Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08646
• Subject: XM_011542903.3
• Aligned Length: 1335
• Identities: 987
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGTTACAGGATCCTGAGAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC  74

Query   75  CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG  148

Query  149  TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  222

Query  223  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  296

Query  297  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  370

Query  371  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  444

Query  445  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  518

Query  519  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  592

Query  593  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  666

Query  667  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  740

Query  741  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  814

Query  815  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  888

Query  889  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGG---CCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCC  959
            ||||||||||||||||||||||     .|||||   ||||.|||               ||.||          
Sbjct  889  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAG-----ATCAGGATTCCCAACTG---------------TGGGG----------  932

Query  960  AGCCACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGA---------------------GGGA  1012
             .||||...||.||||..|.|||||           |||| |||  |||                     ||||
Sbjct  933  -TCCACAAGACACTGGCCCCTTGGA-----------GAAG-AGA--GGATTCCATTGTCAAATAAGTTTGGGGA  991

Query 1013  AGATGTCTGACATACTGCTGCAGGCGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTAC  1086
            |.||   |..||||||                          |||||.|.|                |.|.|  
Sbjct  992  ACAT---TTTCATACT--------------------------ACAGCTCCC----------------TTCTT--  1018

Query 1087  CAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATGATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAG  1160
                 ||||  |||  |..||.|.||                                                
Sbjct 1019  -----GGAA--CAC--ATTAGTTTAT------------------------------------------------  1035

Query 1161  TGGTGGGCCCCTGATGTACCAATCTGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGG  1234
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1235  GCCCGAGCACCCCAGGAGTATACACCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCTGAG  1308
                                                                                      
Sbjct 1036  --------------------------------------------------------------------------  1035

Query 1309  CTG  1311
               
Sbjct 1036  ---  1035