Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08646
• Subject: NM_001173552.1
• Aligned Length: 1311
• Identities: 1189
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGTTACAGGATCCTGAGAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC  74
            ||      |||||||||.|||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct    1  AT------GGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCG-------------------------------  37

Query   75  CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG  148
                                                                                      
Sbjct   38  --------------------------------------------------------------------------  37

Query  149  TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  222
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ---------TCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  102

Query  223  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  176

Query  297  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  250

Query  371  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  324

Query  445  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  398

Query  519  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  472

Query  593  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  546

Query  667  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  620

Query  741  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  694

Query  815  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  768

Query  889  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC  842

Query  963  CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG  916

Query 1037  CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG  990

Query 1111  ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC  1064

Query 1185  TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA  1138

Query 1259  CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCTGAGCTG  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCTGAGCTG  1191