Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08654
• Subject: XM_017028408.1
• Aligned Length: 1330
• Identities: 1015
• Gaps: 314

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGTGGTTTCTGCTCTTGCCTCTCTGGGTTTTTGTTTCACTTCGGTCGAGTTTTTGGTGGTGTTGAGCGGAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCCGGGGAAGTTGGAGTCTTGTTTGTGGCCGCCTCGTGCTCGTGTCTGTATCTAAGATCCTCAGGCTGCTCCT  148

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGGCCTGCTGGCCTTCCT  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTGGGACGGCTGTCCTCAGCGAGGGGCCGTGCACCCGCTCCTGAGCAGCGCCATGGGCCTGCTGGCCTTCCT  222

Query   21  GAAGACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTGGTGAGTGGTCTGGTCATCAACTTCGTCC  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  223  GAAGACCCAGTTCGTGCTGCACCTGCTGGTCGGCTTTGTCTTCGTG----------------------------  268

Query   95  AGCTGTGCACGCTGGCGCTCTGGCCGGTCAGCAAGCAGCTCTACCGCCGCCTCAACTGCCGCCTCGCCTACTCA  168
                                                                                      
Sbjct  269  --------------------------------------------------------------------------  268

Query  169  CTCTGGAGCCAACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCAC  242
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  ----------AACTGGTCATGCTGCTGGAGTGGTGGTCCTGCACGGAGTGTACACTGTTCACGGACCAGGCCAC  332

Query  243  GGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGT  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  GGTAGAGCGCTTTGGGAAGGAGCACGCAGTCATCATCCTCAACCACAACTTCGAGATCGACTTCCTCTGTGGGT  406

Query  317  GGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTATGTGCCC  390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  407  GGACCATGTGTGAGCGCTTCGGAGTGCTGGGGAGCTCCAAGGTCCTCGCTAAGAAGGAGCTGCTCTACGTGCCC  480

Query  391  CTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGT  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  CTCATCGGCTGGACGTGGTACTTTCTGGAGATTGTGTTCTGCAAGCGGAAGTGGGAGGAGGACCGGGACACCGT  554

Query  465  GGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCT  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GGTCGAAGGGCTGAGGCGCCTGTCGGACTACCCCGAGTACATGTGGTTTCTCCTGTACTGCGAGGGGACGCGCT  628

Query  539  TCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTG  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  TCACGGAGACCAAGCACCGCGTTAGCATGGAGGTGGCGGCTGCTAAGGGGCTTCCTGTCCTCAAGTACCACCTG  702

Query  613  CTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAAC  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  CTGCCGCGGACCAAGGGCTTCACCACCGCAGTCAAGTGCCTCCGGGGGACAGTCGCAGCTGTCTATGATGTAAC  776

Query  687  CCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGT  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  CCTGAACTTCAGAGGAAACAAGAACCCGTCCCTGCTGGGGATCCTCTACGGGAAGAAGTACGAGGCGGACATGT  850

Query  761  GCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTAC  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  GCGTGAGGAGATTTCCTCTGGAAGACATCCCGCTGGATGAAAAGGAAGCAGCTCAGTGGCTTCATAAACTGTAC  924

Query  835  CAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCG  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  CAGGAGAAGGACGCGCTCCAGGAGATATATAATCAGAAGGGCATGTTTCCAGGGGAGCAGTTTAAGCCTGCCCG  998

Query  909  GAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGG  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  GAGGCCGTGGACCCTCCTGAACTTCCTGTCCTGGGCCACCATTCTCCTGTCTCCCCTCTTCAGTTTTGTCTTGG  1072

Query  983  GCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTT  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  GCGTCTTTGCCAGCGGATCACCTCTCCTGATCCTGACTTTCTTGGGGTTTGTGGGAGCAGCTTCCTTTGGAGTT  1146

Query 1057  CGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  CGCAGACTGATAGGAGTAACTGAGATAGAAAAAGGCTCCAGCTACGGAAACCAAGAGTTTAAGAAAAAGGAA  1218