Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08733
• Subject: NM_020713.3
• Aligned Length: 2676
• Identities: 2672
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCGGCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAG  74
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Sbjct    1  ATGACGGATCCTTTCTGCGTTGGAGGCCGTCGGCTCCCGGGGTCCAGCAAGAGTGGTCCCGGGAAGGATGGCAG  74

Query   75  CCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATGACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGA  148
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Sbjct   75  CCGAAAGGAGGTCCGACTTCCAATGCTGCATGACCCACCGAAGATGGGGATGCCGGTGGTCCGTGGTGGACAGA  148

Query  149  CAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGACCCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAG  222
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Sbjct  149  CAGTGCCCGGCCAGGCCCCTCTCTGCTTTGACCCGGGAAGTCCAGCCAGTGACAAGACAGAAGGGAAGAAAAAG  222

Query  223  GGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCGAGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTT  296
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Sbjct  223  GGGCGGCCAAAAGCCGAGAACCAGGCCCTCCGAGACATTCCTCTCTCCCTGATGAACGACTGGAAGGATGAGTT  296

Query  297  CAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACTCAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGT  370
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Sbjct  297  CAAGGCACACTCGAGGGTGAAGTGTCCAAACTCAGGGTGCTGGCTGGAGTTCCCCAGCATCTACGGGCTCAAGT  370

Query  371  ACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATCTCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCA  444
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Sbjct  371  ACCATTACCAGCGGTGCCAAGGGGGTGCCATCTCAGATCGCCTGGCCTTCCCCTGCCCCTTCTGCGAGGCCGCA  444

Query  445  TTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCGGATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCC  518
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Sbjct  445  TTCACCTCTAAGACCCAGCTGGAGAAACACCGGATCTGGAACCACATGGACCGACCCCTGCCTGCCTCCAAGCC  518

Query  519  TGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCCGGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTG  592
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Sbjct  519  TGGGCCCATCAGCAGGCCGGTCACCATCAGCCGGCCTGTTGGGGTCAGCAAGCCCATCGGAGTGAGCAAACCTG  592

Query  593  TCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAACCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCAATG  666
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Sbjct  593  TCACTATTGGCAAACCTGTGGGTGTCAGCAAACCCATTGGCATCAGCAAGCCAGTCTCGGTCGGCAGACCCATG  666

Query  667  CCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCCCGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCC  740
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Sbjct  667  CCAGTCACCAAGGCCATCCCGGTCACTAGGCCCGTGCCAGTCACCAAACCTGTCACAGTCAGCAGGCCCATGCC  740

Query  741  CGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCATCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTG  814
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Sbjct  741  CGTCACCAAGGCCATGCCGGTCACCAAACCCATCACAGTCACCAAGTCTGTGCCGGTCACCAAACCCGTACCTG  814

Query  815  TCACCAAACCCATTACGGTCACAAAGCTTGTGACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTC  888
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Sbjct  815  TCACCAAACCCATTACGGTAACAAAGCTTGTGACAGTTACGAAACCCGTGCCGGTCACCAAGCCAGTGACAGTC  888

Query  889  AGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTG  962
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Sbjct  889  AGCAGGCCCATTGTGGTCAGCAAGCCGGTGACAGTCAGCAGGCCCATTGCTATCAGCAGACACACACCGCCCTG  962

Query  963  CAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACAAAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGG  1036
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Sbjct  963  CAAAATGGTGCTGCTGACCAGGTCGGAGAACAAAGCACCTCGTGCCACAGGGAGGAACAGTGGTAAGAAAAGGG  1036

Query 1037  CTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCACCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCC  1110
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Sbjct 1037  CTGCGGACAGCCTGGACACCTGCCCAATTCCACCCAAGCAGGCCAGGCCAGAGAATGGGGAGTACGGCCCCTCC  1110

Query 1111  TCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAGTGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCC  1184
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Sbjct 1111  TCCATGGGCCAGAGCTCGGCCTTCCAGCTGAGTGCAGACACCAGCAGTGGCTCCTTGTCGCCAGGCAGCAGGCC  1184

Query 1185  GTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAGGCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGC  1258
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Sbjct 1185  GTCAGGGGGCATGGAGGCACTGAAGGCTGCAGGCCCTGCGTCCCCGCCTGAGGAGGACCCGGAGCGCACAAAGC  1258

Query 1259  ACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTTACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAA  1332
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Sbjct 1259  ACAGAAGGAAACAGAAAACACCCAAAAAGTTTACAGGGGAGCAGCCATCCATCTCAGGGACCTTTGGGCTCAAA  1332

Query 1333  GGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGTTCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGC  1406
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Sbjct 1333  GGCCTGGTCAAAGCTGAGGACAAGGCCCGAGTTCACCGCTCCAAGAAGCAGGAGGGGCCAGGCCCTGAGGACGC  1406

