Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08690
• Subject: XR_001743517.2
• Aligned Length: 1795
• Identities: 1234
• Gaps: 560

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCA  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGACATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCA  74

Query   36  GCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGATCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAG  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGATCACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAG  148

Query  110  AAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTATTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATT  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTATTGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATT  222

Query  184  CAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGTGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAG  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGTGATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAG  296

Query  258  GACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAAGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAAGACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAA  370

Query  332  AATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCCAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAAT  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCCAGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAAT  444

Query  406  GTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACCATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGC  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACCATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGC  518

Query  480  TTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCT  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGATTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCT  592

Query  554  TCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATCCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTT  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATCCTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTT  666

Query  628  AATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGA  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCAGCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGA  740

Query  702  TGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTC  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTTGAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTC  814

Query  776  TGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTTATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTG  888

Query  850  GAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAAT----------------------AAAAGGAACGGCTGTAGTAGATC  901
            ||||||||||||||||||||||.||||||                      |||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAGTTACCTTTTCGAATTTCTAGAAAAGGAACGGCTGTAGTAGATC  962

Query  902  TCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGA  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCTCTATGCAACCAGA  1036

Query  976  GATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACA  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGACAGATAAAGGACA  1110

Query 1050  AAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACG  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAAAGGTGCCAGCACG  1184

Query 1124  TGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAG  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGATGTTTTAAATGAG  1258

Query 1198  ATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACCCACAAGAGACTGC  1271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 1259  ATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAA------------------------------------  1296

Query 1272  AGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGACTACAAGTTCAGCT  1345
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1346  GGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCGCCTCCACAGTTTG  1419
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1420  GAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCACAGTCTGTTTCAAT  1493
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1494  TCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCCAGGCATATCGTCA  1567
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1568  GTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGATAGTCCTCCTGAA  1641
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1642  GTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGAAACTTCTTGGAAT  1715
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1716  AACACCTGTATGTAGGATG  1734
                               
Sbjct 1297  -------------------  1296