Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08564
• Subject: NM_001199319.1
• Aligned Length: 915
• Identities: 768
• Gaps: 147

Alignment

Query   1  ATGAAGAGCGATTCTTCGACCTCTGCAGCCCCCCTCAGGGGGCTCGGGGGACCCCTGCGCAGCAGCGAGCCGGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAGCGATTCTTCGACCTCTGCAGCCCCCCTCAGGGGGCTCGGGGGACCCCTGCGCAGCAGCGAGCCGGT  74

Query  75  GCGCGCGGTCCCGGCCCGGGCGCCGGCCGTGGACCTTCTGGAGGAGGCGGCCGACCTCCTGGTGGTGCACCTGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GCGCGCGGTCCCGGCCCGGGCGCCGGCCGTGGACCTTCTGGAGGAGGCGGCCGACCTCCTGGTGGTGCACCTGG  148

Query 149  ACTTCCGGGCGGCGCTGGAGACCTGCGAGCGGGCCTGGCAGAGTCTGGCCAACCACGCCGTGGCAGAGGAACCC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTTCCGGGCGGCGCTGGAGACCTGCGAGCGGGCCTGGCAGAGTCTGGCCAACCACGCCGTGGCAGAGGAACCC  222

Query 223  GCGGGCACCTCATTGGAGGTGAAGTGCTCCCTGTGTGTTGTGGGGATCCAGGCCCTGGCAGAAATGGATCGGTG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCGGGCACCTCATTGGAGGTGAAGTGCTCCCTGTGTGTTGTGGGGATCCAGGCCCTGGCAGAAATGGATCGGTG  296

Query 297  GCAAGAAGTCCTCTCCTGGGTCCTTCAGTATTACCAGGTCCCTGAAAAGCTACCCCCCAAAGTCCTGGAGCTGT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GCAAGAAGTCCTCTCCTGGGTCCTTCAGTATTACCAGGTCCCTGAAAAGCTACCCCCCAAAGTCCTGGAGCTGT  370

Query 371  GCATTCTTTTATACAGCAAAATGCAAGAGCCTGGAGCTGTGCTGGATGTGGTGGGTGCCTGGCTCCAAGACCCA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GCATTCTTTTATACAGCAAAATGCAAGAGCCTGGAGCTGTGCTGGATGTGGTGGGTGCCTGGCTCCAAGACCCA  444

Query 445  GCCAATCAAAACCTTCCAGAATATGGAGCCTTGGCAGAATTTCACGTGCAGCGGGTGCTGCTGCCTCTGGGCTG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCCAATCAAAACCTTCCAGAATATGGAGCCTTGGCAGAATTTCACGTGCAGCGGGTGCTGCTGCCTCTGGGCTG  518

Query 519  CTTATCGGAGGCTGAGGAGCTAGTGGTGGGCTCTGCAGCCTTTGGTGAGGAGCGGCGACTGGATGTACTTCAGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CTTATCGGAGGCTGAGGAGCTAGTGGTGGGCTCTGCAGCCTTTGGTGAGGAGCGGCGACTGGATGTACTTCAGG  592

Query 593  CCATTCACACAGCGAGGCAGCAGCAGAAACAGGAACACTCAGGCTCTGAGGAGGCCCAGAAGCCAAACCTGGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 593  CCATTCACACAGCGAGGCAGCAGCAGAAACAGGAACACTCAGGCTCTGAGGAGGCCCAGAAGCCAAACCTGGA-  665

Query 667  GGCTCTGTCCCCCACAAGTTCCTGTCACTACCGATGTTGGTTCGCCAGCTTTGGGACTCTGCGGTGAGCCACTT  740
                                                                                     
Sbjct 666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 741  CTTTTCTCTGCCCTTCAAAAAGAGTCTCCTGGCTGCCTTGATCCTCTGTCTCCTGGTGGTGAGATTTGATCCAG  814
                                                                                   ||
Sbjct 666  ------------------------------------------------------------------------AG  667

Query 815  CTTCCCCTTCCTCCCTGCACTTCCTCTACAAGCTGGCCCAGCTCTTCCGCTGGATCCGGAAGGCTGCATTTTCT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668  CTTCCCCTTCCTCCCTGCACTTCCTCTACAAGCTGGCCCAGCTCTTCCGCTGGATCCGGAAGGCTGCATTTTCT  741

Query 889  CGCCTCTACCAGCTCCGCATCCGTGAC  915
           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742  CGCCTCTACCAGCTCCGCATCCGTGAC  768