Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08587
• Subject: NM_018369.3
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1585
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG  74

Query   75  TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG  148

Query  149  TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG  222

Query  223  CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA  296

Query  297  CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG  370

Query  371  ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT  444

Query  445  GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA  518

Query  519  CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC  592

Query  593  TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT  666

Query  667  AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT  740

Query  741  GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT  814

Query  815  TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC  888

Query  889  AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC  962

Query  963  TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGATGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGAGGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC  1036

Query 1037  TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA  1110

Query 1111  GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1111  GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAAGT  1184

Query 1185  CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG  1258

Query 1259  CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA  1332

Query 1333  TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA  1406

Query 1407  GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA  1480

Query 1481  GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC  1554

Query 1555  CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG  1587