Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_08697
- Subject:
- NM_001163689.1
- Aligned Length:
- 1528
- Identities:
- 1227
- Gaps:
- 86
Alignment
Query 1 ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT 74
|||||.||..|.||||..|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||.|.|||||
Sbjct 1 ATGTTCCCGAGGGAGACCAAGTGGAACATCTCATTCGCTGGCTGCGGCTTCCTCGGGGTCTACCACATTGGCGT 74
Query 75 GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG 148
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 75 GGCCTCCTGCCTCCGTGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACTCACATCTACGGAGCCTCGGCAGGGG 148
Query 149 CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA 222
|||||||.|||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||.||.
Sbjct 149 CGCTCACCGCCACAGCGCTGGTCACTGGGGCCTGCCTGGGTGAAGCAGGTGCCAACATTATTGAGGTGTCCAAG 222
Query 223 GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT 296
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||.||||||..|.|..||.||
Sbjct 223 GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGTCCTCTGCATCCCTCCTTCAACCTGGTGAAGACCATCCGTGGCTGTCTACT 296
Query 297 GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG 370
.|||..|||||||||||||.|||||||||..||||.|||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 297 AAAGACCCTGCCTGCTGATTGCCATGAGCGCGCCAATGGACGCCTGGGCATCTCCCTGACTCGTGTTTCAGACG 370
Query 371 GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC 444
|.|||||.|||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||...||.|||
Sbjct 371 GAGAGAACGTCATCATATCCCACTTTAGCTCCAAGGATGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCACATTTATC 444
Query 445 CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT 518
||.|||||||||||.|||||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 445 CCGGTGTACTGTGGCCTCATTCCTCCTACCCTCCAAGGGGTGCGCTATGTGGATGGCGGCATTTCAGACAACTT 518
Query 519 GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA 592
||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 GCCACTTTATGAGCTGAAGAATACCATCACAGTGTCCCCATTCTCAGGCGAGAGTGACATCTGCCCTCAGGACA 592
Query 593 GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC 666
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 593 GCTCCACCAACATCCACGAGCTTCGCGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTTCGCAATCTCTACCGCCTC 666
Query 667 TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG 740
||.|||||.|||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||.||
Sbjct 667 TCGAAGGCTCTCTTCCCGCCAGAGCCCATGGTCCTCCGAGAGATGTGCAAACAGGGCTACAGAGATGGACTTCG 740
Query 741 CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC 814
.||.||...|.||||.|||||.|||||||..||||||||.||||||||..|||||||.|....||||||.|
Sbjct 741 ATTCCTTAGGAGGAATGGCCTACTGAACCAACCCAACCCTTTGCTGGCACTGCCCCCAGTTGTCCCCCAGG--- 811
Query 815 CAGAGGA--CA-AGGACCAG--GCAGT------GGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGC----TGCCG 873
.|||||| || |||| || ||.|| ||||||.||...||.|||||||.|.|.||||| |
Sbjct 812 AAGAGGATGCAGAGGA--AGCTGCTGTGGTGGAGGAGAGGGCTGGAGAGGAGGATCAATTGCAGCCTTAT---- 879
Query 874 GGAGAAGATCACATCCTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAGGCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCAC 947
.||.||||||..||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.
Sbjct 880 AGAAAAGATCGAATTCTAGAGCACCTGCCTGCCAGACTCAATGAGGCCCTGCTGGAGGCCTGTGTGGAACCAAA 953
Query 948 GGACCTGCTGACCACCCTCTCCAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGC 1021
|||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 954 GGACCTGATGACCACCCTTTCCAACATGCTACCAGTGCGCCTGGCAACGGCCATGATGGTGCCCTATACTCTGC 1027
Query 1022 CGCTGGAGAGCGCTCTGTCCTTCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGG 1095
||||||||||.||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 1028 CGCTGGAGAGTGCAGTGTCCTTCACCATCCGCTTGTTGGAGTGGCTGCCTGATGTCCCTGAAGATATCCGGTGG 1101
Query 1096 ATGAAGGAGCAGACGGGCAGCATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCC 1169
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||..||||....||.|||||
Sbjct 1102 ATGAAAGAGCAGACGGGTAGCATCTGCCAGTATCTGGTGATGAGGGCCAAGAGGAAATTGGGTGACCATCTGCC 1175
Query 1170 CTCCAGGCTGCCGGAGCAGGTGGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCT 1243
.|||||.|||.|.|||||||||||.|||||.||.|.||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||.|||
Sbjct 1176 TTCCAGACTGTCTGAGCAGGTGGAACTGCGACGTGCCCAGTCTCTGCCCTCTGTGCCACTGTCTTGCGCCACCT 1249
Query 1244 ACAGAGAGGCACTGCCCGGCTGGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGC 1317
||||.|||||.||.|||..||||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1250 ACAGTGAGGCCCTACCCAACTGGGTACGAAACAACCTCTCACTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAAGAATGC 1323
Query 1318 CAGCGCCAGCTGCTGCTCGGCCTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACC 1391
|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||||||||
Sbjct 1324 CAGCGTCAGCTACTGCTGGGTCTCTTCTGCACCAATGTGGCCTTCCCGCCGGATGCCTTGCGCATGCGCGCACC 1397
Query 1392 CGCCGACCCGGCTCCCGCCCCCGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCA-CCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTG 1464
.|||..| |||.|..||||.||.||.||..||||.|||.| ||| ||.|||||.||.||||||
Sbjct 1398 TGCCAGC------CCCACTGCCGCAGATCCTGCCACCCCACAGGATCCA-----CCTGGCCTCCCGCCTTGC-- 1458
Query 1465 AGCACCCCTGCTCCCGAGGCCCGGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTG 1512
Sbjct 1459 ------------------------------------------------ 1458