Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08690
- Subject:
- NR_146750.1
- Aligned Length:
- 2635
- Identities:
- 1729
- Gaps:
- 905
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA 74
Query 1 -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC--------------------------------------- 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA 148
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 149 GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC 222
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 223 TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG 296
Query 35 ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 370
Query 75 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 444
Query 149 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 518
Query 223 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 592
Query 297 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 666
Query 371 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 740
Query 445 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 814
Query 519 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC 888
Query 593 CTCTACAGCATCTCTTTGAA------------------------------------------------------ 612
||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTCTAGAGACAAGATCGCTATGTAGACACACCGTGAACCATTTCCCACTGTGGG 962
Query 613 ----------------------------------------------------------------------GTTT 616
||||
Sbjct 963 CCTGCACCACCCCAGGGGCTTCCTAGCTTCTGCTCTTCTGGAAGTCTTCCCCATCTCCTCCCCATTCCAGGTTT 1036
Query 617 ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTG 1110
Query 691 GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGT 1184
Query 765 TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCT 1258
Query 839 TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT 912
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAAT 1332
Query 913 GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGAGATCTTGCAGC 1406
Query 987 TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACAAAAAAAGCATT 1060
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGT----GATAAAGGACAAAAAAAGCATT 1476
Query 1061 TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGA 1550
Query 1135 GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAGATTCAATTAAG 1624
Query 1209 GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 GATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCG 1698
Query 1283 GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 GGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTT 1772
Query 1357 TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 TTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTT 1846
Query 1431 TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC 1504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 TGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATC 1920
Query 1505 TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA 1578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCAGTTACCTTCTA 1994
Query 1579 ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 ACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGC 2068
Query 1653 CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTAT 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 CAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAATAACACCTGTAT 2142
Query 1727 GTAGGATG------------------------------------------------------------------ 1734
||||||||
Sbjct 2143 GTAGGATGTAATTTCCATTAAAATGGCTTTTAAAATGTCAAGTGAATTCTAGTTATCTATTCTGAGATGCCTTG 2216
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2217 CTGTTCAGAATAAATTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGT 2290
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2291 GCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA 2364
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2365 GTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTAT 2438
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2439 GTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAG 2512
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2513 AGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTC 2586
Query 1735 --------------------------------------------- 1734
Sbjct 2587 AAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC 2631