Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08608
• Subject: XM_024449985.1
• Aligned Length: 2832
• Identities: 2396
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  ATGACTGTGAGTGGTCCAGGGACCCCCGAGCCCCGGCCGGCCACCCCCGGGGCCAGCTCAGTGGAGCAGCTGCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGGAGGGCAATGAGCTGTTCAAATGTGGAGACTACGGGGGCGCCCTGGCGGCCTACACTCAGGCCCTGGGTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGACGCGACGCCCCAGGACCAGGCCGTTCTGCACCGGAACCGGGCCGCCTGCCACCTCAAGCTGGAAGATTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACAAAGCAGAAACAGAGGCATCCAAAGCCATTGAAAAGGATGGTGGGGATGTCAAAGCACTCTACCGGCGGAG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCAAGCCCTAGAGAAGCTGGGCCGCCTGGACCAGGCTGTCCTTGACCTGCAGAGATGTGTGAGCTTGGAGCCCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGAACAAAGTTTTCCAGGAGGCCTTGCGGAACATCGGGGGCCAGATTCAGGAGAAGGTGCGATACATGTCCTCG  444
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATGTCCTCG  9

Query  445  ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   10  ACGGATGCCAAAGTGGAACAGATGTTTCAGATACTGTTGGACCCAGAAGAGAAGGGCACTGAGAAAAAGCAAAA  83

Query  519  GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  GGCTTCTCAGAACCTGGTGGTGCTGGCCAGGGAGGATGCTGGAGCGGAGAAGATCTTCCGGAGTAATGGGGTTC  157

Query  593  AGCTCTTGCAACGTTTACTCGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  AGCTCTTGCAACGTTTACTGGACATGGGAGAGACTGACCTCATGCTGGCGGCTCTGCGTACGCTGGTTGGCATT  231

Query  667  TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  TGCTCTGAGCATCAGTCACGGACAGTGGCAACCCTGAGCATACTGGGAACTCGGCGAGTAGTCTCCATCCTGGG  305

Query  741  CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  CGTGGAAAGCCAGGCTGTGTCCCTGGCTGCCTGCCACCTGCTGCAGGTTATGTTTGATGCCCTCAAGGAAGGTG  379

Query  815  TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  TCAAAAAAGGCTTCCGAGGCAAAGAAGGTGCCATCATTGTGGATCCTGCCCGGGAGCTGAAGGTCCTCATCAGT  453

Query  889  AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  AACCTCTTAGATCTGCTGACAGAGGTGGGGGTCTCTGGCCAAGGCCGAGACAATGCCCTGACCCTCCTGATTAA  527

Query  963  AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  AGCGGTGCCCCGGAAGTCTCTCAAGGACCCCAACAACAGCCTCACCCTCTGGGTCATCGACCAAGGTCTGAAAA  601

Query 1037  AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  AGATTTTGGAAGTGGGGGGCTCTCTACAGGACCCTCCTGGGGAGCTCGCAGTGACCGCAAACAGCCGCATGAGC  675

Query 1111  GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  GCCTCTATTCTCCTCAGCAAGCTCTTTGATGACCTCAAGTGTGATGCGGAGAGGGAGAATTTCCACAGACTTTG  749

Query 1185  TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  TGAAAACTACATCAAGAGCTGGTTTGAGGGCCAAGGGCTGGCCGGGAAGCTACGGGCCATCCAGACGGTGTCCT  823

Query 1259  GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  GCCTCCTGCAGGGCCCATGTGACGCTGGCAACCGGGCCTTGGAGCTGAGCGGTGTCATGGAGAGTGTGATTGCT  897

Query 1333  CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  CTGTGTGCCTCTGAGCAGGAGGAGGAGCAGCTGGTGGCCGTGGAGGCTCTGATCCATGCAGCCGGCAAGGCTAA  971

Query 1407  GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  972  GCGGGCCTCATTCATCACTGCCAATGGTGTCTCGCTGCTGAAGGACCTATATAAGTGCAGCGAGAAGGACAGCA  1045

