Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08587
- Subject:
- NM_001145208.2
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1399
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG 74
Query 75 TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG 148
Query 149 TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG 222
Query 223 CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA 296
Query 297 CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG 370
Query 371 ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT 444
Query 445 GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA 518
Query 519 CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC 592
Query 593 TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT 666
Query 667 AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT 740
Query 741 GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT 814
Query 815 TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC 888
Query 889 AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC 962
Query 963 TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGATGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGAGGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC 1036
Query 1037 TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA 1110
Query 1111 GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAACT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1111 GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAAGT 1184
Query 1185 CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTC------------------- 1239
Query 1259 CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA 1332
Sbjct 1240 -------------------------------------------------------------------------- 1239
Query 1333 TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA 1406
Sbjct 1240 -------------------------------------------------------------------------- 1239
Query 1407 GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 -------------------CAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA 1294
Query 1481 GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC 1368
Query 1555 CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG 1587
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG 1401