Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08716
• Subject: XM_017001867.1
• Aligned Length: 1428
• Identities: 947
• Gaps: 480

Alignment

Query    1  ATGGGTCGAAAGGAAGAAGATGACTGCAGTTCCTGGAAGAAACAGACCACCAACATCCGGAAAACCTTCATTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TATGGAAGTGCTGGGATCAGGAGCTTTCTCAGAAGTTTTCCTGGTGAAGCAAAGACTGACTGGGAAGCTCTTTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTCTGAAGTGCATCAAGAAGTCACCTGCCTTCCGGGACAGCAGCCTGGAGAATGAGATTGCTGTGTTGAAAAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATCAAGCATGAAAACATTGTGACCCTGGAGGACATCTATGAGAGCACCACCCACTACTACCTGGTCATGCAGCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGTTTCTGGTGGGGAGCTCTTTGACCGGATCCTGGAGCGGGGTGTCTACACAGAGAAGGATGCCAGTCTGGTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCCAGCAGGTCTTGTCGGCAGTGAAATACCTACATGAGAATGGCATCGTCCACAGAGACTTAAAGCCCGAAAAC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CTGCTTTACCTTACCCCTGAAGAGAACTCTAAGATCATGATCACTGACTTTGGTCTGTCCAAGATGGAACAGAA  518
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGATCACTGACTTTGGTCTGTCCAAGATGGAACAGAA  38

Query  519  TGGCATCATGTCCACTGCCTGTGGGACCCCAGGCTACGTGGCTCCAGAAGTGCTGGCCCAGAAACCCTACAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  TGGCATCATGTCCACTGCCTGTGGGACCCCAGGCTACGTGGCTCCAGAAGTGCTGGCCCAGAAACCCTACAGCA  112

Query  593  AGGCTGTGGATTGCTGGTCCATCGGCGTCATCACCTACATATTGCTCTGTGGATACCCCCCGTTCTATGAAGAA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  113  AGGCTGTGGATTGCTGGTCCATCGGCGTCATCACCTACATATTGCTCTGTGGATACCCCCCATTCTATGAAGAA  186

Query  667  ACGGAGTCTAAGCTTTTCGAGAAGATCAAGGAGGGCTACTATGAGTTTGAGTCTCCATTCTGGGATGACATTTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  ACGGAGTCTAAGCTTTTCGAGAAGATCAAGGAGGGCTACTATGAGTTTGAGTCTCCATTCTGGGATGACATTTC  260

Query  741  TGAGTCAGCCAAGGACTTTATTTGCCACTTGCTTGAGAAGGATCCGAACGAGCGGTACACCTGTGAGAAGGCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  TGAGTCAGCCAAGGACTTTATTTGCCACTTGCTTGAGAAGGATCCGAACGAGCGGTACACCTGTGAGAAGGCCT  334

Query  815  TGAGTCATCCCTGGATTGACGGAAACACAGCCCTCCACCGGGACATCTACCCATCAGTCAGCCTCCAGATCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TGAGTCATCCCTGGATTGACGGAAACACAGCCCTCCACCGGGACATCTACCCATCAGTCAGCCTCCAGATCCAG  408

Query  889  AAGAACTTTGCTAAGAGCAAGTGGAGGCAAGCCTTCAACGCAGCAGCTGTGGTGCACCACATGAGGAAGCTACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  AAGAACTTTGCTAAGAGCAAGTGGAGGCAAGCCTTCAACGCAGCAGCTGTGGTGCACCACATGAGGAAGCTACA  482

Query  963  CATGAACCTGCACAGCCCGGGCGTCCGCCCAGAGGTGGAGAACAGGCCGCCTGAAACTCAAGCCTCAGAAACCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  CATGAACCTGCACAGCCCGGGCGTCCGCCCAGAGGTGGAGAACAGGCCGCCTGAAACTCAAGCCTCAGAAACCT  556

Query 1037  CTAGACCCAGCTCCCCTGAGATCACCATCACCGAGGCACCTGTCCTGGACCACAGTGTAGCACTCCCTGCCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  CTAGACCCAGCTCCCCTGAGATCACCATCACCGAGGCACCTGTCCTGGACCACAGTGTAGCACTCCCTGCCCTG  630

Query 1111  ACCCAATTACCCTGCCAGCATGGCCGCCGGCCCACTGCCCCTGGTGGCAGGTCCCTCAACTGCCTGGTCAATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  ACCCAATTACCCTGCCAGCATGGCCGCCGGCCCACTGCCCCTGGTGGCAGGTCCCTCAACTGCCTGGTCAATGG  704

Query 1185  CTCCCTCCACATCAGCAGCAGCCTGGTGCCCATGCATCAGGGGTCCCTGGCCGCCGGGCCCTGTGGCTGCTGCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  CTCCCTCCACATCAGCAGCAGCCTGGTGCCCATGCATCAGGGGTCCCTGGCCGCCGGGCCCTGTGGCTGCTGCT  778

Query 1259  CCAGCTGCCTGAACATTGGGAGCAAAGGAAAGTCCTCCTACTGCTCTGAGCCCACACTCCTCAAAAAGGCCAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  CCAGCTGCCTGAACATTGGGAGCAAAGGAAAGTCCTCCTACTGCTCTGAGCCCACACTCCTCAAAAAGGCCAAC  852

Query 1333  AAAAAACAGAACTTCAAGTCGGAGGTCATGGTACCAGTTAAAGCCAGTGGCAGCTCCCACTGCCGGGCAGGGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  AAAAAACAGAACTTCAAGTCGGAGGTCATGGTACCAGTTAAAGCCAGTGGCAGCTCCCACTGCCGGGCAGGGCA  926

Query 1407  GACTGGAGTCTGTCTCATTATG  1428
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  GACTGGAGTCTGTCTCATTATG  948