Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08606
- Subject:
- XM_011531184.3
- Aligned Length:
- 1904
- Identities:
- 1203
- Gaps:
- 694
Alignment
Query 1 ATGGGCATCCGAGGCATGCTGCGAGCCGCAGTGATCCTGCTGCTCATCAGGACCTGGCTCGCGGAGGGCAACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCATCCGAGGCATGCTGCGAGCCGCAGTGATCCTGCTGCTCATCAGGACCTGGCTCGCGGAGGGCAACTA 74
Query 75 CCCCAGTCCCATCCCGAAATTCCACTTCGAGTTCTCCTCTGCTGTGCCCGAAGTCGTCCTGAACCTCTTCAACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCCAGTCCCATCCCGAAATTCCACTTCGAGTTCTCCTCTGCTGTGCCCGAAGTCGTCCTGAACCTCTTCAACT 148
Query 149 GCAAAAATTGTGCAAATGAAGCTGTGGTTCAAAAGATTTTGGACAGGGTGCTGTCAAGATACGATGTCCGCCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAAAATTGTGCAAATGAAGCTGTGGTTCAAAAGATTTTGGACAGGGTGCTGTCAAGATACGATGTCCGCCTG 222
Query 223 AGACCGAATTTTGGAGGTGCCCCTGTGCCTGTGAGAATATCTATTTATGTCACGAGCATTGAACAGATCTCAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGACCGAATTTTGGAGGTGCCCCTGTGCCTGTGAGAATATCTATTTATGTCACGAGCATTGAACAGATCTCAGA 296
Query 297 AATGAATATGGACTACACGATCACGATGTTTTTTCATCAGACTTGGAAAGATTCACGCTTAGCATACTATGAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATGAATATGGACTACACGATCACGATGTTTTTTCATCAGACTTGGAAAGATTCACGCTTAGCATACTATGAGA 370
Query 371 CCACCCTGAACTTGACCCTGGACTATCGGATGCATGAGAAGTTGTGGGTCCCTGACTGCTACTTTCTGAACAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCACCCTGAACTTGACCCTGGACTATCGGATGCATGAGAAGTTGTGGGTCCCTGACTGCTACTTTCTGAACAGC 444
Query 445 AAGGATGCTTTCGTGCATGATGTGACTGTGGAGAATCGCGTGTTTCAGCTTCACCCAGATGGAACGGTGCGGTA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGGATGCTTTCGTGCATGATGTGACTGTGGAGAATCGCGTGTTTCAGCTTCACCCAGATGGAACGGTGCGGTA 518
Query 519 CGGCATCCGACTCACCACTACAGCAGCTTGTTCCCTGGATCTGCATAAATTCCCTATGGACAAGCAGGCCTGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGGCATCCGACTCACCACTACAGCAGCTTGTTCCCTGGATCTGCATAAATTCCCTATGGACAAGCAGGCCTGCA 592
Query 593 ACCTGGTGGTAGAGAGCTATGGTTACACGGTTGAAGACATCATATTATTCTGGGATGACAATGGGAACGCCATC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCTGGTGGTAGAGAGCTATGGTTACACGGTTGAAGACATCATATTATTCTGGGATGACAATGGGAACGCCATC 666
Query 667 CACATGACTGAGGAGCTGCATATCCCTCAGTTCACTTTCCTGGGAAGGACGATTACTAGCAAGGAGGTGTATTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACATGACTGAGGAGCTGCATATCCCTCAGTTCACTTTCCTGGGAAGGACGATTACTAGCAAGGAGGTGTATTT 740
Query 741 CTACACAGGTTCCTACATACGCCTGATACTGAAGTTCCAGGTTCAGAGGGAAGTTAACAGCTACCTTGTGCAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTACACAGGTTCCTACATACGCCTGATACTGAAGTTCCAGGTTCAGAGGGAAGTTAACAGCTACCTTGTGCAAG 814
