Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08690
• Subject: NR_146740.1
• Aligned Length: 2518
• Identities: 1729
• Gaps: 786

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA  74

Query    1  -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC---------------------------------------  34
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct   75  CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA  148

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  149  GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC  222

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG  296

Query   35  ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  74
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  370

Query   75  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  444

Query  149  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  518

Query  223  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  592

Query  297  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  666

Query  371  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  740

Query  445  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  814

Query  519  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  888

Query  593  CTCTACAGCATCTCTTTGAA------------------------------------------------------  612
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct  889  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTCTAGAGACAAGATCGCTATGTAGACACACCGTGAACCATTTCCCACTGTGGG  962

Query  613  ----------------------------------------------------------------------GTTT  616
                                                                                  ||||
Sbjct  963  CCTGCACCACCCCAGGGGCTTCCTAGCTTCTGCTCTTCTGGAAGTCTTCCCCATCTCCTCCCCATTCCAGGTTT  1036

Query  617  ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG  1110

Query  691  GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT  1184

Query  765  TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT  1258

Query  839  TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT  912
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT  1332

Query  913  GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC  1406

Query  987  TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATT  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATT  1480

Query 1061  TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA  1554

Query 1135  GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG  1628

Query 1209  GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG  1702

Query 1283  GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT  1776

Query 1357  TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT  1850

Query 1431  TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC  1924

Query 1505  TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA  1998

Query 1579  ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC  2072

Query 1653  CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTAT  1726
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
Sbjct 2073  CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACC--TAT  2144

Query 1727  GTAG----------GATG--------------------------------------------------------  1734
            |.||          |.||                                                        
Sbjct 2145  GGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGG  2218

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2219  TTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCTAATTT  2292

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2293  TGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTATCTGT  2366

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2367  CTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATTATTCT  2440

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2441  GTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATCTGAAT  2514

Query 1735  --  1734
              
Sbjct 2515  TC  2516