Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08479
• Subject: XM_017001621.1
• Aligned Length: 3837
• Identities: 3716
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296

Query  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370

Query  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATGCGCATCAGCCCGGGGCAGAGAGG  444

Query  445  AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAGGACCTAGGCTGGAGCTCCAGTGA  518

Query  519  GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCCAAGCACCGAG  592

Query  593  TGTCCTTCCAGCCC------------------------------------------------------------  606
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  593  TGTCCTTCCAGCCCAAGCTTTCTCCAGACCTGACTAGGCTAAAGGAGAGATACGCCAGGACTAAGAGAGACATC  666

Query  607  ---------------------------------------------------------AAGATGACCCAGCTCAT  623
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGGCTTTGAGAGTTGGGGGGAGAGACATGCAGGAGCTGAAGCACAAGTACGATTGTAAGATGACCCAGCTCAT  740

Query  624  GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCTGGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGTCTCCTTCC  814

Query  698  TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCACAGGAAGGACGTCCTCGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATC  888

Query  772  AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGCCCCCAGCCCCAGAGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCT  962

Query  846  GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGCTCCATCGTGCAGAGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCC  1036

Query  920  TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGATGGAGATGGAGCCCAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTG  1110

Query  994  CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACTGCCACTCCATGTTCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGA  1184

Query 1068  CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCTTCGTGGCCTCGTTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTG  1258

Query 1142  CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATGTCCATCATCAAGAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGC  1332

Query 1216  AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCCCAGACCGTGTCACCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCT  1406

Query 1290  TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGACATGCTGAAGAACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGG  1480

Query 1364  AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGACGCTGGCTGAGAAGCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAG  1554

Query 1438  AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT  1511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCGTCAGTGACCGCAGCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTT  1628

Query 1512  GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA  1585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACGGAGACCGTGTACGGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACA  1702

Query 1586  TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCTTGTCTGTGCCAACATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCC  1776

Query 1660  CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG  1733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGGGCCCAAGTATGTGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGG  1850

Query 1734  TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC  1807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGCACCTATGACAAGGACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTC  1924

Query 1808  AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG  1881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGAATAAGGTGTACCTCGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTG  1998

Query 1882  GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG  1955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGCAGATCACGCTTCTCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTG  2072

Query 1956  GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC  2029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTGCCTGGCCCTGCAGAGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGC  2146

Query 2030  TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC  2103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCTGCTTCCTGGGAAACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCC  2220

Query 2104  CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG  2177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGAGCAAGATTTCCTGGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTG  2294

Query 2178  GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT  2251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTATGCCCGGATGAGGACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCT  2368

Query 2252  TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC  2325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTCCTCCCGGGCACTCAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTC  2442

Query 2326  TCAGCCGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT  2399
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TCAGCAGTCAGCACCTCCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGT  2516

Query 2400  GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA  2473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGAAATCTTTTCCTTGAACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCA  2590

Query 2474  TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC  2547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGGAGTATATCCCGGAGCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCC  2664

Query 2548  ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC  2621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACGGTGCATCCAACCATCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCAC  2738

Query 2622  CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC  2695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCAGTGCCTGGTGAGCTGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGC  2812

Query 2696  TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC  2769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TCGCTGGCCTGCAGGATGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGC  2886

Query 2770  CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG  2843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CCTCCCGTGTGCCTGACTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAG  2960

Query 2844  CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG  2917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTGTGGGCCCCGGGTCACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACG  3034

Query 2918  AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC  2991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGGCAGTGAGCGTGACACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATC  3108

Query 2992  CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC  3065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CGCCTCTTCCACACTGAGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCC  3182

Query 3066  AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG  3139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGGCCAGAAGCACTTGTGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTG  3256

Query 3140  TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAT  3213
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3257  TCATCGTCCTGCTGCCCGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAAC  3330

Query 3214  GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA  3287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GGGCACTGTGGGCCTGTGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCA  3404

Query 3288  GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCC  3361
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 3405  GGAGGAGGCTGAGGGGCCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCC  3478

Query 3362  ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG  3435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  ACGTGGGCCGAGAGCTGACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCG  3552

Query 3436  GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC  3509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553  GGCCCGCTGCTCTCCATGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTC  3626

Query 3510  CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG  3583
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627  CATTTACGAGATGGCCGACGACCCCGACATCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGG  3700

Query 3584  AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG  3657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701  AGATTTGCTCTGTGGCCATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGG  3774

Query 3658  AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775  AGGCAGGCCCCGTGTGGGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3837