Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08690
• Subject: NR_146753.1
• Aligned Length: 2511
• Identities: 1649
• Gaps: 861

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA  74

Query    1  -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC---------------------------------------  34
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct   75  CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA  148

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  149  GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC  222

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG  296

Query   35  ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  74
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  370

Query   75  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  444

Query  149  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  518

Query  223  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  592

Query  297  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  666

Query  371  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  740

Query  445  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  518
            ||||||                                                                    
Sbjct  741  ATCATA--------------------------------------------------------------------  746

Query  519  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  592
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  ----------------GGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  804

Query  593  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA  878

Query  667  GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT  952

Query  741  GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT  1026

Query  815  ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1027  ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACG  1100

Query  889  GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT  1174

Query  963  CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA  1248

Query 1037  CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA  1322

Query 1111  AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA  1396

Query 1185  TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC  1470

Query 1259  CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC  1544

Query 1333  TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG  1618

Query 1407  CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC  1692

Query 1481  AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC  1766

Query 1555  AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA  1840

Query 1629  TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA  1914

Query 1703  AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATG------------------------------------------  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1915  AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAGGATGTAATTTCCATTAAAATGGCTTTTAAAATGTCAAGTGAATTCT  1988

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 1989  AGTTATCTATTCTGAGATGCCTTGCTGTTCAGAATAAATTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTT  2062

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2063  CGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC  2136

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2137  AATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTT  2210

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2211  TTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGCACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTT  2284

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2285  GGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCCCAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAG  2358

Query 1735  ---------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                 
Sbjct 2359  AATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATCCTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC  2427