Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08479
• Subject: XM_006539204.3
• Aligned Length: 3751
• Identities: 2759
• Gaps: 593

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG  444
                        ||||.|                         |||||..||.|||      ||||.| |||||
Sbjct    1  ------------ATGTTA-------------------------CCCAGCAGCTCAT------GGGGGA-AGAGG  30

Query  445  AA-CCTGCTCTAC-GAGGATGCGCACCGGGCTGGG-GCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAG  515
            || ||      || |||...||| ||.|||.|||| ||                       |||         |
Sbjct   31  AAGCC------ACGGAGTCAGCG-ACTGGGGTGGGTGC-----------------------GCT---------G  65

Query  516  TGA-GTTCGAGAGCTACA-GCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTC-GAGCCCGCCAAGC  586
            ||| |..|||| ||.|.| |.|                |||||.||.||||     |||| ..|||.||||  |
Sbjct   66  TGATGCCCGAG-GCAATATGTG----------------GGCCAGGCAGGAG-----GGTCTTCGCCAGCCA--C  115

Query  587  ACCGAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAG  660
            ||       |||  ||.|||  .|||    .||||||     ||||                            
Sbjct  116  AC-------CCT--CACCCC--CATG----CGCTCAT-----CCGC----------------------------  141

Query  661  AAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCT--------TCCTGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCG  726
                      ||.||||..|.|.|     |||||        ||||||.||              ||||||||.
Sbjct  142  ----------TGTCCGTCCTCCTC-----CTCCTCCTCTGTGTCCTGCTCA--------------GGTGACTCA  186

Query  727  GAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCAT  800
            ||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||..|.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  187  GAAGAAGAAGATATGGGGCTCCTGGAGGTTGGTGTGACAGACATCAAACCTCCCGCGCCAGAGCTGGGCCCCAT  260

Query  801  GCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCT  874
            |||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  GCCGGATGGCTTGAGTCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGACACATCCTAGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCT  334

Query  875  ACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGC  948
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  ACGTGGAGTCACTGAAGCGGATACTCCAGGATTACCGTAACCCACTAATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGC  408

Query  949  GCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCT  1022
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  409  GCCCGCAAGTGTCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATTCTACATTGTCACTCCATGTTCCAGATCGCTCT  482

Query 1023  GTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCA  1096
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct  483  GTCCTCCCGCGTGGCCGAGTGGGACTCCACAGAGAAGATTGGAGACCTCTTTGTGGCTTCATTCTCCAAGTCCA  556

Query 1097  TGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTC  1170
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  557  TGGTCCTAGATGTATACAGCGACTATGTGAACAACTTCACCAACGCCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGTCTC  630

Query 1171  ACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCT  1244
            ||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct  631  ACCAAGCCAGCGTTCCTTGAGTTTCTCAAGCGGCGGCAGGTGTGCAGTACGGACCGAGTCACCCTCTATGGGTT  704

Query 1245  GATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGG  1318
            ||||||.||.||..|.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct  705  GATGGTGAAACCTGTTCAGAGATTTCCACAGTTCATCCTCCTACTCCAGGACATGCTGAAGAACACTCCCCGGG  778

Query 1319  GCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAG  1392
            ||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  GCCACCCTGACAGGTTGTCGCTGCAGCTAGCCCTCACGGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAG  852

Query 1393  AAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAA  1466
            ||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  AAGCGGTTGGCCGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGTGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAA  926

Query 1467  GCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGC  1540
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  927  GCTGTTGACCTCTGGCCAGCGGCAGCTGCTTCTGTGTGAGACACTGACTGAGACGGTGTATGGAGACCGAGGGC  1000

Query 1541  AGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAG  1614
            ||||.||.||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1001  AGCTGATCAAGTCCAAGGAGCGCAGGGTCTTCCTGCTCAATGACATGCTGGTCTGCGCCAACATCAACTTCAAG  1074

Query 1615  CCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAA  1688
            ||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1075  CCCTCCAACCACAGGGGCCAGCTAGAGATCAGCAGCCTGGTACCTCTGGGGCCCAAGTACGTGGTGAAGTGGAA  1148

Query 1689  CACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCA  1762
            |||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||
Sbjct 1149  CACAGCTCTGCCTCAGGTGCAGGTGGTAGAGGTGGGTCAGGATGGTGGCACCTACGACAAAGACAATCTGCTCA  1222

Query 1763  TCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGC  1836
            |||||||..|.||.||||||||||||.||||..||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1223  TCCAGCATGCTGGAGCCAAGAAGGCCACTGCTGCAGGGCAGGCCCAGAACAAGGTGTACCTGGGCCCCCCACGC  1296

Query 1837  CTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCT  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..|
Sbjct 1297  CTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACCCTCCTCATCAGCACCTT  1370

Query 1911  GCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGG  1984
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1371  GCATGGCACTTACCAGAATCTGAACATGACTGTGGCCCAAGACTGGTGCCTGGCGCTGCAGAGGCTGATGCGGG  1444

Query 1985  TGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCC  2058
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1445  TGAAGGAGGAGGAGATTCACTCGGCCAACAAGTGCCGCCTGAGGCTGCTGCTCCCCGGGAAGCCAGACAAGTCT  1518

Query 2059  GGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTT  2132
            |||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1519  GGCCGGCCCATCAGTTTCATGGTGGTCTTCATCACCCCGAACCCCCTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGATT  1592

