Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08685
Subject:
NM_001367820.1
Aligned Length:
344
Identities:
271
Gaps:
28

Alignment

Query   1  -----------------------MATFVELSTKAKMPIVGLGTWKSP-----LGKVKEAVKVAIDAGYRHIDCA  46
                                  ......|...........|....|     ||||||||||||||.|||||||
Sbjct   1  MVLQMEPQVNSTNNFHQGPLDQPVGPLTGLKSSLLKDTTSAGPLLRPYPASLLGKVKEAVKVAIDAEYRHIDCA  74

Query  47  YVYQNEHEVGEAIQEKIQEKAVKREDLFIVSKLWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQGFKSGD  120
           |.|.|.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  75  YFYENQHEVGEAIQEKIQEKAVMREDLFIVSKVWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQGFKTGD  148

Query 121  DLFPKDDKGNAIGGKATFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFSHFQIEKLLNKPGLKYKPVTNQVECHPYLTQE  194
           |.||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  DFFPKDDKGNMISGKGTFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFNHFQIERLLNKPGLKYKPVTNQVECHPYLTQE  222

Query 195  KLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIKEIAAKHKKTAAQVLIRFHIQRNVIVIPKSVTPA  268
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 223  KLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKIKEIAAKHKKTTAQVLIRFHIQRNVTVIPKSMTPA  296

Query 269  RIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNRNWRACNVLQSSHLEDYPFDAEY  316
           .|||||||||||||||||||||||||||||......|||||.||||||
Sbjct 297  HIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNRNWRAFDFKEFSHLEDFPFDAEY  344