Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08587
- Subject:
- XM_011543509.2
- Aligned Length:
- 1587
- Identities:
- 1539
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGGAGCATCGCATCGTGGGGCCCGGGCCGTACCGAGCTACCAGGCTGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG 74
.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGTGGAATGAGACCGTGGAGCTTTTTCG 29
Query 75 TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 TGCTAAGATGCCGTTACGGAAACATCGCTGTCGTTTCAAGAGCTATGAGCATTGTTTCACAGCGGCCGAAGCTG 103
Query 149 TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 TGGATTGGCTGCATGAGCTGCTGAGGTGCAGTCAAAACTTCGGCCCTGAAGTGACCCGCAAACAAACGGTCCAG 177
Query 223 CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 CTGCTAAAAAAATTCCTGAAGAATCACGTTATTGAAGACATCAAGGGAAAATGGGGTGAGGAAGATTTTGAAGA 251
Query 297 CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CAATCGTCACTTATACAGATTTCCTCCTTCTTCACCCCTGAAACCATATCCAAAGAAGCCCCCAAACCAAAAGG 325
Query 371 ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 ATGTTATTAAATTTCCAGAATGGAATGATCTCCCACCAGGCACTTCACAAGAGAACATCCCAGTGAGGCCAGTT 399
Query 445 GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GTGATGAATTCTGAGATGTGGTACAAGCGTCACAGTATTGCAATTGGAGAGGTGCCAGCTTGCCGTCTTGTCCA 473
Query 519 CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 CCGCAGACAGCTGACAGAGGCCAATGTAGAAGAGATATGGAAGTCTATGACATTATCATACTTACAGAAAATTC 547
Query 593 TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 TTGGCCTGGATTCCTTAGAAGAAGTTTTAGACGTCAAACTTGTCAATTCGAAGTTCATCATCCATAATGTATAT 621
Query 667 AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 AGTGTTAGCAAGCAGGGAGTTGTTATTCTTGATGACAAGTCAAAAGAACTTCCTCATTGGGTGCTGTCAGCTAT 695
Query 741 GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 GAAGTGTTTGGCAAATTGGCCCAACTGTTCTGATTTGAAGCAGCCTATGTACTTGGGATTTGAAAAAGATGTCT 769
Query 815 TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 TTAAAACCATAGCTGATTACTATGGTCACTTGAAAGAGCCTCTACTTACATTTCATCTTTTTGATGCTTTTGTC 843
Query 889 AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 AGTGTACTGGGTTTGTTACAGAAGGAGAAAGTGGCAGTTGAAGCATTTCAGATTTGCTGCCTTCTCCTACCTCC 917
Query 963 TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGATGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 TGAAAATAGGAGAAAGTTACAGCTATTGATGAGGATGATGGCAAGGATTTGCTTAAACAAAGAGATGCCACCCC 991
Query 1037 TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TGTGTGATGGCTTTGGTACCCGAACACTGATGGTTCAGACATTTTCCCGTTGCATCTTGTGTTCCAAGGATGAA 1065
Query 1111 GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAACT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1066 GTGGACTTGGATGAGTTATTAGCTGCTAGATTGGTAACGTTTCTGATGGACAATTACCAGGAAATTCTGAAAGT 1139
Query 1185 CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CCCTTTGGCCTTGCAGACCTCTATAGAGGAGCGTGTGGCTCATCTACGAAGAGTCCAGATAAAATACCCAGGAG 1213
Query 1259 CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 CTGATATGGATATCACTTTATCTGCTCCATCATTTTGCCGTCAAATTAGTCCAGAGGAATTTGAATATCAAAGA 1287
Query 1333 TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 TCATATGGCTCTCAGGAACCTCTGGCAGCCTTGTTGGAGGAAGTCATAACAGATGCCAAACTCTCCAACAAAGA 1361
Query 1407 GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 GAAAAAGAAGAAACTGAAGCAGTTTCAGAAATCCTATCCTGAAGTCTATCAAGAACGATTTCCTACACCAGAAA 1435
Query 1481 GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 GTGCAGCACTTCTGTTTCCTGAAAAACCCAAACCGAAACCACAGCTGCTAATGTGGGCACTAAAGAAGCCTTTC 1509
Query 1555 CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG 1587
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 CAACCATTTCAAAGAACTAGAAGTTTTCGAATG 1542