Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08654
• Subject: XM_011529662.2
• Aligned Length: 1389
• Identities: 1127
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCATCACGGCTCTATCTGTGGCCCCCAAAGGCTGGGTGCCAGCTGCCTGTCGGCAGGGAGCGTATCACCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGCACGTCCATGCCGTGGGGGTCACTCAGCAGCCACGGATGCGCCCTGGGTGCTGTCCCGGGGCCGTCTCAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCACCGCGCTGGACCGGCTGGGCCAGATGCCATGGGATTCTGTGTTTGTGAACCTCTAGAAAAGGACGGCTGT  222

Query    1  ---------------------------------------ATGGGCCTGCTGGCCTTCCTGAAGACCCAGTTCGT  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCAGCGAGGGGCCGTGCACCCGCTCCTGAGCAGCGCCATGGGCCTGCTGGCCTTCCTGAAGACCCAGTTCGT  296

Query   36  GCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGGTCTGGTCATCAACTTCGTCCAGCTGTGCACGCTGG  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGGTCTGGTCATCAACTTCGTCCAGCTGTGCACGCTGG  370

Query  110  CGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCAACTGCCGCCTCGCCTACTCACTCTGGAGCCAACTG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCAACTGCCGCCTCGCCTACTCACTCTGGAGCCAACTG  444

Query  184  GTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCACGGTAGAGCGCTTTGG  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCACGGTAGAGCGCTTTGG  518

Query  258  GAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTGTGAGC  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGTGGACCATGTGTGAGC  592

Query  332  GCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTATGTGCCCCTCATCGGCTGGACG  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGTGCCCCTCATCGGCTGGACG  666

Query  406  TGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGTGGTCGAAGGGCTGAG  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGTGGTCGAAGGGCTGAG  740

Query  480  GCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCTTCACGGAGACCAAGC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCTTCACGGAGACCAAGC  814

Query  554  ACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGCCGCGGACCAAG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTGCTGCCGCGGACCAAG  888

Query  628  GGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAACCCTGAACTTCAGAGG  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAACCCTGAACTTCAGAGG  962

Query  702  AAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGTGCGTGAGGAGATTTC  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGTGCGTGAGGAGATTTC  1036

Query  776  CTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTACCAGGAGAAGGACGCG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTACCAGGAGAAGGACGCG  1110

Query  850  CTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGGCCGTGGACCCT  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCGGAGGCCGTGGACCCT  1184

Query  924  CCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGTCTTTGCCAGCG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGGGCGTCTTTGCCAGCG  1258

Query  998  GATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCAGACTGATAGGA  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTTCGCAGACTGATAGGA  1332

Query 1072  GTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1128
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1389