Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08597
Subject:
NM_001301831.1
Aligned Length:
491
Identities:
372
Gaps:
30

Alignment

Query   1  --------MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANSHHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHRRNHSQH  66
                   .|.|||.|.|.|.|||..|.||||||||||||||.||.||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   1  MEKRTSCSVQTSTNCDNSLEILNSAHQATGAVQMRIKNANSHQDRQSQTKSMILTDAGKVTEPISRHRRNHSQH  74

Query  67  ILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHKPESVDLC  140
           .|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||.||||.|..||||||
Sbjct  75  VLKDVIPPLEHPMVEKEGYLQKAKIADGGKKLRKNWSTSWIVLSGRKIEFYKDSKQQALPNMKTRHNVESVDLC  148

Query 141  GAHIEWAKEKSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTE  214
           ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||.|  ||||..|||||.|
Sbjct 149  GAHIEWAKEKSSRKSVFQITTVSGNEFLLQSDIDFLILDWFQAIKNAIDRLPKNPSCGS--LELFNLQRSSSSE  220

Query 215  LLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFITRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVCE  288
           |.||...|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 221  LPSHCHIDRKEQKPEHRKSFMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLKKFISRRPSLKTLQEKGLIKDQIFGSHLHTVCE  294

Query 289  RENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFREL  362
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  REHSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQEEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFREL  368

Query 363  PEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVPFGHLTK-IVAKASKNLMSTQ-SLGIVF  434
           .||||||||||.|||||||||.|..||...|||..|||||.||||..|.|||| |..|....|.|.| ......
Sbjct 369  SEPLFPYSFFERFVEAIKKQDSNEKIETMRSLVKRLPPPNHDTMKILFRHLTKFIIFKRTSFLISNQMGFSLIQ  442

Query 435  GPT-----LLRA-ENETGNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED  475
           .|.     |||| ...|.........|.....|.|            
Sbjct 443  TPAVSCSCLLRALHQRTCFLSRGRPFQDPASQLSL------------  477