPGPDSHTARELTRKKGILLQYRLRSTAH  1177

Query 1144  LPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGS  1217
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|.
Sbjct 1178  LPGPLLSVREPAPADGSALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRSRPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRHFGGAPGG  1251

Query 1218  -SGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1240
             |||.|||.|||||||||||||.|
Sbjct 1252  LSGRAAPCSETDSTLLIWQVPLAL  1275