Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08495
• Subject: NM_018888.4
• Aligned Length: 899
• Identities: 783
• Gaps: 16

Alignment

Query   1  ATGGCGTTGCTGGTGCGAGTCCTTAGGAACCAGACTAGCATTTCTCAGTGGGTTCCAGTATGCAGCCGATTGAT  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.||.|
Sbjct   1  ATGGCGTTGCTGGTGCGAGTCCTTAGGAACCAGACTAGCATCTCTCAGTGGGTTCCAGTATGCAGCCAACTGGT  74

Query  75  ACCTGTGTCTCCTACCCAAGGACAGGGGGACAGGGCTCTGTCTCGCACTTCCCAGTGGCCCCAGATGAGCCAGT  148
           |.|.|||||||||||||||.|||||.||..||            |||||||||||||||.|||||.||..||||
Sbjct  75  ATCAGTGTCTCCTACCCAAAGACAGTGGAGCA------------GCACTTCCCAGTGGCTCCAGAAGAATCAGT  136

Query 149  CCCAAGCATGTGGT--GGATCAGAACAGATTCCTGGAATAGACATACAGCTGAATAGGAAGTATCACACCACAC  220
           |.|.||  ||||.|  |||||||||||||.|..||||...||||.|..||.|||||||||.||.||||.||||.
Sbjct 137  CTCGAG--TGTGTTTGGGATCAGAACAGACTGTTGGAGCGGACACAGCGCAGAATAGGAAATACCACAACACAA  208

Query 221  GTAAGCTTTCTACTACCAAAGATTCCCCACAGCCTGTTGAGGAGAAGGTTGGTGCTTTCACAAAGATAATAGAA  294
           ||||||||..|||||||.||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||
Sbjct 209  GTAAGCTTCTTACTACCCAAGATTTCCCACAGCCTGTTGAAGAGAAGGTCGGTCCCTTCACGAAGATAATAGAA  282

Query 295  GCCATGGGATTCACGGGACCTTTGAAATACAGTAAATGGAAGATTAAGATTGCGGCCCTGCGCATGTATACTAG  368
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 283  GCCATGGGATTCACTGGACCTTTGAAATACAGTAAATGGAAGATCAAGATCGCGGCCCTCCGCATGTACACGAG  356

Query 369  CTGTGTGGAGAAAACTGACTTCGAGGAATTCTTTCTAAGGTGTCAGATGCCTGATACATTCAATTCATGGTTTC  442
           |||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 357  CTGCGTGGAGAAGACTGACTTCGAGGAGTTCTTTCTGAGGTGTCAGATGCCCGATACATTCAACTCCTGGTTTC  430

Query 443  TTATAACCCTACTCCACGTCTGGATGTGTCTAGTCCGAATGAAGCAGGAAGGCCGGAGTGGGAAGTACATGTGT  516
           |.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct 431  TCATAACCCTGCTTCATGTCTGGATGTGTCTAGTCCGAATGAAGCAGGAAGGCCGGACTGGGAAGTACATGTGC  504

Query 517  CGTATCATAGTTCATTTTATGTGGGAGGATGTTCAGCAGCGCGGCAGAGTCATGGGGGTTAATCCCTATATCCT  590
           ||.||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||.|.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 505  CGGATCATAGTTCATTTCATGTGGGAAGATGTGGAGCAGCGCGGCCGCGTCATGGGGGTTAATTCCTATATCCT  578

Query 591  GAAGAAGAACATGATCCTCATGACAAATCATTTCTATGCAGCGATCTTGGGATATGATGAGGGGATCCTTTCAG  664
           .||||||||||||..|||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 579  AAAGAAGAACATGGCCCTCATGACGAACAATTTCTATGCAGCAATCTTGGGATACGATGAGGGGATCCTTTCAG  652

Query 665  ATGATCATGGGCTGGCCGCTGCCCTCTGGAGAACCTTCTTCAACCGGAAATGTGAAGACCCTCGACATCTTGAA  738
           ||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 653  ATGACCATGGCCTGGCTGCTGCGCTCTGGAGGACCTTCTTCAACCAGAAATGTGAGGACCCTCGACAGCTTGAA  726

Query 739  TTGCTGGTAGAGTATGTGAGGAAACAGATACAGTACCTGGACTCCATGAACGGGGAGGATCTGCTTCTGACAGG  812
           ||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 727  TTGCTGGTGGAATATGTGAGGAAACAGATGCAATACCTGGACTCCATGAACGGTGAGGATCTGCTGCTGACAGG  800

Query 813  GGAGGTGAGCTGGCGCCCTCTAGTGGAGAAGAATCCTCAGAGCATCCTGAAGCCCCATTCTCCGACTTACAACG  886
           |||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|
Sbjct 801  GGAAGTGAGATGGCGCCCTCTGGTGGAGAAGAATCCACAAAGCATCTTGAAGCCCCATGCTCCTACTTACAATG  874

Query 887  ACGAGGGACTT  897
           |.|||||.|||
Sbjct 875  ATGAGGGCCTT  885