Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08597
• Subject: XM_006498398.3
• Aligned Length: 1450
• Identities: 1198
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ------------------------ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTAC  50
                                    .||||||.|||||||||.|.|||.|..||..||||||.||||||||||.|
Sbjct    1  ATGGAGAAAAGGACAAGCTGCAGTGTGCAGACATCTACAAACTGTGACAACTCTCTGGAAATACTGAATTCTGC  74

Query   51  CCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCAAATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTA  124
            ||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||.||
Sbjct   75  CCACCAAGCTACAGGAGCTGTGCAAATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCAAGACAGGCAGAGCCAAACTA  148

Query  125  AATCCATGATCCTCACCGATGTCGGGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCAT  198
            |||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||                                 
Sbjct  149  AATCCATGATCCTCACCGATGCTGGGAAGGTCACTGAACCT---------------------------------  189

Query  199  ATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCATTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAAT  272
                                                |||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  190  ------------------------------------ATGGTTGAAAAAGAAGGGTATCTTCAAAAAGCCAAAAT  227

Query  273  TGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAGGAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAAT  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  228  TGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAGGAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTGGTCGAAAAATTGAAT  301

Query  347  TTTACAAAGAATCCAAGCAACAGGCTCTGTCC-AATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTG  419
            ||||||||||.||||||||.||.||||| ||| ||.||||||||..|||||||....|||||||||||||||||
Sbjct  302  TTTACAAAGACTCCAAGCAGCAAGCTCT-TCCTAACATGAAAACCAGGCACAACGTGGAAAGTGTGGATTTGTG  374

Query  420  TGGAGCACACATTGAATGGGCCAAGGAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAA  493
            |||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  375  TGGTGCACATATAGAATGGGCCAAAGAAAAATCAAGCAGAAAGAGTGTCTTTCAGATCACAACAGTGTCAGGAA  448

Query  494  ATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATATTGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGAC  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  449  ATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATATTGACTTCCTCATATTGGATTGGTTCCAAGCTATCAAAAATGCAATTGAC  522

Query  568  AGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTCCATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGA  641
            ||||||||||||.||.||||||||...||      ||||||.||.|||||..|.||.||||||||.||..||||
Sbjct  523  AGATTGCCAAAGAATCCAAGTTGTGGGTC------CCTGGAGTTGTTCAATTTGCAGAGATCCTCAAGTTCTGA  590

Query  642  ATTGCTAAGTCACTACGACAGTGATATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGC  715
            |.|||..|||||||.|.|||..||||.||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||..||||||
Sbjct  591  ACTGCCGAGTCACTGCCACATCGATAGAAAAGAACAGAAACCAGAACACAGGAAGTCCTTCATGTTTCGACTGC  664

Query  716  ATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGACAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCT  789
            |.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||..||.||||||||
Sbjct  665  ACCACAGTGCTTCTGATACAAGTGACAAGAATCGCGTGAAGAGCAGACTGAAGAAGTTCATCTCCAGAAGACCT  738

Query  790  TCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAGGACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGA  863
            ||.|||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  739  TCTCTGAAAACTTTGCAGGAAAAGGGACTCATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACACAGTGTGTGA  812

Query  864  ACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTG  937
            |||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  813  ACGAGAACATTCCACAGTTCCATGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAAAAAAGAGGCCTAGACGTTG  886

Query  938  ATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAATCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAG  1011
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ATGGAATTTATCGAGTTAGTGGCAATCTTGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAG  960

Query 1012  CTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGGAGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCT  1085
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CTGAATTTGGATGACAGCCAGTGGGAGGACATCCACGTCGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCT  1034

Query 1086  GCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGTTTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAA  1159
            |.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.|||...||
Sbjct 1035  GTCTGAACCGCTCTTCCCTTACAGTTTCTTTGAGCGGTTTGTGGAGGCGATCAAAAAACAAGACAGCAATGAAA  1108

Query 1160  GAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGTACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGA  1233
            .|||||||.||.|.|..|||||.|||.||...||||||||.|||||||.|||.|||||||||.|||.|||..||
Sbjct 1109  AAATTGAAACTATGAGGTCTCTGGTAAAACGTCTCCCTCCACCAAATCATGATACCATGAAAATCCTCTTCAGA  1182

Query 1234  CATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAGCCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACC  1307
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1183  CATCTAACCAAGATAGTGGCCAAAGCCTCCCAGAATCTCATGTCCACCCAAAGCTTGGGGATTGTGTTTGGACC  1256

Query 1308  TACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAAACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGC  1381
            .||||||||||||||.||||||||..||||.||..|.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.
Sbjct 1257  CACCCTTCTGCGAGCGGAAAATGAGTCAGGGAATGTAGCGGTCCACATGGTATACCAAAACCAGATAGCAGAGT  1330

Query 1382  TCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGATCTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1425
            |||||||||.|||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1331  TCATGCTGACTGAGTACGATAAGATCTTCAGCTCAGAGGAAGAC  1374