Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08657
- Subject:
- NM_019943.2
- Aligned Length:
- 1931
- Identities:
- 1635
- Gaps:
- 25
Alignment
Query 1 ATGATGCCGTTTCCGGTGACAACCCAGGGACCACCGCAGCCGGC-GCCGCCGCCGAATCGCTACGGCGTCTCCT 73
||||||||.|||.|||||||.|||||.|||.|||..||.||||| .||||| |||||.|..|.||||.|.||.|
Sbjct 1 ATGATGCCATTTGCGGTGACCACCCAAGGAGCACAACAACCGGCTCCCGCC-CCGAAGCAGTTCGGCATATCGT 73
Query 74 CGCCTATCAGTCTAGCGGTCCCCAAGGAGACGGACTGCCTCCTCACCCAGAGGCTAATAGAAACCCTCAGGCCC 147
|.||.|||||.||.||.|.|||||||||.||.|||.||...||||||||||.|||.||.||.||||||..||||
Sbjct 74 CCCCCATCAGCCTGGCCGCCCCCAAGGACACAGACCGCGAACTCACCCAGAAGCTGATCGAGACCCTCCAGCCC 147
Query 148 TTCGGGGTCTTCGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAGTTTTGGACAAATTAAATAATCTGGTAAA 221
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||.||
Sbjct 148 TTCGGGGTGTTTGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAATTTTGCAGAAATTAAATAATCTGGTGAA 221
Query 222 GGAATGGATACGCGAAATCAGTGAAAGCAAGAGTCTTCCCCAGTCTGTAATTGAAAACGTTGGAGGAAAGATTT 295
|||||||||.||.||||||||||||||||.||.||||||.||..||||||||||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct 222 GGAATGGATCCGAGAAATCAGTGAAAGCAGGAATCTTCCACAAGCTGTAATTGAGAATGTTGGGGGGAAAATTT 295
Query 296 TTACGTTTGGCTCTTACAGATTAGGAGTACATACGAAAGGCGCAGATATTGACGCCTTGTGCGTTGCACCAAGT 369
|||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 296 TTACGTTCGGCTCTTACCGATTAGGAGTACACACGAAAGGTGCAGATATCGATGCTTTGTGCGTTGCACCAAGA 369
Query 370 CATGTGGATCGAAGCGACTTTTTCACCTCATTCTATGCTAAACTGAAACTACAGGAGGAAGTGAAAGATTTAAG 443
||.||||||||||..||||||||||||||.|||||||..|||.||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 370 CACGTGGATCGAAATGACTTTTTCACCTCCTTCTATGACAAATTGAAACTACAAGAGGAAGTAAAAGATTTAAG 443
Query 444 GGCTGTCCAGGAGGCATTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGATATTTTATTTGCAA 517
.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 444 AGCTGTTGAGGAGGCCTTTGTGCCGGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGAATAGAGATTGATATTTTGTTTGCAA 517
Query 518 GATTAGCACTACAGACTATTCCAGAAGATTTGGACTTAAGAGATGACAGTCTACTTAAAAATTTAGACATTAGA 591
||||||||.|.||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 518 GATTAGCATTGCAGACTATTCCAGAAGATTTGGACCTACGAGATGATAGTCTGCTTAAAAATTTAGATATTAGG 591
Query 592 TGCATAAGAATCCTTAATGGTTGCCGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTGCCAAACATTGACAACTTCAG 665
||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 592 TGCATAAGAAGCCTTAACGGTTGCCGGGTAACTGATGAGATTTTACATCTAGTACCAAACATTGACAGCTTCAG 665
Query 666 GCTGACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAGTGCCACAATATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGAG 739
|.|.||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 666 GTTAACACTGAGAGCCATCAAATTATGGGCCAAATGCCACAACATCTATTCCAATATATTGGGTTTCCTTGGAG 739
Query 740 GTGTTTCCTGGGCCATGCTAGTAGCAAGAACTTGTCAGCTTTATCCAAATGCAGTAGCGTCAACTCTTGTACGG 813
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||.