Query 1407  CCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCAATCACTGTCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAG  1480
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Sbjct 1407  CCGGAAGAAGGTGCCAGCTGCCCCCATCACTGTCAGCAAGGAGGCACCGGCCCCTGTGGCCCACCCAGCTCCAG  1480

Query 1481  GTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATCCATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTC  1554
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Sbjct 1481  GTGGCCCTGAAGAGCAGTGGCAGAGGGCCATCCATGAGCGCGGGGAAGCCGTCTGCCCCACCTGCAACGTGGTC  1554

Query 1555  ACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTCAAGAAGCACATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCA  1628
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Sbjct 1555  ACCCGGAAGACTCTCGTGGGGCTTAAGAAGCACATGGAGGTGTGTCAGAAGCTTCAGGATGCACTCAAGTGCCA  1628

Query 1629  GCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCGGCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCT  1702
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Sbjct 1629  GCACTGCCGGAAGCAGTTCAAGTCCAAAGCCGGCCTCAACTACCACACTATGGCCGAGCACAGTGCCAAGCCCT  1702

Query 1703  CTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAGGAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA  1776
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Sbjct 1703  CTGACGCCGAGGCCTCCGAAGGGGGCGAGCAGGAGGAGCGCGAGAGGCTGCGCAAGGTGCTGAAGCAGATGGGA  1776

Query 1777  CGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCG  1850
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Sbjct 1777  CGGCTGCGCTGCCCCCAGGAGGGTTGCGGGGCTGCCTTCTCCAGCCTCATGGGCTACCAGTACCACCAGCGGCG  1850

Query 1851  CTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCCCCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCA  1924
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Sbjct 1851  CTGCGGGAAGCCGCCCTGCGAGGTGGACAGCCCCTCCTTCCCCTGCACCCACTGTGGCAAGACGTACCGATCCA  1924

Query 1925  AGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAGCACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCT  1998
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Sbjct 1925  AGGCTGGCCACGACTACCACGTGCGCTCGGAGCACACGGCCCCCCCCCCTGAGGAGCCCACAGACAAGTCCCCT  1998

Query 1999  GAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGACCCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGT  2072
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Sbjct 1999  GAGGCTGAGGACCCGCTGGGTGTGGAGCGGACCCCAAGCGGGCGTGTCCGCCGCACGTCGGCCCAGGTGGCGGT  2072

Query 2073  GTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGCTGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTG  2146
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Sbjct 2073  GTTCCACCTGCAGGAGATAGCGGAGGACGAGCTGGCCCGCGACTGGACCAAGCGGCGCATGAAGGATGACCTTG  2146

Query 2147  TGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGACCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGG  2220
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Sbjct 2147  TGCCCGAGACCGCACGGCTCAACTACACTCGACCAGGGCTCCCCACGCTGAACCCCCAGCTGCTAGAGGCATGG  2220

Query 2221  AAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAACTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTC  2294
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Sbjct 2221  AAGAATGAAGTGAAGGAGAAAGGCCACGTCAACTGTCCCAACGACTGCTGTGAAGCCATCTACTCCAGCGTGTC  2294

Query 2295  CGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTAAGGGGGCCCACCTGGCAGGGAAGTACCGCTGTCTGCTGTGTC  2368
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Sbjct 2295  CGGACTCAAGGCTCATCTCGCCAGCTGCAGTAAGGGGGCCCACCTGGCAGGGAAGTACCGCTGTCTGCTGTGTC  2368

Query 2369  CGAAGGAGTTCAGTTCTGAGAGTGGCGTCAAATACCACATCCTGAAGACCCACGCAGAGAACTGGTTCCGAACA  2442
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Sbjct 2369  CGAAGGAGTTCAGTTCTGAGAGTGGCGTCAAATACCACATCCTGAAGACCCACGCAGAGAACTGGTTCCGAACA  2442

Query 2443  TCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCAGGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAAAGAAGAAAAATCTGGC  2516
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Sbjct 2443  TCAGCAGACCCACCTCCCAAACACAGGAGCCAGGACTCATTGGTGCCCAAGAAGGAAAAGAAGAAAAATCTGGC  2516

Query 2517  AGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGGAGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCCAAGCTGCCCCCGCGCC  2590
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Sbjct 2517  AGGTGGAAAGAAGCGGGGCCGAAAGCCCAAGGAGCGGACCCCAGAGGAGCCTGTGGCCAAGCTGCCCCCGCGCC  2590

Query 2591  GGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAGGGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAAGGTGGGAGTCAGCAAG  2664
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Sbjct 2591  GGGACGACTGGCCTCCAGGATGCAGAGACAAGGGGGCCCGGGGCTCCACCGGCCGGAAGGTGGGAGTCAGCAAG  2664

Query 2665  GCGCCTGAAAAG  2676
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Sbjct 2665  GCGCCTGAAAAG  2676