Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08733
• Subject: NM_001164597.1
• Aligned Length: 893
• Identities: 767
• Gaps: 25

Alignment

Query   1  MTDPFCV-GGRRLPGSSKSGPGKDGSRKEVRLPMLHDPPKMGMPVVRGGQTVPGQAPLCFDPGSPASDKTEGKK  73
           ||..||| |||||.|||||||||.|||||..||.|.||||.|||||..|.|||.|||||||||..|||||||||
Sbjct   1  MTESFCVGGGRRLQGSSKSGPGKGGSRKEAQLPLLQDPPKLGMPVVHSGHTVPSQAPLCFDPGNSASDKTEGKK  74

Query  74  KGRPKAENQALRDIPLSLMNDWKDEFKAHSRVKCPNSGCWLEFPSIYGLKYHYQRCQGGAISDRLAFPCPFCEA  147
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  KGRPKAENQALRDIPLSLMNQWKDEFKAHSRVKCPNSGCWLEFPSIYGLKYHYQRCQGGAISDRLAFPCPFCEA  148

Query 148  AFTSKTQLEKHRIWNHMDRPLPASKPGPISRPVTISRPVGVSKPIGVSKPVTIGKPVGVSKPIGISKPVSVGRP  221
           ||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.    
Sbjct 149  AFTSKTQLEKHRIWNHMDHPLPAPKPGPVSRPVTISRPVGVSKPIGVSKPVTVGKPVGVSKPIGISKPVT----  218

Query 222  MPVTKAIPVTRPVPVTKPVTVSRPMPVTKAMPVTKPITVTKSVPVTKPVPVTKPITVTKLVTVTKPVPVTKPVT  295
                   |.||.||||||||||||.|....||||||      |.|||||.||...|||||||.||||.||||.
Sbjct 219  --------VSRPIPVTKPVTVSRPMQVSRPVPVTKPI------PITKPVPLTKHMPVTKLVTVSKPVPLTKPVP  278

Query 296  VSRPIVVSKPVTVSRPIAISRHTPPCKMVLLTRSENKAPRATGRNSGKKRAADSLDTCPIPPKQARPENGEYGP  369
           |||||||||||.||||||||||.||||||||..||||..||||.||.|||||||||||||..||||||||.|||
Sbjct 279  VSRPIVVSKPVPVSRPIAISRHIPPCKMVLLSKSENKTLRATGKNSNKKRAADSLDTCPILSKQARPENGAYGP  352

Query 370  SSMGQSSAFQLSADTSSGSLSPGSRPSGGMEALKAAGPASPPEEDPERTKHRRKQKTPKKFTGEQPSISGTFGL  443
           |||.||..|.||.|.|      ||||..|.|||...||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353  SSMDQSVTFPLSTDPS------GSRPLMGKEALRPIGPVSQPEEDPERTKHRRKQKTPKKFTGEQPSISGTFGL  420

Query 444  KGLVKAEDKARVHRSKKQEGPGPEDARKKVPAAPITVSKEAPAPVAHPAPGGPEEQWQRAIHERGEAVCPTCNV  517
           |||.||||||||||||||||.|.|..||||.|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421  KGLAKAEDKARVHRSKKQEGSGSEEVRKKVLATPVTVSKEAPTPVAHPAPGGPEEQWQRAIHERGEAVCPTCNV  494

Query 518  VTRKTLVGLKKHMEVCQKLQDALKCQHCRKQFKSKAGLNYHTMAEHSAKPSDAEASEGGEQEERERLRKVLKQM  591
           ||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 495  VTRKTLVGLKKHMEVCHKLQEALKCQHCRKQFKSKAGLNYHTMAEHSAKPTDAEASEGGEQEERERLRKVLKQM  568

Query 592  GRLRCPQEGCGAAFSSLMGYQYHQRRCGKPPCEVDSPSFPCTHCGKTYRSKAGHDYHVRSEHTAPPPEEPTDKS  665
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 569  GRLRCPQEGCGAAFSSLMGYQYHQRRCGKPPCEVDSPSFPCTHCGKTYRSKAGHDYHVRSEHTAPPPEDPTDKI  642

Query 666  PEAEDPLGVERTPSGRVRRTSAQVAVFHLQEIAEDELARDWTKRRMKDDLVPETARLNYTRPGLPTLNPQLLEA  739
           |||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643  PEAEDLLGVERTPSGRIRRTSAQVAVFHLQEIAEDELARDWTKRRMKDDLVPETARLNYTRPGLPTLNPQLLEA  716

Query 740  WKNEVKEKGHVNCPNDCCEAIYSSVSGLKAHLASCSKGAHLAGKYRCLLCPKEFSSESGVKYHILKTHAENWFR  813
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 717  WKNEVKEKGHVNCPNDCCEAIYASVSGLKAHLASCSKGDHLVGKYRCLLCPKEFSSESGVKYHILKTHGENWFR  790

Query 814  TSADPPPKHRSQDSLVPKKEKKKNLAGGKKRGRKPKERTPEEPVAKLPPRRDDWPPGCRDKGARGSTGRKVGVS  887
           |||||..||.|||||.|.|||||.|.||||||||||||..|||..||||.|||||||.||.|.|.|||.|.|..
Sbjct 791  TSADPSSKHKSQDSLMPRKEKKKSLSGGKKRGRKPKERSSEEPASKLPPNRDDWPPGGRDRGSRSSTGKKAGAG  864

Query 888  KAPEK  892
           |||||
Sbjct 865  KAPEK  869