Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08690
- Subject:
- NR_134857.1
- Aligned Length:
- 2322
- Identities:
- 1729
- Gaps:
- 592
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA 74
Query 1 -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGA 73
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGA 148
Query 74 TCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTA 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTA 222
Query 148 TTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATG 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATG 296
Query 222 TGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAA 295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAA 370
Query 296 AGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCC 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCC 444
Query 370 CAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTAC 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTAC 518
Query 444 CATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCG 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCG 592
Query 518 ATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAAT 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAAT 666
Query 592 CCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGC 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGC 740
Query 666 AGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACT 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACT 814
Query 740 TGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTT 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTT 888
Query 814 TATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAAC 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 889 TATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAAC 962
Query 888 GGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTC 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTC 1036
Query 962 TCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTG 1035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGT- 1109
Query 1036 ACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGA 1109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 ---GATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGA 1180
Query 1110 AAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAG 1254
Query 1184 ATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAAC 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 ATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAAC 1328
Query 1258 CCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGA 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGA 1402
Query 1332 CTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCC 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 CTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCC 1476
Query 1406 GCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCA 1550
Query 1480 CAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACC 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 CAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACC 1624
Query 1554 CAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAG 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAG 1698
Query 1628 ATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATG 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 ATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATG 1772
Query 1702 AAACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATG----------------------------------------- 1734
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 AAACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATGTAATTTCCATTAAAATGGCTTTTAAAATGTCAAGTGAATTC 1846
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1847 TAGTTATCTATTCTGAGATGCCTTGCTGTTCAGAATAAATTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTT 1920
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1921 TCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAG 1994
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1995 CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATT 2068
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2069 TTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCT 2142
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2143 TGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCA 2216
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2217 GAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTCAAAA 2290
Query 1735 ---------------------------- 1734
Sbjct 2291 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2318