Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08597
• Subject: XM_006498400.3
• Aligned Length: 1434
• Identities: 1147
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AATGAGAATCAAAAATGCCAA---CAGC-CACCATGACA----GGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCAC  140
                          |||||.|   ||.| ||.||..|||    |||..|||   ||||           ||   
Sbjct    1  --------------ATGCCGAGTTCACCGCAGCAGCACAAGGGGGCAGAGC---AGTA-----------CT---  43

Query  141  CGATGTCGGGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCA  214
                     |.||.||||.|     ||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct   44  ---------GGAGATCACAG-----ATTTCCCGGCACAGAAGGAATCATTCACAGCATGTGTTGAAAGATGTCA  103

Query  215  TTCCTCCATTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAG  288
            ||||.|||.|.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  104  TTCCACCACTAGAACATCCAATGGTTGAAAAAGAAGGGTATCTTCAAAAAGCCAAAATTGCAGATGGAGGAAAG  177

Query  289  AAACTAAGGAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAA  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  178  AAACTAAGGAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTGGTCGAAAAATTGAATTTTACAAAGACTCCAA  251

Query  363  GCAACAGGCTCTGTCC-AATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAA  435
            |||.||.||||| ||| ||.||||||||..|||||||....||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  252  GCAGCAAGCTCT-TCCTAACATGAAAACCAGGCACAACGTGGAAAGTGTGGATTTGTGTGGTGCACATATAGAA  324

Query  436  TGGGCCAAGGAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACA  509
            ||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  TGGGCCAAAGAAAAATCAAGCAGAAAGAGTGTCTTTCAGATCACAACAGTGTCAGGAAATGAGTTCCTTCTACA  398

Query  510  GTCAGATATTGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATT  583
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  399  GTCAGATATTGACTTCCTCATATTGGATTGGTTCCAAGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGAATC  472

Query  584  CAAGTTGTCCATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTAC  657
            ||||||||...||      ||||||.||.|||||..|.||.||||||||.||..|||||.|||..|||||||.|
Sbjct  473  CAAGTTGTGGGTC------CCTGGAGTTGTTCAATTTGCAGAGATCCTCAAGTTCTGAACTGCCGAGTCACTGC  540

Query  658  GACAGTGATATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGA  731
            .|||..||||.||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||
Sbjct  541  CACATCGATAGAAAAGAACAGAAACCAGAACACAGGAAGTCCTTCATGTTTCGACTGCACCACAGTGCTTCTGA  614

Query  732  TACAAGCGACAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGC  805
            ||||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||..||.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  615  TACAAGTGACAAGAATCGCGTGAAGAGCAGACTGAAGAAGTTCATCTCCAGAAGACCTTCTCTGAAAACTTTGC  688

Query  806  AAGAAAAAGGACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACA  879
            |.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  689  AGGAAAAGGGACTCATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACACAGTGTGTGAACGAGAACATTCCACA  762

Query  880  GTTCCGTGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGT  953
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  763  GTTCCATGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAAAAAAGAGGCCTAGACGTTGATGGAATTTATCGAGT  836

Query  954  TAGTGGCAATCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACA  1027
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  837  TAGTGGCAATCTTGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGATGACA  910

Query 1028  GCCAGTGGGAGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTC  1101
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  911  GCCAGTGGGAGGACATCCACGTCGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGTCTGAACCGCTCTTC  984

Query 1102  CCTTACAGTTTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAA  1175
            |||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.|||...||.|||||||.||.|.|.
Sbjct  985  CCTTACAGTTTCTTTGAGCGGTTTGTGGAGGCGATCAAAAAACAAGACAGCAATGAAAAAATTGAAACTATGAG  1058

Query 1176  ATCTCTTGTACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGACATCTAACTAAGATAG  1249
            .|||||.|||.||...||||||||.|||||||.|||.|||||||||.|||.|||..||||||||||.|||||||
Sbjct 1059  GTCTCTGGTAAAACGTCTCCCTCCACCAAATCATGATACCATGAAAATCCTCTTCAGACATCTAACCAAGATAG  1132

Query 1250  TGGCCAAAGCCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCT  1323
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1133  TGGCCAAAGCCTCCCAGAATCTCATGTCCACCCAAAGCTTGGGGATTGTGTTTGGACCCACCCTTCTGCGAGCG  1206

Query 1324  GAAAATGAAACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTA  1397
            ||||||||..||||.||..|.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||.||||||
Sbjct 1207  GAAAATGAGTCAGGGAATGTAGCGGTCCACATGGTATACCAAAACCAGATAGCAGAGTTCATGCTGACTGAGTA  1280

Query 1398  CAGTAAGATCTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1425
            |..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1281  CGATAAGATCTTCAGCTCAGAGGAAGAC  1308