Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08531
• Subject: NM_001317115.2
• Aligned Length: 1389
• Identities: 1387
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGGGTTTGGTGACGTTCGCCGACGTAGCCATAGACTTTTCTCAGGAGGAGTGGGCCTGTCTGAACTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAGGGTTTGGTGACGTTCGCCGACGTAGCCATAGACTTTTCTCAGGAGGAGTGGGCCTGTCTGAACTC  74

Query   75  TGCTCAGAGGGACCTGTACTGGGACGTGATGCTGGAGAACTACAGTAACTTGGTCTCACTGGATTTGGAGTCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCAGAGGGACCTGTACTGGGACGTGATGCTGGAGAACTACAGTAACTTGGTCTCACTGGATTTGGAGTCAG  148

Query  149  CATATGAAAATAAGAGTTTACCTACAAAAAAAAACATTCATGAAATAAGGGCTTCCAAAAGGAATTCAGATAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CATATGAAAATAAGAGTTTACCTACAGAAAAAAACATTCATGAAATAAGGGCTTCCAAAAGGAATTCAGATAGA  222

Query  223  AGAAGTAAATCCCTTGGCCGTAACTGGATATGTGAAGGTACGCTTGAAAGACCACAGCGCTCCAGAGGGAGGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAGTAAATCCCTTGGCCGTAACTGGATATGTGAAGGTACGCTTGAAAGACCACAGCGCTCCAGAGGGAGGTA  296

Query  297  TGTCAATCAGATGATCATCAATTATGTCAAAAGGCCTGCTACTAGAGAAGGCACCCCTCCTAGAACACATCAGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTCAATCAGATGATCATCAATTATGTCAAAAGACCTGCTACTAGAGAAGGCACCCCTCCTAGAACACATCAGA  370

Query  371  GACATCATAAGGAGAATTCCTTTGAATGTAAGGACTGTGGGAAGGCCTTTAGTCGTGGCTATCAACTTAGTCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACATCATAAGGAGAATTCCTTTGAATGTAAGGACTGTGGGAAGGCCTTTAGTCGTGGCTATCAACTTAGTCAA  444

Query  445  CATCAGAAAATCCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATGTAAGAAGGCCTTCCGTTGGGGCAATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATCAGAAAATCCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATGTAAGAAGGCCTTCCGTTGGGGCAATCA  518

Query  519  GCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTCGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGGGAGAAGCCCTACGAATGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTCGAT  592

Query  593  GGGGCTCAAGCCTCGTTATTCATAAGAGGATTCATACTGGTGAAAAACCCTATGAATGTAAAGACTGTGGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGGCTCAAGCCTCGTTATTCATAAGAGGATTCATACTGGTGAAAAACCCTATGAATGTAAAGACTGTGGAAAG  666

Query  667  GCCTTTCGGCGTGGTGATGAGCTCACTCAGCACCAGAGATTCCACACTGGGGAGAAAGACTACGAATGCAAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTTTCGGCGTGGTGATGAGCTCACTCAGCACCAGAGATTCCACACTGGGGAGAAAGACTACGAATGCAAAGA  740

Query  741  CTGTGGGAAGACCTTTAGCCGTGTGTATAAACTTATTCAGCACAAGAGAATTCATAGTGGGGAGAAGCCTTACG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGGGAAGACCTTTAGCCGTGTGTATAAACTTATTCAGCACAAGAGAATTCATAGTGGGGAGAAGCCTTACG  814

Query  815  AGTGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTATTTGTGGTTCAAGCCTCATTCAGCATAAAAGAATTCACACAGGTGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTGTAAAGACTGTGGGAAGGCTTTTATTTGTGGTTCAAGCCTCATTCAGCATAAAAGAATTCACACAGGTGAG  888

Query  889  AAACCCTATGAATGTCAAGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCGAGTCAATTACCTTACTCAGCATCAGAAGATCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACCCTATGAATGTCAAGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCGAGTCAATTACCTTACTCAGCATCAGAAGATCCA  962

Query  963  CACCGGTGAGAAGCCTCACGAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCCTTTCGCTGGGGTTCGAGCCTCGTTAAGCACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCGGTGAGAAGCCTCACGAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCCTTTCGCTGGGGTTCGAGCCTCGTTAAGCACG  1036

Query 1037  AGAGGATACATACGGGCGAGAAGCCGTACAAGTGCACAGAATGTGGGAAGGCCTTCAATTGTGGCTATCACCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGGATACATACGGGCGAGAAGCCGTACAAGTGCACAGAATGTGGGAAGGCCTTCAATTGTGGCTATCACCTC  1110

Query 1111  ACTCAGCACGAGAGAATCCACACAGGCGAAACCCCGTATAAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCTTTCATTTATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCAGCACGAGAGAATCCACACAGGCGAAACCCCGTATAAATGTAAGGAGTGTGGGAAGGCTTTCATTTATGG  1184

Query 1185  ATCGAGCCTCGTGAAACATGAGAGAATTCATACCGGGGTGAAACCCTATGGGTGTACAGAATGTGGGAAGAGCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATCGAGCCTCGTGAAACATGAGAGAATTCATACCGGGGTGAAACCCTATGGGTGTACAGAATGTGGGAAGAGCT  1258

Query 1259  TTAGTCACGGCCATCAGCTTACACAACATCAGAAAACGCACAGTGGGGCGAAATCCTACGAATGTAAGGAGTGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAGTCACGGCCATCAGCTTACACAACATCAGAAAACGCACAGTGGGGCGAAATCCTACGAATGTAAGGAGTGC  1332

Query 1333  GGGAAGGCATGTAACCACCTAAACCATCTCCGAGAACATCAGAGGATCCACAACAGT  1389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGAAGGCATGTAACCACCTAAACCATCTCCGAGAACATCAGAGGATCCACAACAGT  1389