Query 2133  ACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCA  2206
            |||.|||||.||.||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1593  ACACTTGGCAAAGATTGGACTAAGGGAGGAGAACCAGCCAGGATGGCTGTGTCCCGATGAGGACAAGAAAAGCA  1666

Query 2207  AAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTT  2280
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1667  AAGCCCCGTTCTGGTGCCCCATCCTGGCCTGCTGCGTCCCCGCTTTCTCCTCCCGGACCCTCAGTCTGCAGCTT  1740

Query 2281  GGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGG  2354
            ||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1741  GGGGGCCTGGTCCACAGTCCTGTTAACTCTCCCCTGCTGGGCTTCTCGGCGGTCAGCACTTCCCTTCCACAGGG  1814

Query 2355  CTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGC  2428
            ||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct 1815  CTACCTTTGGGTTGGCGGTGGTCAGGAGGGTGCTGGTGGCCAGGTGGAGATCTTCTCCCTGAACCGGCCTTCAC  1888

Query 2429  CCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAG  2502
            |.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|.||||||||||
Sbjct 1889  CGCGCACGGTCAAGTCCTTCCCAGTGGCGGCCCCTGTGCTCTGCATAGAGTATATTCCAGATCCGGAGGAGGAG  1962

Query 2503  GCGGA--GAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGG  2574
            ||.||  |.||||||  |||||||.|.|||...|.||.|||||||.|||.||||||||.||..|||||||.||.
Sbjct 1963  GCTGAGGGTGCAGAG--GAGAGCCGGGCAGCCACCGATCCCTCGGTCACAGTGCATCCCACTGTCTGCCTTGGA  2034

Query 2575  CTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCC  2648
            ||.|||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||||..|.|||||.||||||
Sbjct 2035  CTGCAGGATGGCAGCATCCTACTGTATGGCAGTGTGGACACGGGTACCCAGTGCCTGGCCACCTGCAAGAGCCC  2108

Query 2649  AGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTG  2722
            |||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2109  AGGCCCGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGTCACAGCCCTTTCTACCTGCTTGCCGGCCTCCAGGACGGGACCCTCG  2182

Query 2723  CTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTG----TCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGG  2792
            ||||.||.||||||||||   |.||||    ||| .|||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||
Sbjct 2183  CTGCCTATCCTCGGACCA---GTGGTGACATTCC-CTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCATGTGCATAACTGTGGG  2252

Query 2793  GCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCC  2866
            .||.|||||..|.||.||.|||.||||||||||.|||||.|..|||||||||||.|||||..||||||||||.|
Sbjct 2253  CCCAGGGCCGATTCGAACACTGCTGAGCCTGGAAGATGCTGCATGGGCCAGCTGCGGGCCGAGGGTCACTGTAC  2326

Query 2867  TGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGACACACATG  2940
            |.||.|||.||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 2327  TAGATGCCGCCACTTTGCAAACTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGATGAGGCGGTGAGTGTCACTCACATG  2400

Query 2941  GTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTGAGACCCT  3014
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2401  GTGAAAGCCGGCAGCGGTGTCTGGATGGCCTTCTCCTCTGGCTCTTCCATCCGCCTCTTTCACACGGAGACTCT  2474

Query 3015  GGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCA  3088
            ||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 2475  GGAGCACCTTCAGGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAAAAGCACCTATGTGTCA  2548

Query 3089  CCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCT  3162
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.
Sbjct 2549  CCAGCCTCCTCATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTAGGCACTGACCAGGGTGTCATTGTCCTGTTGCCTGTACCC  2622

Query 3163  CGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTT  3236
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2623  CGACTGGAGGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTGTCTCTCAATGGTCACTGTGGACCTGTGGCCTT  2696

Query 3237  CCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGG  3310
            ||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|.||
Sbjct 2697  CCTGGCTGTGGCCATGAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAAGAGGCCGAGGGACCGCAGG  2770

Query 3311  CTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACA------CGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCTG  3378
            |.||||||||||||||||||||||||||.||      ||.|||...|||.|||||||||...|..||.||||||
Sbjct 2771  CCGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCTCATGAAACCGTGCCTGGGCCTGACAGCCACACAGCTCGGGAGCTG  2844

Query 3379  ACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCT-CCCGGGCCCGCTGCTCTCCA  3451
            |||||||||||.||||||||..|.||.||||||||.||||||||.||.||||| ||||||||| |||.|.||..
Sbjct 2845  ACCCGCAAGAAAGGCATCCTGCTCCAATACCGCCTACGCTCCACGGCCCACCTCCCCGGGCCC-CTGTTGTCTG  2917

Query 3452  TGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCC  3525
            ||||||||||.||.|||||.||||||.|.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2918  TGCGGGAGCCAGCACCTGCCGATGGCTCGGCTCTGGAACACAGTGAGGAGGACGGGTCCATCTACGAGATGGCC  2991

Query 3526  GACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGC  3599
            ||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2992  GATGACCCTGACGTCTGGGTCCGGAGCCGGCCCTGTGCCCGTGATGCCCACCGCAAGGAGATCTGCTCTGTGGC  3065

Query 3600  CATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTC----TGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCG  3669
            .||||||||.||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.||||    |||.|.| ||||||.||..|||||||
Sbjct 3066  TATCATCTCTGGTGGACAAGGCTACCGCCATTTCGGCGGTGCTCCAGGTGGCCTG-AGTGGGCGGGCGGCCCCG  3138

Query 3670  TGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
            ||..|.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||...|||
Sbjct 3139  TGCAGCGAGACAGACAGCACACTTCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGGCTCTA  3189