Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08608
- Subject:
- NM_001323621.1
- Aligned Length:
- 2832
- Identities:
- 2786
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGACTGTGAGTGGTCCAGGGACCCCCGAGCCCCGGCCGGCCACCCCCGGGGCCAGCTCAGTGGAGCAGCTGCG 74
|||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACT---------------------------------------------GCCAGCTCAGTGGAGCAGCTGCG 29
Query 75 GAAGGAGGGCAATGAGCTGTTCAAATGTGGAGACTACGGGGGCGCCCTGGCGGCCTACACTCAGGCCCTGGGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 GAAGGAGGGCAATGAGCTGTTCAAATGTGGAGACTACGGGGGCGCCCTGGCGGCCTACACTCAGGCCCTGGGTC 103
Query 149 TGGACGCGACGCCCCAGGACCAGGCCGTTCTGCACCGGAACCGGGCCGCCTGCCACCTCAAGCTGGAAGATTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 TGGACGCGACGCCCCAGGACCAGGCCGTTCTGCACCGGAACCGGGCCGCCTGCCACCTCAAGCTGGAAGATTAC 177
Query 223 GACAAAGCAGAAACAGAGGCATCCAAAGCCATTGAAAAGGATGGTGGGGATGTCAAAGCACTCTACCGGCGGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GACAAAGCAGAAACAGAGGCATCCAAAGCCATTGAAAAGGATGGTGGGGATGTCAAAGCACTCTACCGGCGGAG 251
Query 297 CCAAGCCCTAGAGAAGCTGGGCCGCCTGGACCAGGCTGTCCTTGACCTGCAGAGATGTGTGAGCTTGGAGCCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CCAAGCCCTAGAGAAGCTGGGCCGCCTGGACCAGGCTGTCCTTGACCTGCAGAGATGTGTGAGCTTGGAGCCCA 325
Query 371 AGAACAAAGTTTTCCAGGAGGCCTTGCGGAACATCGGGGGCCAGATTCAGGAGAAGGTGCGATACATGTCCTCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 AGAACAAAGTTTTCCAGGAGGCCTTGCGGAACATCGGGGGCCAGATTCAGGAGAAGGTGCGATACATGTCCTCG 399
Query 445 ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA 473
Query 519 GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC 547
Query 593 AGCTCTTGCAACGTTTACTCGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT 666
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 AGCTCTTGCAACGTTTACTGGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT 621
Query 667 TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG 695
Query 741 CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG 769
Query 815 TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT 843
Query 889 AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA 917
Query 963 AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA 991
Query 1037 AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC 1065
Query 1111 GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG 1139
Query 1185 TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT 1213
Query 1259 GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT 1287
Query 1333 CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA 1361
Query 1407 GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA 1435
Query 1481 TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT 1509
Query 1555 GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC 1583
Query 1629 TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG 1657
Query 1703 CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG 1731
Query 1777 CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA 1805
Query 1851 GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG 1879
Query 1925 CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG 1953
Query 1999 CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954 CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG 2027
Query 2073 GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA 2101
Query 2147 CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG 2175
Query 2221 TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2176 TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA 2249
Query 2295 GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA 2323
Query 2369 TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC 2397
Query 2443 CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC 2471
Query 2517 CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2472 CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC 2545
Query 2591 TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC 2619
Query 2665 ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2620 ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC 2693
Query 2739 TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC 2767
Query 2813 AACCCAACCAAGATGGAGAG 2832
||||||||||||||||||||
Sbjct 2768 AACCCAACCAAGATGGAGAG 2787