Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08712
• Subject: NM_020431.4
• Aligned Length: 2418
• Identities: 2417
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTGCCTCACCAGACGACCTGAGTACAGGGGGAAGGTTACAGAACATGACAGTGGATGAATGCTTCCAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGCCTCACCAGACGACCTGAGTACAGGGGGAAGGTTACAGAACATGACAGTGGATGAATGCTTCCAGTC  74

Query   75  TCGGAACACCGTCCTCCAGGGGCAGCCCTTTGGGGGTGTCCCCACCGTGCTGTGCCTCAACATCGCCCTGTGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGGAACACCGTCCTCCAGGGGCAGCCCTTTGGGGGTGTCCCCACCGTGCTGTGCCTCAACATCGCCCTGTGGG  148

Query  149  TGCTCGTCCTTGTGGTTTACTCCTTCCTCCGGAAAGCTGCGTGGGACTATGGGCGCCTGGCTCTGCTGATACAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTCGTCCTTGTGGTTTACTCCTTCCTCCGGAAAGCTGCGTGGGACTATGGGCGCCTGGCTCTGCTGATACAC  222

Query  223  AATGACAGCCTGACCTCGCTGATCTATGGGGAGCAGAGCGAGAAGACATCTCCCTCGGAGACTTCCTTGGAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGACAGCCTGACCTCGCTGATCTATGGGGAGCAGAGCGAGAAGACATCTCCCTCGGAGACTTCCTTGGAGAT  296

Query  297  GGAACGCAGAGACAAGGGATTCTGTTCCTGGTTCTTCAACAGCATAACAATGAAGGACGAGGATCTGATTAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACGCAGAGACAAGGGATTCTGTTCCTGGTTCTTCAACAGCATAACAATGAAGGACGAGGATCTGATTAACA  370

Query  371  AGTGTGGGGACGACGCGCGCATCTACATCGTGTTCCAGTACCACCTCATCATCTTTGTGCTCATCATCTGTATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGTGGGGACGACGCGCGCATCTACATCGTGTTCCAGTACCACCTCATCATCTTTGTGCTCATCATCTGTATC  444

Query  445  CCCTCCCTGGGCATCATTTTGCCCATCAACTATACTGGATCTGTTCTGGACTGGAGCAGTCACTTTGCTCGGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTCCCTGGGCATCATTTTGCCCATCAACTATACTGGATCTGTTCTGGACTGGAGCAGTCACTTTGCTCGGAC  518

Query  519  CACCATTGTCAATGTCTCCACAGAGAGCAAGCTCCTGTGGCTGCATAGCCTGCTGTCCTTCTTCTACTTCATCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCATTGTCAATGTCTCCACAGAGAGCAAGCTCCTGTGGCTGCATAGCCTGCTGTCCTTCTTCTACTTCATCA  592

Query  593  CCAACTTCATGTTCATGGCTCATCACTGCCTGGGGTTTGCGCCCAGGAATAGCCAAAAGGTCACAAGGACACTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACTTCATGTTCATGGCTCATCACTGCCTGGGGTTTGCACCCAGGAATAGCCAAAAGGTCACAAGGACACTA  666

Query  667  ATGATCACCTATGTGCCCAAGGACATTGAAGACCCAGAACTCATCATTAAGCATTTTCACGAGGCCTATCCAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGATCACCTATGTGCCCAAGGACATTGAAGACCCAGAACTCATCATTAAGCATTTTCACGAGGCCTATCCAGG  740

Query  741  CAGTGTCGTGACAAGAGTCCACTTCTGCTACGACGTCAGGAACCTGATCGACTTGGACGATCAGAGGCGCCATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGTCGTGACAAGAGTCCACTTCTGCTACGACGTCAGGAACCTGATCGACTTGGACGATCAGAGGCGCCATG  814

Query  815  CCATGCGGGGCCGGCTTTTCTATACAGCCAAGGCCAAGAAGACTGGGAAGGTGATGATCAGGATCCACCCCTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATGCGGGGCCGGCTTTTCTATACAGCCAAGGCCAAGAAGACTGGGAAGGTGATGATCAGGATCCACCCCTGT  888

Query  889  GCCCGCCTGTGCTTCTGCAAGTGCTGGACCTGCTTCAAGGAGGTGGATGCAGAGCAGTATTACAGCGAGCTAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCCGCCTGTGCTTCTGCAAGTGCTGGACCTGCTTCAAGGAGGTGGATGCAGAGCAGTATTACAGCGAGCTAGA  962

Query  963  GGAGCAGCTAACGGACGAGTTCAACGCCGAGCTCAACCGCGTGCCGCTCAAGCGGCTGGACCTGATCTTTGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGCAGCTAACGGACGAGTTCAACGCCGAGCTCAACCGCGTGCCGCTCAAGCGGCTGGACCTGATCTTTGTCA  1036

Query 1037  CCTTCCAGGACTCCAGGATGGCCAAGCGTGTCCGTAAGGATTACAAGTATGTCCAGTGTGGTGTGCAACCCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTCCAGGACTCCAGGATGGCCAAGCGTGTCCGTAAGGATTACAAGTATGTCCAGTGTGGTGTGCAACCCCAG  1110

Query 1111  CAGTCCTCAGTGACCACCATCGTCAAATCATATTACTGGAGGGTCACTATGGCCCCACACCCCAAAGACATTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGTCCTCAGTGACCACCATCGTCAAATCATATTACTGGAGGGTCACTATGGCCCCACACCCCAAAGACATTAT  1184

Query 1185  TTGGAAACACCTGTCTGTCCGCCGCTTCTTTTGGTGGGCCCGCTTTATCGCAATCAACACCTTCCTCTTCTTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTGGAAACACCTGTCTGTCCGCCGCTTCTTTTGGTGGGCCCGCTTTATCGCAATCAACACCTTCCTCTTCTTCC  1258