Sbjct 740 GTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTACCCAAATGCAATAGCATCCACTCTTGTGCGA 813
Query 814 AAATTCTTCTTGGTATTTTCAGAATGGGAATGGCCAAACCCAGTGTTACTGAAGGAGCCTGAAGAACGGAATCT 887
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||..|.||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 814 AAATTTTTCTTGGTGTTTTCTGAGTGGGAATGGCCAAATCCAGTGTTGTTAAAAGAACCAGAAGAACGAAATCT 887
Query 888 TAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGAGTAAATCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATCATCACACCAGCAT 961
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 888 TAACTTGCCTGTATGGGACCCAAGAGTGAATCCTAGTGACAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCAT 961
Query 962 ACCCACAGCAGAACTCCACATACAACGTGTCTATTTCAACCAGGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAGGGG 1035
|||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 962 ACCCACAGCAGAACTCCACGTACAATGTGTCTGTTTCGACCAGGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAAGGA 1035
Query 1036 CTTGCTATCACACACGAGATTTTGCTAAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTCTTTGAAGCTCCAAGCTTCTTTCA 1109
||||||||||||||.||.|||.||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036 CTTGCTATCACACATGAAATTCTGCTGAATAAGGCAGAATGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCAAGCTTTTTTCA 1109
Query 1110 AAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCATCAACAGAAAAACAACATTTAGAATGGGTGGGCTTGG 1183
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110 AAAATACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCGCCAACAGAGAAACAACATTTAGAGTGGGTGGGCTTGG 1183
Query 1184 TGGAATCAAAGATCCGAATCCTGGTTGGGAGCTTGGAGAAGAATGAATTTATTACACTGGCACATGTGAATCCA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1184 TGGAATCAAAGATCCGAATCCTGGTTGGGAGCCTGGAAAAGAATGAGTTCATTACTCTGGCTCATGTGAATCCT 1257
Query 1258 CAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGATATGGAAGAATTTCGTACAATGTGGGTGATTGGGTTAGGGCT 1331
|||||.|||||||||||.|||||||.|.||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|
Sbjct 1258 CAGTCGTTTCCAGCACCAAAAGAAACTGCTGACAAGGAAGAATTTCGTACTATGTGGGTGATCGGGTTAGTGTT 1331
Query 1332 AAAAAAGCCAGATAATTCTGAAATTCTCAGCATTGATCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGATACTGTTT 1405
.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1332 GAAGAAGCCAGAAAACTCTGAAATTCTCAGTATTGATCTCACCTATGATATTCAGTCTTTCACAGATACAGTGT 1405
Query 1406 ATAGGCAAGCAGTGAATAGTAAGATGTTTGAGATGGGTATGAAAATTACTGCAGTGCATTTAAGAAGAAAGGAA 1479
|.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||.|||||.|||||||.||||||
Sbjct 1406 ACAGACAAGCAATAAATAGTAAGATGTTTGAGATGGATATGAAGATTGCTGCAATGCATCTAAGAAGGAAGGAA 1479
Query 1480 CTTCACCAGCTGCTGCCTCATCATGTGCTTCAGGACAAGAAAGCACACTCAACAGAAGGTAGAAGATTGACAGA 1553
|||||.|||||.||.||..|||||||.||||||.|.|||.||.|.||.|.|||||||.||..|||..||||||.
Sbjct 1480 CTTCATCAGCTACTTCCAAATCATGTTCTTCAGAAAAAGGAAACCCATTTAACAGAAAGTGTAAGGCTGACAGC 1553
Query 1554 TTTGAACGACAGCAGCTTTGACTTGTCTGCAGGCTGTGAAAACAGCATGTCTGTGCCTTCATCTACTAGCACTA 1627
|.|||..|||||||||.||..|||||||..||.|.||||||||||||||.|||..||||||.|||||.||||||
Sbjct 1554 TGTGACTGACAGCAGCCTTCTCTTGTCTATAGACAGTGAAAACAGCATGACTGCTCCTTCACCTACTGGCACTA 1627
Query 1628 TGAAGACAGGCCCATTGATTAGCAGTTCTCAGGGTAGAAACAGTCCTGCCTTGGCTGTAATGACAGCATCTGTG 1701
||||||||||.|||.|||.|.|.|...|||||||.||||||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1628 TGAAGACAGGTCCACTGACTGGAAACCCTCAGGGCAGAAACAGTCCTGCTCTGGCTGTTATGGCAGCATCTGTG 1701
Query 1702 GCTAACATACAGGCTACTGAATTTTCCTTGCAACAGGTGAATACCAATGAAAGTTCAGGGGTTGCATTAAACGA 1775
.|.|||||||||..|.||||..||||||||||.||.||||||.|||..|||||.|||||..|||||.|.|..||
Sbjct 1702 ACCAACATACAGTTTCCTGATGTTTCCTTGCAGCATGTGAATCCCATAGAAAGCTCAGGAATTGCACTGAGTGA 1775
Query 1776 AAGTATTCCTCACGCTGTCTCTCAGCCTGCCATTTCTCCATCACCAAAGGCC----ATGGTCGCCAGAGTTGTT 1845
|||.||.|||||...|..|||.||.|||.|||||||.|||.||||.|| ||| ||| .|||||||.|||
Sbjct 1776 AAGCATCCCTCAGATTCCCTCACAACCTACCATTTCACCACCACCTAA-GCCTACAATG---ACCAGAGTGGTT 1845
Query 1846 TCTTCAACATGTCTCATAAGCCATCC----AGACCTTCAGGAAACTCAGCAACAAACATATCTAATCCTA---- 1911
|||||.|||..|||..|||.|||||| ||||||||||||||..|||||||.||||||.|.|||||||
Sbjct 1846 TCTTCGACACATCTGGTAAACCATCCATCTAGACCTTCAGGAAATACAGCAACGAACATACCCAATCCTATACT 1919
Query 1912 ------- 1911
Sbjct 1920 AGGAGTC 1926