Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08690
- Subject:
- NR_146738.1
- Aligned Length:
- 2449
- Identities:
- 1701
- Gaps:
- 725
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA 74
Query 1 -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC--------------------------------------- 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA 148
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 149 GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC 222
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 223 TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG 296
Query 35 ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 370
Query 75 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 444
Query 149 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 518
Query 223 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 592
Query 297 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 666
Query 371 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 740
Query 445 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 814
Query 519 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCT-------------------------TCTGGGAACTGGC--TTCCAGCTGTTTG 565
||||||||||||||||||||| .|.|.|||| | ||||..||||..|
Sbjct 815 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTAGAGACAAGATCGCTATGTAGACACACCGTGAAC---CATTTCCCACTGTGGG 885
Query 566 GCTATGAGGAAAAACTGCAG-----TCCAA-----TCCTCTACAG-----------CATCTC-------TTTGA 611
.|| |.|..||..||| |||.| |.||||.|.| |||||| ||..|
Sbjct 886 CCT-----GCACCACCCCAGGGGCTTCCTAGCTTCTGCTCTTCTGGAAGTCTTCCCCATCTCCTCCCCATTCCA 954
Query 612 AGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAAC 685
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAAC 1028
Query 686 GATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATT 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 GATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATT 1102
Query 760 CGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 CGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGA 1176
Query 834 GGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTG 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 GGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTG 1250
Query 908 GGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTT 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTT 1324
Query 982 GCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAA 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 GCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAA 1398
Query 1056 GCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCT 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 GCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCT 1472
Query 1130 TTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAA 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 TTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAA 1546
Query 1204 TTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAG 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAG 1620
Query 1278 GGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATC 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATC 1694
Query 1352 GTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAG 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 GTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAG 1768
Query 1426 ACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 ACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCA 1842
Query 1500 GCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACC 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 GCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACC 1916
Query 1574 TTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCT 1990
Query 1648 GGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACC 1721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 GGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACC 2064
Query 1722 TGTATGTAG----------GATG--------------------------------------------------- 1734
||||.|| |.||
Sbjct 2065 --TATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTC 2136
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2137 CCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCT 2210
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2211 AATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTA 2284
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2285 TCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATT 2358
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2359 ATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATC 2432
Query 1735 ------- 1734
Sbjct 2433 TGAATTC 2439