Query 1259  TCTTCTTCTTTCTCACCACGCCTGCCATCATCATGAACACTATCGACATGTACAACGTCACCCGCCCCATCGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTCTTCTTTCTCACCACGCCTGCCATCATCATGAACACTATCGACATGTACAACGTCACCCGCCCCATCGAG  1332

Query 1333  AAGCTGCAGAACCCAATTGTGACCCAGTTCTTCCCCTCTGTGATGCTCTGGGGCTTCACAGTGATACTGCCTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCTGCAGAACCCAATTGTGACCCAGTTCTTCCCCTCTGTGATGCTCTGGGGCTTCACAGTGATACTGCCTCT  1406

Query 1407  GATTGTCTACTTCTCCGCCTTCCTCGAGGCCCACTGGACCAGATCAAGTCAGAATCTGGTCATGGTGCACAAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATTGTCTACTTCTCCGCCTTCCTCGAGGCCCACTGGACCAGATCAAGTCAGAATCTGGTCATGGTGCACAAGT  1480

Query 1481  GCTACATCTTTCTGGTGTTCATGGTAGTCATTCTGCCCTCTATGGGACTGACCAGTTTGGATGTCTTTCTCCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTACATCTTTCTGGTGTTCATGGTAGTCATTCTGCCCTCTATGGGACTGACCAGTTTGGATGTCTTTCTCCGC  1554

Query 1555  TGGCTCTTTGACATCTACTATCTAGAGCAAGCATCCATCAGGTTCCAGTGTGTGTTCCTGCCAGACAACGGCGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGCTCTTTGACATCTACTATCTAGAGCAAGCATCCATCAGGTTCCAGTGTGTGTTCCTGCCAGACAACGGCGC  1628

Query 1629  CTTCTTTGTCAACTACGTGATCACGGCAGCTTTACTTGGCACAGGCATGGAGCTGCTGCGTCTGGGGTCACTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTCTTTGTCAACTACGTGATCACGGCAGCTTTACTTGGCACAGGCATGGAGCTGCTGCGTCTGGGGTCACTCT  1702

Query 1703  TCTGCTACAGCACCCGCCTCTTCTTCTCTAGATCAGAGCCAGAGAGAGTCAACATCAGAAAGAACCAGGCCATA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCTGCTACAGCACCCGCCTCTTCTTCTCTAGATCAGAGCCAGAGAGAGTCAACATCAGAAAGAACCAGGCCATA  1776

Query 1777  GACTTCCAGTTTGGGCGTGAGTATGCGTGGATGATGAACGTGTTCAGCGTGGTGATGGCGTACAGCATCACTTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACTTCCAGTTTGGGCGTGAGTATGCGTGGATGATGAACGTGTTCAGCGTGGTGATGGCGTACAGCATCACTTG  1850

Query 1851  CCCCATCATTGTGCCTTTTGGGTTGCTCTACCTGTGCATGAAGCACTTGACGGATCGCTATAACATGTACTACT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCCATCATTGTGCCTTTTGGGTTGCTCTACCTGTGCATGAAGCACTTGACGGATCGCTATAACATGTACTACT  1924

Query 1925  CCTTTGCACCCACCAAACTGAACGAGCAGATCCACATGGCTGCCGTCTCCCAGGCCATCTTTGCGCCACTCTTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTTTGCACCCACCAAACTGAACGAGCAGATCCACATGGCTGCCGTCTCCCAGGCCATCTTTGCGCCACTCTTG  1998

Query 1999  GGTCTGTTCTGGATGCTGTTCTTCTCCATCCTGCGGTTGGGTTCTCTCCACGCCATCACCATCTTTTCCCTGTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGTCTGTTCTGGATGCTGTTCTTCTCCATCCTGCGGTTGGGTTCTCTCCACGCCATCACCATCTTTTCCCTGTC  2072

Query 2073  CACCCTCCTCATTGCCATGGTGATTGCCTTTGTTGGCATTTTTCTGGGGAAGCTTCGGATGGTTGCCGACTACG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACCCTCCTCATTGCCATGGTGATTGCCTTTGTTGGCATTTTTCTGGGGAAGCTTCGGATGGTTGCCGACTACG  2146

Query 2147  AGCCCGAGGAGGAGGAGATCCAGACAGTGTTTGACATGGAGCCAAGCAGCACCTCCTCCACGCCCACCTCCCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCCGAGGAGGAGGAGATCCAGACAGTGTTTGACATGGAGCCAAGCAGCACCTCCTCCACGCCCACCTCCCTC  2220

Query 2221  CTGTATGTGGCCACCGTGCTGCAAGAACCGGAGTTGAATCTGACCCCCGCCTCCTCCCCAGCCAGGCACACCTA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGTATGTGGCCACCGTGCTGCAAGAACCGGAGTTGAATCTGACCCCCGCCTCCTCCCCAGCCAGGCACACCTA  2294

Query 2295  TGGCACCATGAACAACCAGCCGGAAGAGGGAGAAGAAGAGAGTGGTCTGAGGGGCTTTGCGAGGGAGCTAGACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGGCACCATGAACAACCAGCCGGAAGAGGGAGAAGAAGAGAGTGGTCTGAGGGGCTTTGCGAGGGAGCTAGACT  2368

Query 2369  CGGCCCAGTTCCAGGAAGGGCTGGAACTGGAGGGCCAGAACCAGTACCAC  2418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CGGCCCAGTTCCAGGAAGGGCTGGAACTGGAGGGCCAGAACCAGTACCAC  2418