Query 1481  TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046  TCCGCATCCGGGCGCTAGTGGGACTCTGTAAGCTCGGTTCGGCTGGAGGGACTGACTTCAGCATGAAGCAGTTT  1119

Query 1555  GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120  GCTGAAGGCTCCACTCTCAAACTGGCTAAGCAGTGTCGAAAGTGGCTGTGCAATGACCAGATCGACGCAGGCAC  1193

Query 1629  TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194  TCGGCGCTGGGCAGTGGAGGGCCTGGCTTACCTGACCTTTGATGCCGACGTGAAGGAAGAGTTTGTGGAGGATG  1267

Query 1703  CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268  CGGCTGCTCTGAAAGCTCTGTTCCAGCTCAGCAGGTTGGAGGAGAGGTCAGTGCTCTTTGCGGTGGCCTCAGCG  1341

Query 1777  CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1342  CTGGTGAACTGCACCAACAGCTATGACTACGAGGAGCCCGACCCCAAGATGGTGGAGCTGGCCAAGTATGCCAA  1415

Query 1851  GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416  GCAGCATGTGCCCGAGCAGCACCCCAAGGACAAGCCAAGCTTCGTGCGGGCTCGGGTGAAGAAGCTGCTGGCAG  1489

Query 1925  CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490  CGGGTGTGGTGTCGGCCATGGTGTGCATGGTGAAGACGGAGAGCCCTGTGCTGACCAGTTCCTGCAGAGAGCTG  1563

Query 1999  CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564  CTCTCCAGGGTCTTCTTGGCTTTAGTGGAAGAGGTAGAGGACCGAGGCACTGTGGTTGCCCAGGGAGGCGGCAG  1637

Query 2073  GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638  GGCGCTGATCCCGCTGGCCCTGGAAGGCACGGACGTGGGGCAGACAAAGGCAGCCCAGGCCCTTGCCAAGCTCA  1711

Query 2147  CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712  CCATCACCTCCAACCCGGAGATGACCTTCCCTGGCGAGCGGATCTATGAGGTGGTCCGGCCCCTCGTCTCCCTG  1785

Query 2221  TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786  TTGCACCTCAACTGCTCAGGCCTGCAGAACTTCGAGGCGCTCATGGCCCTAACAAACCTGGCTGGGATCAGCGA  1859

Query 2295  GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860  GAGGCTCCGGCAGAAGATCCTGAAGGAGAAGGCTGTGCCCATGATAGAAGGCTACATGTTTGAGGAGCATGAGA  1933

Query 2369  TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934  TGATCCGCCGGGCAGCCACGGAGTGCATGTGTAACTTGGCCATGAGCAAGGAGGTGCAGGACCTCTTCGAAGCC  2007

Query 2443  CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2008  CAGGGCAATGACCGACTGAAGCTGCTGGTGCTGTACAGTGGAGAGGATGATGAGCTGCTACAGCGGGCAGCTGC  2081

Query 2517  CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082  CGGGGGCTTGGCCATGCTTACCTCCATGCGGCCCACGCTCTGCAGCCGCATTCCCCAAGTGACCACACACTGGC  2155

Query 2591  TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156  TGGAGATCCTGCAGGCCCTGCTTCTGAGCTCCAACCAGGAGCTGCAGCACCGGGGTGCTGTGGTGGTGCTGAAC  2229

Query 2665  ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2230  ATGGTGGAGGCCTCGAGGGAGATTGCCAGCACCCTGATGGAGAGTGAGATGATGGAGATCTTGTCAGTGCTAGC  2303

Query 2739  TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304  TAAGGGTGACCACAGCCCTGTCACAAGGGCTGCTGCAGCCTGCCTGGACAAAGCAGTGGAATATGGGCTTATCC  2377

Query 2813  AACCCAACCAAGATGGAGAG  2832
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2378  AACCCAACCAAGATGGAGAG  2397