Query 815 TCTACTGGCCTACTGTCCTCACCACTATTACCTCTTGGATATCGTTTTGGATGAACTATGATTCCTCTGCAGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTACTGGCCTACTGTCCTCACCACTATTACCTCTTGGATATCGTTTTGGATGAACTATGATTCCTCTGCAGCC 888
Query 889 AGGGTGACAATTGGCTTAACTTCAATGCTCATCCTGACCACCATCGACTCACATCTGCGGGATAAGCTCCCCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGGTGACAATTGGCTTAACTTCAATGCTCATCCTGACCACCATCGACTCACATCTGCGGGATAAGCTCCCCAA 962
Query 963 CATTTCCTGTATCAAGGCCATTGATATCTATATCCTCGTGTGCTTGTTCTTTGTGTTCCTGTCCTTGCTGGAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATTTCCTGTATCAAGGCCATTGATATCTATATCCTCGTGTGCTTGTTCTTTGTGTTCCTGTCCTTGCTGGAGT 1036
Query 1037 ATGTCTACATCAACTATCTTTTCTACAGTCGAGGACCTCGGCGCCAGCCTAGGCGACACAGGAGACCCCGAAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGTCTACATCAACTATCTTTTCTACAGTCGAGGACCTCGGCGCCAGCCTAGGCGACACAGGAGACCCCGAAGA 1110
Query 1111 GTCATTGCCCGCTACCGCTACCAGCAAGTGGTGGTAGGAAACGTGCAGGATGGCCTGATTAACGTGGAAGACGG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||| || |||
Sbjct 1111 GTCATTGCCCGCTACCGCTACCAGCAAGTGGTGGTAGGAAACGTGCAGGTTGG------TA---TGG------- 1168
Query 1185 AGTCAGCTCTCTCCCCATCACCCCAGCGCAGGCCCCCCTG-GCAAGCCCGGAAAGCCTCGGTTCTTTGACGTCC 1257
|| ||||||.| | |.||.||| |.|| ||| |.|
Sbjct 1169 -----GC---------------------CAGGCCTC---GAGAAATCCC----ACCC---------TGA--TAC 1198
Query 1258 AC-CTCC---GAGCAG---GCCCAGCTGGCCACCTCGGAAAGCCTCAGCCCACTCACTTCTCTCTCAGGCCAGG 1324
|| |||| |||.|| |
Sbjct 1199 ACTCTCCATGGAGAAGTATG------------------------------------------------------ 1218
Query 1325 CCCCCCTGGCCACTGGAGAAAGCCTGAGCGATCTCCCCTCCACCTCAGAGCAGGCCCGGCACAGCTATGGTGTT 1398
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1399 CGCTTTAATGGTTTCCAGGCTGATGACAGTATTATTCCTACCGAAATCCGCAACCGTGTCGAAGCCCATGGCCA 1472
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1473 TGGTGTTACCCATGACCATGAAGATTCCAATGAGAGCTTGAGCTCGGATGAGCGCCATGGCCATGGCCCCAGTG 1546
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1547 GGAAGCCCATGCTTCACCATGGCGAGAAGGGTGTGCAAGAAGCAGGCTGGGACCTTGATGACAACAATGACAAG 1620
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1621 AGCGACTGCCTTGCCATTAAGGAGCAATTCAAGTGTGATACTAACAGTACCTGGGGCCTTAATGATGATGAGCT 1694
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1695 CATGGCCCATGGCCAAGAGAAGGACAGTAGCTCAGAGTCTGAGGATAGTTGCCCCCCAAGCCCTGGGTGCTCCT 1768
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1769 TCACTGAAGGGTTCTCCTTCGATCTCTTTAATCCTGACTACGTCCCAAAGGTCGACAAGTGGTCCCGGTTCCTC 1842
Sbjct 1219 -------------------------------------------------------------------------- 1218
Query 1843 TTCCCTCTGGCCTTTGGGTTGTTCAACATTGTTTACTGGGTATACCATATGTAT 1896
Sbjct 1219 ------------------------------------------------------ 1218
